Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-356N1.2	Gene	0	40.97	12.44	5.51	0.00	0.80	1.36	22.91	0.91	5.82	18.44	39.71	4.52	2.67	46.66	0.00	28.35	121.40	0.32	151.09	0.45	1.53	27.92	1.19	4.25	9.89	113.43	8.15	1.48	16.03
2	438318	Transcript	0	30.61	8.93	2.06	0.00	0.23	0.54	17.53	0.78	4.95	13.04	32.09	3.87	2.11	35.75	0.00	21.41	93.72	0.30	107.71	0.28	1.37	21.84	1.72	2.61	6.71	98.33	9.27	2.05	16.67
3	ER1a	ExonRegion	0	10.34	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	2.93	0.24	4.02	3.94	3.57	1.78	0.61	8.43	0.00	6.74	6.53	0.00	35.77	0.00	1.47	8.23	0.00	0.45	2.44	28.37	0.00	0.00	13.92
4	E1_Da	NovelBoundary	0	6.02	0.00	0.00	0.00	14.44	0.00	0.00	0.00	0.00	3.99	0.00	0.00	0.00	4.52	0.00	3.29	0.00	0.00	16.18	0.00	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	20.43	0.00	0.00	1.98
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	19.70	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	1.94	1.55	1.96	8.54	1.87	1.91	21.29	0.00	6.73	19.45	0.00	48.55	0.00	1.93	17.65	0.00	2.57	0.00	17.42	0.00	0.00	19.28
6	E1a_E3a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.86	0.00	6.06	1.96	1.33	0.00	0.00	4.01	0.00	7.19	11.95	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	0.00	7.04	2.04	3.46	0.00
7	Ix	Intron	0	10.86	2.04	0.00	0.00	1.55	0.44	1.28	0.00	1.60	5.03	0.75	1.76	0.00	1.72	0.00	3.93	17.97	0.00	6.07	0.00	1.36	0.00	0.00	1.36	0.00	1.49	4.64	0.00	2.33
8	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	15.92	3.17	0.00	0.00	2.80	0.79	0.72	0.00	1.62	5.99	1.18	2.54	0.00	1.38	0.00	5.40	21.77	0.00	7.07	0.00	2.05	0.00	0.00	2.47	0.00	1.36	2.76	0.00	2.44
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.75	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	1.62	3.96	0.24	0.81	0.00	2.22	0.00	2.17	13.65	0.00	4.98	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	0.00	1.71	7.17	0.00	2.26
10	I1	Intron	0	3.74	2.47	0.46	0.08	0.26	0.25	0.53	0.16	1.05	4.18	0.91	0.82	0.09	2.15	0.02	1.04	11.43	0.04	7.73	0.05	0.67	0.21	0.00	0.34	0.78	2.70	0.28	0.17	0.54
11	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	3.74	2.47	0.46	0.08	0.26	0.25	0.53	0.16	1.05	4.19	0.91	0.82	0.09	2.15	0.02	1.04	11.43	0.04	7.73	0.05	0.67	0.21	0.00	0.34	0.78	2.70	0.28	0.17	0.54
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	10.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.41	0.00	0.00	26.36	0.00	16.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	3.33
13	ER2a	ExonRegion	0	48.79	11.41	0.25	0.00	0.00	1.07	35.91	0.60	3.58	22.17	63.26	6.12	1.63	51.09	0.00	30.48	140.88	1.50	171.12	1.07	2.08	39.72	2.69	5.65	7.41	159.50	10.95	3.30	18.78
14	E2_Da	NovelBoundary	0	5.19	0.00	0.00	0.00	0.00	3.91	0.00	0.00	4.60	10.79	0.00	0.00	0.00	4.56	0.00	3.82	18.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	36.18	0.00	0.00	0.00
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	31.20	12.89	2.12	0.00	0.00	0.00	24.43	0.00	8.83	17.74	47.33	5.18	3.12	47.08	0.00	32.28	169.63	0.00	121.39	0.00	0.00	16.43	5.02	0.00	11.93	174.70	26.94	5.84	15.88
