Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP4-714D9.1	Gene	0	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.65	0.00
2	432294	Transcript	0	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.79	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	31.09	75.72	0.00	49.18	33.90	38.29	20.48	11.69	83.47	13.78	13.98	23.55	70.73	24.62	34.88	41.39	19.99	52.27	178.03	56.73	54.19	24.99	25.95	48.99	12.77	10.51	34.29	1.75	25.88
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	I1	Intron	0	0.00	3.32	0.00	0.00	2.71	0.76	0.56	0.51	2.64	0.00	0.33	0.34	0.00	0.00	1.28	1.68	1.24	0.00	1.77	2.29	0.00	0.50	0.00	0.60	0.00	0.00	1.02	0.90	0.00
7	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.34	0.00	0.00	2.72	0.77	0.56	0.51	2.65	0.00	0.33	0.34	0.00	0.00	1.29	1.69	1.25	0.00	1.78	2.30	0.00	0.50	0.00	0.60	0.00	0.00	1.02	0.91	0.00
8	Ix	Intron	0	1.17	4.87	0.58	3.21	2.18	4.24	1.80	0.73	2.01	3.52	1.54	0.86	0.74	3.93	4.43	2.49	5.34	3.54	6.51	2.86	2.91	0.00	0.27	1.71	1.85	0.55	2.46	0.81	0.63
9	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.25	5.19	0.62	2.79	2.13	4.19	1.92	0.78	2.08	3.68	1.42	0.91	0.79	4.12	4.72	2.65	5.59	3.60	6.64	2.45	3.09	0.00	0.29	1.82	1.97	0.49	2.62	0.79	0.67
10	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	11.10	3.41	5.70	0.00	0.00	1.02	1.20	3.70	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00	1.69	3.13	4.69	10.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	1.21	0.00
11	Ix	Intron	0	16.72	17.00	4.40	10.17	3.71	9.89	6.53	4.85	13.31	8.41	5.73	7.25	2.30	11.63	10.14	12.79	10.51	16.86	17.47	4.63	7.95	1.19	1.19	6.54	6.95	2.23	5.75	5.04	2.50
12	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	16.33	15.60	4.62	8.87	3.43	7.95	7.00	2.73	12.68	8.24	5.96	6.60	1.60	8.45	13.43	13.54	5.93	13.08	23.07	2.97	5.50	1.79	1.79	4.53	5.55	2.18	10.75	2.80	2.14
13	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	19.48	17.77	5.16	11.93	3.73	10.02	6.52	6.29	15.40	9.39	6.07	8.52	2.94	14.42	9.20	13.11	13.01	18.81	17.98	5.43	7.89	1.29	1.29	7.85	8.24	2.62	4.55	6.57	2.91
14	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	6.26	16.21	1.11	4.89	4.11	12.26	6.17	1.83	5.88	4.81	4.17	3.05	0.64	4.63	10.00	10.83	6.55	14.37	8.46	3.69	11.69	0.00	0.00	3.97	3.68	0.74	4.25	1.81	1.38
15	Ix	Intron	0	4.86	5.14	1.27	3.42	1.51	6.45	2.13	0.81	5.79	6.27	2.70	3.41	1.96	5.97	5.68	6.82	10.45	5.58	6.80	2.20	4.49	0.81	0.86	3.13	2.75	1.52	2.24	1.79	0.91
16	Ix_AR8	ActiveIntronRegion	0	3.30	7.89	0.51	1.47	0.50	5.78	2.07	0.00	2.13	5.34	1.95	3.35	1.53	4.31	1.42	8.40	8.88	8.50	9.83	1.62	4.10	0.00	0.37	1.77	2.93	0.65	1.32	0.17	0.28
17	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	1.25	0.00	7.66	0.00	2.49	0.48	0.00	0.59	1.03	0.00	1.30	0.00	1.99	0.00	5.06	0.43	1.95	0.00	0.00	6.32	0.00	0.00	2.36	1.57	2.32	2.79	1.32	0.00
18	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	2.65	5.87	0.62	7.47	0.60	9.91	1.47	0.00	5.38	7.57	2.06	4.24	1.20	5.75	6.39	7.58	6.71	4.92	10.35	1.36	7.48	0.19	1.12	3.34	1.86	1.63	3.03	2.72	1.74
19	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00	4.99	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.78	0.00	3.39	0.00	4.12	1.60	0.81	4.86	0.00	2.11	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.44	0.00
20	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	5.47	4.86	1.45	2.82	1.15	4.75	1.43	0.94	2.80	5.11	2.34	2.33	1.14	5.38	4.05	6.28	6.75	4.57	5.15	2.10	3.42	0.36	0.64	1.77	2.19	0.93	1.80	2.18	1.05
21	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	5.15	4.86	2.30	4.92	4.36	7.65	4.57	1.64	9.58	8.52	3.27	6.57	1.20	9.91	7.07	8.86	21.21	7.10	7.46	3.49	4.99	2.72	1.12	5.02	3.92	3.24	3.52	1.91	0.32
22	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	7.02	5.44	1.45	1.36	0.82	8.23	2.52	1.23	12.40	8.25	4.18	2.29	5.25	5.49	11.82	5.33	12.46	6.08	7.90	1.91	5.05	0.92	0.89	4.89	4.41	1.94	2.61	2.40	1.96
23	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	8.77	5.48	0.63	0.00	0.46	8.88	0.72	0.80	12.36	6.70	3.07	1.82	5.46	4.50	12.91	7.31	8.44	2.61	2.76	0.67	6.03	1.22	3.77	3.77	2.19	2.73	2.37	1.04	0.86
24	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.78	1.77	0.31	5.32	0.91	3.82	0.37	0.00	2.80	2.95	2.87	2.52	2.40	4.20	2.73	3.68	6.92	3.57	2.96	3.29	3.17	0.00	0.67	3.59	0.80	0.00	1.02	0.30	0.00
25	Ix	Intron	0	2.71	3.50	0.12	0.00	1.03	2.22	0.71	0.00	3.20	3.05	2.26	0.91	1.32	2.00	2.19	2.05	4.41	2.08	5.62	1.11	2.91	0.13	0.38	2.42	1.81	0.55	4.25	1.26	1.03
26	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.73	3.51	0.12	0.00	1.03	2.23	0.71	0.00	3.21	3.06	2.27	0.91	1.33	2.01	2.20	2.05	4.43	2.09	5.64	1.11	2.92	0.13	0.38	2.43	1.82	0.56	4.27	1.27	1.04
27	Ix	Intron	0	0.00	2.37	0.31	0.00	0.90	1.27	0.37	0.34	1.03	1.33	0.88	1.36	2.14	1.66	7.76	1.70	3.85	0.71	1.76	0.00	5.52	0.33	0.00	1.58	0.26	0.29	0.00	0.00	0.00
28	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	2.39	0.31	0.00	0.91	1.27	0.37	0.34	1.04	1.34	0.88	1.37	2.16	1.68	7.82	1.71	3.88	0.71	1.76	0.00	5.56	0.33	0.00	1.60	0.27	0.29	0.00	0.00	0.00
29	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	7.56	0.00	0.00	0.00	0.00	2.86	0.00	2.86	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.34	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER2a	ExonRegion	0	0.00	1.29	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00	0.00	0.00	2.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	2.37	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	2.71	0.00