Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-27K13.1	Gene	0	2.70	0.90	0.92	8.46	1.54	1.62	2.96	1.64	1.61	1.14	1.31	0.97	1.05	0.51	1.54	1.27	1.13	0.50	0.75	1.31	1.68	1.13	1.04	0.90	1.57	0.99	5.33	0.73	0.79
2	445523	Transcript	0	2.08	0.70	0.48	6.79	1.64	0.67	3.59	1.72	3.28	1.44	0.93	0.71	1.07	0.29	1.53	1.30	0.64	0.40	1.00	1.73	2.35	1.49	0.96	0.28	0.54	2.48	1.97	0.76	0.49
3	421254	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.42	2.56	0.30	2.74	0.00	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	7.41	2.78	2.10	30.68	10.55	2.38	19.17	9.52	4.36	2.50	2.06	2.40	3.59	0.98	5.98	1.07	1.29	1.67	4.14	4.48	5.55	5.45	3.91	0.00	0.62	8.56	1.58	2.82	1.16
5	E1_Da	NovelBoundary	0	2.18	0.00	2.84	8.20	0.00	3.07	4.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.14	2.29	1.29
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00
7	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	2.24	6.07	0.00
8	ER2a	ExonRegion	0	2.60	1.68	0.05	11.06	0.00	0.83	3.12	0.58	4.21	3.72	0.21	0.94	2.39	0.00	4.73	1.21	0.84	0.00	1.94	1.94	1.30	1.64	1.65	0.65	1.74	0.66	1.33	1.48	1.22
9	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.23	11.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.71	0.00
10	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.20	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.82	0.95	0.00	0.00	4.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E2a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	2.06	0.00	0.00	0.00
12	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix	Intron	0	1.02	1.75	0.79	1.83	0.71	2.51	0.74	0.81	1.41	5.38	2.22	0.34	0.81	2.18	0.51	5.70	2.51	1.00	0.93	1.01	1.82	1.78	0.46	5.34	5.07	2.07	2.94	0.36	3.59
14	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.69	1.10	0.00	0.00	0.11	0.89	0.00	2.08	0.86	2.68	0.38	0.00	1.47	1.74	0.00	4.52	1.16	0.50	1.03	2.67	1.84	0.66	0.00	5.45	2.48	0.84	1.77	0.47	3.35
15	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.76	2.78	0.96	1.03	2.35	3.00	0.00	0.00	1.76	7.05	4.19	0.40	0.74	2.86	0.66	6.56	3.61	0.94	0.92	0.79	1.02	2.00	0.00	4.65	7.01	2.19	2.79	0.75	2.54
16	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.74	0.66	0.58	2.03	0.66	0.47	0.57	0.00	0.84	5.24	1.10	0.60	0.37	1.84	1.31	2.12	1.78	0.55	0.00	0.00	0.71	0.00	0.48	3.13	4.49	3.40	0.71	0.00	1.10
17	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	2.43	0.87	2.59	0.00	1.44	2.30	0.00	1.52	3.11	1.36	0.31	0.33	0.64	0.00	3.95	1.89	1.45	0.00	0.00	1.96	0.53	0.48	3.12	5.98	2.51	5.46	0.00	3.16
18	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.29	1.45	1.43	3.84	0.00	5.24	1.35	1.38	1.80	7.57	2.98	0.46	0.78	3.00	0.69	8.85	3.37	1.50	1.92	0.83	3.17	4.29	1.36	8.49	5.19	2.13	3.90	0.25	6.51
19	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	1.06	0.00	0.00	0.00	0.83	1.44	0.61	0.80	0.00	0.00
20	E3a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.67	0.00	4.67	0.00	0.00
21	ER4a	ExonRegion	0	3.41	0.00	0.38	0.03	0.00	0.65	1.34	0.42	1.44	1.16	3.65	0.70	0.59	0.72	0.00	2.50	0.73	0.44	0.73	1.03	1.17	1.15	0.00	0.49	0.00	0.23	2.09	0.37	0.31
22	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.10	2.04	0.00	0.00	0.00	5.41	4.97	0.00	0.00
23	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.76	2.46	0.00	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	0.00	2.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER5a	ExonRegion	0	4.55	1.68	1.59	12.80	2.03	3.86	2.92	1.36	1.69	1.00	1.98	1.09	0.67	0.96	3.06	2.36	2.29	0.20	0.67	1.75	2.17	1.92	0.75	1.57	2.72	0.88	12.76	0.46	1.02
25	E5_Da	KnownBoundary	0	5.54	0.00	1.00	8.41	0.00	3.61	0.00	5.08	4.84	1.80	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	3.44	4.68	0.00	0.00	4.13	1.64	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	10.93	4.22	1.49
26	ER5b	ExonRegion	0	1.16	0.40	0.82	5.76	0.92	0.86	1.52	1.49	0.88	0.66	0.60	0.92	0.93	0.30	0.00	0.52	0.68	0.72	0.20	0.58	1.32	0.11	1.13	0.81	1.44	0.30	3.85	0.64	0.77