Order SeqName SeqType IsAE ABC_RG012 ABC_RG016 ABC_RG015 ABC_RG046 ABC_RG047 ABC_RG048 ABC_RG049 ABC_RG058 ABC_RG059 ABC_RG061 ABC_RG073 ABC_RG074 ABC_RG086 GCB_RG003 GCB_RG005 GCB_RG006 GCB_RG007 GCB_RG010 GCB_RG014 GCB_RG045 GCB_RG050 GCB_RG055 GCB_RG062 GCB_RG063 GCB_RG064 GCB_RG071 GCB_RG072 GCB_RG069 GCB_RG085 1 RP11-356N1.1 Gene 0 1.08 2.08 0.14 0.00 3.67 0.00 1.35 0.62 2.76 3.38 1.49 0.57 0.00 1.78 1.30 0.98 6.37 0.16 9.35 0.00 0.36 0.60 0.00 1.08 1.31 2.10 0.00 1.36 0.67 2 419428 Transcript 0 1.98 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 1.86 1.92 1.73 0.26 0.34 0.00 0.79 0.00 0.74 5.09 0.21 4.53 0.00 0.00 0.20 0.00 0.47 0.85 2.64 0.00 0.71 0.51 3 451023 Transcript 0 0.37 1.56 0.48 0.00 1.39 0.00 0.00 0.02 1.60 1.89 1.02 0.53 0.00 1.33 1.31 0.13 3.82 0.00 7.36 0.00 0.41 0.51 0.00 0.61 2.23 0.47 0.00 0.00 0.00 4 IG46 Intergenic 0 1.01 1.47 0.12 0.06 0.16 0.16 0.75 0.02 0.56 2.97 2.69 0.64 0.03 2.47 0.09 2.12 18.52 0.03 14.13 0.02 0.13 0.24 0.05 0.46 0.81 3.10 0.17 0.25 0.14 5 IG46_SR1 SilentIntergenicRegion 0 2.18 2.24 0.26 0.00 0.05 0.24 1.11 0.02 1.17 4.36 7.42 0.84 0.08 5.35 0.00 4.31 40.54 0.06 26.63 0.00 0.26 0.63 0.04 0.71 0.79 5.54 0.41 0.16 0.29 6 IG46_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 1.65 0.65 0.38 0.00 0.00 0.80 0.24 0.43 0.92 6.04 15.06 1.62 0.23 6.70 0.00 11.25 68.57 0.00 28.12 0.00 0.00 0.72 0.00 1.26 1.34 7.62 0.00 0.19 0.00 7 IG46_SR2 SilentIntergenicRegion 0 1.11 2.17 0.10 0.15 0.27 0.21 0.71 0.04 0.70 3.08 3.58 0.85 0.04 3.29 0.09 3.22 28.17 0.03 16.87 0.05 0.15 0.27 0.04 0.50 0.88 4.31 0.28 0.24 0.15 8 IG46_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.05 0.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.90 0.55 0.14 0.00 0.55 0.00 0.00 4.81 0.00 5.84 0.00 0.23 0.00 0.00 0.25 0.28 0.96 0.00 0.00 0.00 9 IG46_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.01 0.00 4.53 0.00 1.43 0.00 0.00 0.00 0.00 3.14 0.00 0.00 0.00 10 IG46_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.64 0.81 0.00 0.00 0.10 0.00 0.39 0.00 0.12 1.82 0.79 0.08 0.00 0.91 0.00 0.40 6.14 0.00 10.35 0.00 0.07 0.13 0.08 0.18 0.37 1.73 0.00 0.21 0.00 11 IG46_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.41 4.14 0.98 0.00 1.57 0.00 0.75 2.82 0.00 4.94 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 1.66 0.38 0.00 0.00 0.00 12 IG46_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 0.54 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.91 3.59 0.00 0.00 0.23 0.00 3.74 8.25 0.00 12.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.39 0.00 0.41 0.00 13 IG46_SR4 SilentIntergenicRegion 0 0.93 1.12 0.05 0.00 0.25 0.09 0.99 0.00 0.51 3.26 1.06 0.52 0.03 1.83 0.09 1.14 13.09 0.02 14.93 0.03 0.07 0.07 0.04 0.24 1.11 2.16 0.13 0.39 0.16 14 IG46_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 0.68 0.51 0.26 0.00 0.00 0.49 0.32 0.00 0.53 7.96 2.07 1.13 0.00 2.89 0.00 0.00 9.70 0.00 13.98 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 1.93 2.60 0.87 0.26 0.46 15 ER1a ExonRegion 0 2.94 3.16 0.00 0.00 0.00 0.00 2.64 0.80 4.26 5.19 0.78 1.01 0.00 2.37 0.00 2.21 7.63 0.63 13.58 0.00 0.00 0.59 0.00 1.41 1.40 2.68 0.00 2.13 1.53 16 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 9.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.72 0.00 1.57 0.00 1.22 0.00 0.00 8.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E1a_E2b KnownJunction 0 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.78 1.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.24 0.00 0.00 0.00 18 E2_Aa NovelBoundary 0 5.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.86 0.00 0.00 3.60 2.69 3.22 0.00 3.01 0.00 0.00 5.54 0.00 32.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER2a ExonRegion 0 0.37 1.56 0.48 0.00 1.39 0.00 0.00 0.02 1.60 1.89 1.02 0.53 0.00 1.33 1.31 0.13 3.82 0.00 7.36 0.00 0.41 0.51 0.00 0.61 2.23 0.47 0.00 0.00 0.00 20 E2_Ab KnownBoundary 0 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.52 0.00 0.00 1.88 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 2.98 10.78 0.00 16.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER2b ExonRegion 0 0.88 3.33 0.00 0.00 13.46 0.00 2.72 1.67 4.74 5.35 2.46 0.64 0.00 2.77 3.78 1.56 9.41 0.00 12.87 0.00 0.49 1.24 0.00 2.22 0.75 4.70 0.00 3.37 1.15 22 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.55 1.92 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 6.62 0.00 8.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.31 1.22 2.40 0.00 0.00 0.67 0.00 0.00 5.68 0.00 3.58 0.00 0.72 0.00 0.00 0.00 0.42 0.82 0.00 0.00 0.00 24 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 25 IG47_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 1.13 0.00 0.00 0.57 0.58 0.00 0.22 2.19 0.34 0.70 0.64 0.00 2.64 0.54 0.58 0.35 0.45 0.37 0.00 1.00 0.24 0.42 2.60 0.00 0.36 0.86 0.00 0.00 26 IG47_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 2.38 3.97 0.45 0.00 0.44 2.37 1.64 0.17 6.44 3.64 0.97 0.46 0.94 8.53 0.00 1.35 0.81 1.05 0.58 0.50 0.52 0.82 2.29 3.09 1.20 1.85 2.18 1.22 0.18 27 IG47_SR3 SilentIntergenicRegion 0 3.98 1.89 0.00 0.00 0.00 2.74 2.99 0.78 2.75 1.94 0.46 1.25 0.00 5.83 0.00 3.10 0.00 1.64 0.00 0.00 1.21 2.18 0.77 2.49 0.79 2.44 0.64 2.13 0.81