Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP5-1073O3.2	Gene	0	1.58	0.77	0.99	2.64	0.51	1.37	1.66	1.58	1.66	1.65	0.44	1.25	0.57	1.13	4.98	2.02	2.48	2.93	3.36	1.08	1.43	0.73	0.60	1.09	1.58	1.40	0.83	1.83	1.80
2	441071	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.65	3.78	3.47	0.37	0.26	0.64	0.43	0.00	0.35	0.00	0.00	1.05	1.54	0.00	0.00	0.00	0.49	0.65	0.00	1.56	0.28	0.25	1.07	2.21
3	450706	Transcript	0	0.54	1.11	0.51	0.53	0.16	0.48	0.24	0.47	0.68	0.94	0.18	0.37	0.45	0.45	2.01	0.62	0.85	1.72	1.80	0.58	0.57	0.33	0.20	0.43	0.51	0.72	0.12	0.66	0.32
4	426237	Transcript	0	1.76	0.00	0.31	0.43	0.00	1.11	1.23	0.15	0.53	0.00	0.07	0.71	0.00	0.07	0.28	0.41	0.18	0.00	0.19	0.33	0.17	0.11	0.22	0.00	0.33	0.00	0.05	0.59	1.52
5	427953	Transcript	0	0.49	0.00	0.94	4.18	0.00	0.62	1.94	0.37	0.98	0.70	0.00	0.70	0.00	1.00	0.89	1.38	1.76	0.01	0.26	0.45	1.04	0.00	0.76	0.00	0.46	0.51	1.78	0.35	1.08
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.94	5.78	2.90	1.12	0.78	1.91	1.30	0.00	0.12	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	1.96	0.00	4.69	0.85	0.75	1.36	0.88
7	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.87	2.92	5.08	1.43	2.00	4.59	1.87	1.34	0.00	0.00	0.00	2.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.58	0.00	1.74	2.15	2.53	0.00	0.00
8	E1_Ac	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.44	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00	0.00	0.00	3.37
9	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.12	6.78	6.69	1.12	1.44	3.57	3.26	0.00	0.91	5.09	0.00	2.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	3.45	0.00	0.52	1.57	1.83	0.00	4.03
10	E1_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1a_E1e	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.55	7.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	1.31	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	5.74
12	ER1c	ExonRegion	0	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	4.22	7.93	9.21	0.30	0.67	1.75	3.71	0.00	2.12	5.60	0.00	3.01	1.09	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.73	1.83	0.43	5.28
13	E1_Db	KnownBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.15	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E1b_E1e	KnownJunction	0	2.60	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	2.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49
15	ER1d	ExonRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	6.05	7.06	0.00	0.00	0.00	3.50	0.00	2.72	5.60	0.00	3.01	2.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	5.37
16	ER1e	ExonRegion	0	3.78	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	2.02	0.00	0.20	0.00	0.00	1.31	0.00	1.81	3.62	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34
17	ER1f	ExonRegion	0	1.32	0.00	0.81	3.90	0.49	0.28	1.24	0.80	0.44	0.44	0.00	0.76	0.00	0.76	3.14	0.65	4.05	0.19	3.54	0.28	0.86	0.36	0.00	1.08	1.01	0.16	0.00	0.82	2.09
18	E1_Dc	KnownBoundary	0	6.67	0.00	0.00	10.78	0.00	0.00	0.00	2.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.37	0.00	3.82	4.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E1c_E1e	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER1g	ExonRegion	0	0.49	0.00	0.94	4.18	0.00	0.62	1.94	0.37	0.98	0.70	0.00	0.70	0.00	1.00	0.89	1.38	1.76	0.01	0.26	0.45	1.04	0.00	0.76	0.00	0.46	0.51	1.78	0.35	1.08
21	E1_Ae	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.54	10.78	0.00	1.65	0.00	2.54	1.25	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	0.00	0.00	2.25	0.00	8.09	0.00	2.05	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00
22	ER1h	ExonRegion	0	2.20	1.57	2.32	2.54	1.73	3.45	5.68	5.70	1.23	1.53	0.84	2.34	0.00	1.99	6.46	5.87	2.49	0.44	1.70	0.00	2.78	1.28	0.26	0.00	3.44	1.11	2.96	2.01	5.65
23	E1_Dd	KnownBoundary	0	5.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	2.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	4.17	0.00	1.55
24	E1d_E1f	KnownJunction	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E1d_E3a	KnownJunction	0	7.49	0.00	1.17	0.00	0.00	1.96	0.00	10.15	0.00	0.00	0.00	1.27	0.00	0.86	16.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	2.05
26	ER1i	ExonRegion	0	0.92	0.01	0.62	0.87	0.00	0.42	0.00	0.30	1.07	0.00	0.14	1.42	0.00	0.13	0.56	0.82	0.36	0.00	0.39	0.67	0.34	0.22	0.44	0.00	0.66	0.00	0.10	1.18	1.55
27	E1_Af	KnownBoundary	0	0.00	0.00	2.59	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42
28	ER1j	ExonRegion	0	0.00	1.41	1.32	0.47	0.00	1.16	0.60	0.75	0.80	0.00	0.00	0.09	0.00	0.65	0.00	0.68	0.99	0.39	0.00	0.00	0.39	0.00	0.49	2.67	0.16	0.00	0.00	2.67	1.41
29	E1_De	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.27	9.27	0.00	1.96	0.00	4.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.93	1.93	0.00	0.00	0.00	1.65
30	ER1k	ExonRegion	0	3.22	1.81	1.09	3.16	0.96	2.27	1.44	2.83	4.06	5.00	1.09	2.25	1.52	2.27	12.06	3.72	3.76	10.33	9.38	2.27	3.45	2.00	1.17	2.59	3.04	4.30	0.72	3.94	1.91
31	E1_Df	NovelBoundary	0	6.02	0.00	0.00	0.00	0.00	3.45	0.00	2.14	0.00	0.00	0.00	1.20	2.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E1f_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	7.37	0.00	5.49	0.00	0.00	0.00	0.00	1.23	0.00	1.09	0.00	0.00	2.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	4.49	0.00
34	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	1.16	0.41	0.00	0.00	1.34	0.00	1.43	1.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	3.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	2.02	0.00	0.00	0.00
36	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.18	0.24	0.00	0.32	0.00	0.40	0.00	0.55	0.64	4.76	2.62	2.13	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	1.63	0.00	5.74	0.93	0.80
38	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	11.20	0.00	3.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	2.45	1.26
39	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.27	1.40	0.00	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	2.67	0.00	1.21	0.00	2.43	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	1.09	0.00	0.00	1.90	0.00
40	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.77	3.60	1.35	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	20.28	0.00	0.00
41	ER3a	ExonRegion	0	1.41	0.99	1.23	3.30	0.75	1.99	2.78	1.07	0.77	0.22	0.18	0.34	0.99	0.58	5.40	2.67	1.82	0.59	0.00	2.00	0.22	0.00	0.28	0.33	1.41	0.72	2.25	1.01	1.20
42	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00