Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-225L12.1	Gene	0	4.51	2.40	3.44	12.25	6.42	3.49	10.51	5.89	2.46	1.14	0.89	1.54	1.33	1.60	8.09	4.04	1.24	2.83	3.78	9.96	1.62	2.69	2.77	2.45	6.95	3.10	2.49	3.21	1.79
2	457535	Transcript	0	6.88	4.23	3.10	6.94	6.38	3.46	15.62	9.01	3.49	1.31	1.05	2.36	2.78	3.32	7.97	5.89	1.39	3.56	5.02	10.76	1.90	6.21	3.70	1.98	11.64	3.94	5.16	5.16	4.23
3	444238	Transcript	0	2.31	1.91	0.36	1.79	0.83	3.03	6.27	2.92	1.07	1.50	0.06	0.39	0.14	0.17	4.02	0.60	0.59	1.24	0.27	5.05	0.45	0.00	0.64	0.97	0.54	1.60	3.18	0.52	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	1.85	1.53	4.12	14.54	6.88	1.31	3.74	3.67	0.67	0.56	0.67	1.38	1.06	0.61	2.88	3.15	0.77	2.10	3.03	5.34	0.71	2.69	1.92	0.77	3.45	1.16	1.00	1.68	2.22
5	E1_Da	NovelBoundary	0	16.28	0.00	3.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.09	14.64	1.89	1.99	0.00	0.00	3.64	3.95	0.00	0.00	2.74
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	5.78	0.00	5.13	0.00	0.00	1.65	9.90	12.59	0.00	1.72	1.42	0.00	1.18	4.30	0.00	0.00	2.00	4.62	0.00	9.68	1.68	13.76	0.00	0.00	1.52	1.85	6.11	4.13	10.04
7	I1	Intron	0	2.24	1.42	1.82	3.75	2.75	2.76	3.32	2.00	1.94	1.86	0.38	0.47	0.57	2.13	4.66	2.44	5.16	2.27	1.67	7.31	1.78	0.29	0.65	1.82	2.07	1.45	1.69	2.03	0.81
8	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.79	2.29	3.80	10.18	4.86	3.91	6.30	5.23	1.83	3.28	0.68	0.61	1.56	3.08	6.52	3.68	6.36	3.38	2.72	12.82	3.44	0.51	2.31	1.83	4.26	2.68	4.42	4.63	1.33
9	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.88	1.13	1.08	1.26	2.00	2.41	2.24	0.75	2.06	1.35	0.28	0.43	0.19	1.83	4.08	2.03	4.89	1.92	1.31	5.34	1.17	0.21	0.00	1.89	1.25	1.01	0.64	1.05	0.63
10	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.24	0.00	0.00	9.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	2.42	0.00	0.00	7.47	4.62	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	5.48
11	ER2a	ExonRegion	0	16.12	11.46	2.68	2.72	6.75	11.80	33.38	14.88	7.22	4.10	3.15	5.61	3.48	7.74	30.83	12.95	2.90	8.89	20.20	31.10	6.45	8.89	7.86	5.44	27.64	12.00	3.19	12.53	7.30
12	E2_Da	NovelBoundary	0	2.83	14.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.81	0.00	4.91	0.00	0.00	1.34	3.41	8.37	10.86	6.17	0.00	8.09	6.86	0.00	2.48	0.00	2.21	3.86	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E2a_E4a	NovelJunction	0	8.32	8.92	0.00	19.41	0.00	6.83	26.83	11.79	4.39	5.31	5.16	2.62	0.00	0.00	24.32	0.00	1.08	4.62	8.09	13.98	7.10	4.28	9.36	0.00	5.08	10.60	2.39	10.78	0.00
14	E2a_E5a	KnownJunction	0	8.08	8.14	1.54	0.00	13.56	1.73	23.63	10.15	9.01	0.00	0.00	4.82	6.27	2.84	0.00	7.65	0.00	0.00	0.00	3.64	0.00	3.74	6.45	0.00	17.73	2.19	11.68	4.58	1.62
15	I2	Intron	0	3.96	3.45	1.30	4.19	1.90	1.87	3.14	2.69	1.74	1.83	0.00	0.12	0.13	2.02	2.86	3.97	3.05	1.56	2.49	4.02	0.69	0.70	1.41	2.09	2.50	0.76	0.36	2.70	0.98
16	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.23	3.31	1.18	1.49	0.89	1.37	3.30	1.68	2.07	1.78	0.00	0.23	0.24	2.13	2.68	5.36	1.75	1.28	2.33	3.42	0.47	0.00	1.32	1.57	3.06	0.57	0.33	1.93	1.18
17	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	4.84	3.64	1.46	7.34	3.09	2.47	2.97	3.88	1.37	1.90	0.00	0.00	0.00	1.92	3.10	2.39	4.58	1.91	2.69	4.75	0.96	1.52	1.52	2.72	1.88	0.99	0.39	3.61	0.75
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.45	16.39	0.00	1.65	2.12	0.00	1.28	1.84	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00	3.82	4.39	0.00	8.09	15.30	0.00	0.00	0.00	5.74	0.00	0.00	0.00	4.40	3.37
19	ER3a	ExonRegion	0	2.14	0.00	0.77	10.75	4.64	0.01	6.13	0.00	0.00	0.72	0.00	1.54	0.00	0.45	7.36	1.24	0.75	0.00	1.60	3.75	0.00	0.00	0.00	1.08	1.43	0.79	0.00	0.02	0.00
20	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.92	0.00	7.37	3.49	2.92	1.89	0.00	0.00	0.00	4.82	0.00	4.21	8.37	0.00	5.09	0.00	0.00	2.98	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00
21	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	ER4a	ExonRegion	0	6.06	2.55	0.11	0.00	0.31	7.68	13.63	8.31	2.72	2.78	0.00	0.79	0.83	0.58	8.40	1.58	0.69	2.80	0.00	8.29	2.73	0.00	1.51	0.00	0.95	1.43	7.85	3.10	0.00
23	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	2.46	2.45	0.00	0.00	0.00	2.25	0.00
24	E4a_E5a	KnownJunction	0	5.66	8.92	0.00	0.00	0.00	10.47	16.02	8.66	3.35	5.51	0.00	0.00	0.00	0.00	8.37	0.00	2.09	4.62	0.00	13.65	0.00	0.00	2.31	0.00	0.00	6.44	11.23	0.00	0.00
25	ER5a	ExonRegion	0	8.76	3.03	9.08	28.23	15.53	7.72	21.80	13.30	7.65	1.56	1.69	1.66	2.49	2.66	13.91	5.06	2.91	5.00	1.81	22.59	2.96	4.02	6.31	6.44	12.34	6.02	6.24	5.59	1.36
26	E5_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	6.55	36.88	6.78	3.57	18.65	7.17	5.94	1.60	0.00	0.00	0.00	3.15	0.00	0.00	2.39	4.62	0.00	11.16	1.76	0.00	7.14	7.48	17.88	5.49	2.53	7.37	0.00
27	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	ER5b	ExonRegion	0	2.54	0.00	2.01	17.43	4.69	0.82	7.43	3.75	0.55	0.15	0.00	0.00	1.89	1.13	6.12	5.68	1.27	2.19	1.89	4.05	0.63	1.97	2.27	3.68	7.86	2.50	3.83	2.88	0.00
29	E5_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00
30	I5_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00
31	I5_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00
32	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	1.87	0.57	0.35	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	1.69	0.88	0.97	0.00	0.00	0.00