16	I2	Intron	0	2.73	3.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	2.76	0.00	0.39	0.00	0.58	0.00	0.79	3.81	0.00	9.16	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00
17	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	2.75	3.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.65	0.00	0.00	2.78	0.00	0.40	0.00	0.58	0.00	0.80	3.82	0.00	9.22	0.00	0.00	0.00	0.00	1.38	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	10.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.71	7.19	0.00	0.00	0.00	2.90	0.00	7.11	20.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00
19	ER3a	ExonRegion	0	43.03	14.40	7.93	0.00	1.17	1.65	21.82	1.10	6.78	19.40	37.73	4.43	3.29	50.87	0.00	30.84	132.12	0.00	161.71	0.33	1.37	27.16	0.90	4.38	11.74	111.65	8.47	1.13	15.50
20	IG46	Intergenic	0	1.01	1.47	0.12	0.06	0.16	0.16	0.75	0.02	0.56	2.97	2.69	0.64	0.03	2.47	0.09	2.12	18.52	0.03	14.13	0.02	0.13	0.24	0.05	0.46	0.81	3.10	0.17	0.25	0.14
21	IG46_SR1	SilentIntergenicRegion	0	2.18	2.24	0.26	0.00	0.05	0.24	1.11	0.02	1.17	4.36	7.42	0.84	0.08	5.35	0.00	4.31	40.54	0.06	26.63	0.00	0.26	0.63	0.04	0.71	0.79	5.54	0.41	0.16	0.29
22	IG46_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	1.65	0.65	0.38	0.00	0.00	0.80	0.24	0.43	0.92	6.04	15.06	1.62	0.23	6.70	0.00	11.25	68.57	0.00	28.12	0.00	0.00	0.72	0.00	1.26	1.34	7.62	0.00	0.19	0.00
23	IG46_SR2	SilentIntergenicRegion	0	1.11	2.17	0.10	0.15	0.27	0.21	0.71	0.04	0.70	3.08	3.58	0.85	0.04	3.29	0.09	3.22	28.17	0.03	16.87	0.05	0.15	0.27	0.04	0.50	0.88	4.31	0.28	0.24	0.15
24	IG46_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.05	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.90	0.55	0.14	0.00	0.55	0.00	0.00	4.81	0.00	5.84	0.00	0.23	0.00	0.00	0.25	0.28	0.96	0.00	0.00	0.00
25	IG46_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.01	0.00	4.53	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	0.00	0.00	0.00
26	IG46_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.64	0.81	0.00	0.00	0.10	0.00	0.39	0.00	0.12	1.82	0.79	0.08	0.00	0.91	0.00	0.40	6.14	0.00	10.35	0.00	0.07	0.13	0.08	0.18	0.37	1.73	0.00	0.21	0.00
27	IG46_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	4.14	0.98	0.00	1.57	0.00	0.75	2.82	0.00	4.94	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	1.66	0.38	0.00	0.00	0.00
28	IG46_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	0.54	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.91	3.59	0.00	0.00	0.23	0.00	3.74	8.25	0.00	12.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.39	0.00	0.41	0.00
29	IG46_SR4	SilentIntergenicRegion	0	0.93	1.12	0.05	0.00	0.25	0.09	0.99	0.00	0.51	3.26	1.06	0.52	0.03	1.83	0.09	1.14	13.09	0.02	14.93	0.03	0.07	0.07	0.04	0.24	1.11	2.16	0.13	0.39	0.16
30	IG46_AR6	ActiveIntergenicRegion	0	0.68	0.51	0.26	0.00	0.00	0.49	0.32	0.00	0.53	7.96	2.07	1.13	0.00	2.89	0.00	0.00	9.70	0.00	13.98	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00	1.93	2.60	0.87	0.26	0.46