Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP5-1033H22.1	Gene	0	0.45	0.14	0.74	2.81	0.89	0.07	0.37	1.15	0.19	2.11	0.53	1.13	0.47	0.04	1.63	0.82	0.47	0.46	0.42	0.05	0.71	0.33	0.61	0.28	1.01	1.19	0.29	0.00	0.00
2	431770	Transcript	0	1.38	0.00	0.88	0.55	0.00	0.00	0.32	0.37	0.48	2.38	0.45	1.99	0.40	0.00	2.02	2.48	0.35	0.29	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	1.16	2.10	0.67	0.00	0.00
3	427243	Transcript	0	0.18	0.00	0.70	4.22	0.41	0.00	0.00	1.70	0.00	1.58	0.60	0.31	0.11	0.00	2.09	0.42	0.24	0.98	1.33	0.16	0.72	0.30	1.37	0.00	0.84	1.45	0.31	0.00	0.00
4	417401	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.31	0.28	0.00	1.10	0.18	0.00	0.00	0.00	0.83	0.38	0.59	0.00	0.00	0.00	0.43	0.00	0.27	0.33	1.08	0.00	0.00	0.00	0.00
5	412628	Transcript	0	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.68	0.28	1.87	0.76	0.00	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00
6	446684	Transcript	0	0.09	0.00	0.11	0.16	0.32	0.00	0.00	1.48	0.07	0.92	0.10	0.19	0.09	0.00	0.12	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.25	0.12	0.08	0.00	0.06	0.07	0.00	0.00	0.00
7	ER1a	ExonRegion	0	2.10	0.00	1.25	0.00	0.00	0.00	0.08	0.18	0.63	2.33	0.00	3.23	0.00	0.00	0.00	4.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	2.06	1.34	0.00	0.00
8	E1_Ab	KnownBoundary	0	2.95	0.00	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.79	0.00	4.55	0.00	0.00	0.00	7.65	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	6.35	0.00	0.00	0.00
9	ER1b	ExonRegion	0	0.42	1.09	1.07	8.19	1.99	0.27	1.33	1.71	0.20	1.11	0.00	3.04	0.64	0.27	0.00	2.93	0.61	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58	0.84	1.76	0.79	0.00	0.00
10	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.81	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	9.06	19.75	0.00	5.32	2.04	0.00	2.04	0.00	3.40	0.00	0.00	0.00	3.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E2_Ac	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	3.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	6.19	13.41	0.00	3.72	1.42	0.00	3.33	0.00	2.47	0.20	0.00	0.00	2.53	2.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.32	0.44	0.00	0.56	0.00	0.00
15	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.98	0.00	2.02	0.00	0.00	2.89	0.00	2.47	2.60	0.00	0.00	2.53	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	2.86	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER2c	ExonRegion	0	1.85	0.00	0.68	0.00	0.59	0.00	0.44	0.78	0.00	3.47	0.00	1.38	3.39	0.00	0.00	1.50	2.95	0.19	0.15	0.05	0.00	0.55	1.50	0.00	3.37	0.00	1.58	0.00	0.00
17	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E2a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	1.37	0.00	0.00	3.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E2a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E2a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER2d	ExonRegion	0	0.65	0.00	0.51	1.09	0.00	0.00	0.55	0.56	0.34	2.42	0.91	0.75	0.79	0.00	4.05	0.00	0.70	0.59	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.87	2.15	0.00	0.00	0.00
24	E2_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	6.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	3.30	2.19	0.00	0.00	0.00
25	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.94	0.00	0.00	0.00	1.47	0.00	0.00	0.00	0.00
26	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.70	0.65	0.34	0.36	0.74	0.07	0.20	0.19	0.25	4.37	0.72	1.58	0.33	0.18	0.00	0.63	0.75	0.00	0.00	0.00	1.12	0.18	0.00	0.00	0.60	0.79	0.18	0.00	0.27
27	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.93	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.37	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00
28	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.65	0.00	1.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER4a	ExonRegion	0	0.38	0.00	0.44	0.63	1.29	0.00	0.00	0.65	0.30	1.78	0.42	0.76	0.34	0.00	0.48	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	1.00	0.48	0.32	0.00	0.25	0.28	0.00	0.00	0.00
32	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	0.56	0.00	3.06	0.94	0.35	0.00	0.00	0.00	0.04	1.21	0.00	1.26	1.09	0.00	0.00	0.71	0.85	1.13	2.49	0.00	0.00	0.00
33	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.50	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.91	0.00	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	0.00	0.00	6.57	0.00	0.00	0.00
35	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	0.57	2.27	0.15	0.00	0.00	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00
36	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.05	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.82	0.00	0.00	0.00	0.00
37	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.99	0.00	0.09	0.00	0.66	0.27	3.39	1.99	2.34	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.50	0.43	0.91	1.14	1.54	0.00	3.49	0.00	0.00
38	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.45	0.00	0.70	3.01	0.00	0.00	0.00	0.39	0.24	2.42	2.00	0.54	1.36	0.00	2.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.91	0.38	0.20	0.45	2.10	0.00	0.00	0.00	0.00
39	E6_Aa	NovelBoundary	0	78.33	76.69	41.61	26.75	35.96	77.43	33.59	52.30	96.29	95.11	47.20	19.64	38.21	65.63	74.74	62.27	150.90	8.99	0.00	61.28	80.10	56.06	48.90	83.02	79.14	63.26	106.80	60.52	59.99
40	ER6a	ExonRegion	0	0.36	0.00	1.41	8.45	0.82	0.00	0.00	3.41	0.00	3.16	1.20	0.62	0.22	0.00	4.18	0.84	0.49	1.96	2.66	0.32	1.44	0.61	2.73	0.00	1.68	2.91	0.62	0.00	0.00
41	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.44	0.00	2.80	0.00	1.02	0.00	0.00	2.21	0.00	0.00	0.00	0.00	4.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.78	0.00	0.85	3.65	2.13	0.60	0.15	0.27	0.90	3.25	2.51	1.25	0.09	0.10	1.01	0.62	0.43	0.33	0.00	0.00	1.87	0.39	0.66	0.94	0.93	0.45	0.00	0.00	0.00
43	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.26	0.55	0.75	0.31	0.31	0.21	0.43	2.23	0.56	0.74	0.00	0.00	0.00	0.95	0.57	0.00	0.24	0.00	0.54	1.38	0.00	0.00	1.09	0.24	0.00	0.00	0.00
44	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	5.39	0.00	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.77	0.00	0.00	0.00
45	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.61	0.56	0.00	2.19	0.36	0.00	0.00	0.00	1.67	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.87	0.00	0.55	0.65	2.17	0.00	0.00	0.00	0.00