Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-7O11.1	Gene	0	6.08	8.30	2.30	11.82	1.34	3.02	2.77	9.61	4.66	3.57	2.94	2.83	1.79	3.48	3.12	5.45	15.58	5.50	5.85	4.54	3.92	1.65	1.66	2.17	4.32	1.73	4.53	2.39	2.02
2	412378	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	1.41	0.00	0.81	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.69	0.00	0.99	0.51	0.00	0.65	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00
3	446167	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.25	0.00	0.47	0.81	0.86	0.68	2.14	0.00	0.00	0.88	0.00	1.41	0.15	1.20	0.00	0.50	1.22	0.80	0.90	0.00	0.34	0.65	0.00	0.43	0.00
4	445226	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	IG50_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	1.22	5.54	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.48	0.77	0.27	1.78	2.61	1.15	2.23	0.00	0.06	0.86	0.00	0.37	0.00	0.55	1.60	0.71	0.63	0.10
6	IG50_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	2.24	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	2.85	0.00	1.81	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	1.34
7	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	5.15	0.00	0.00	2.81	0.00	1.61	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.99	1.38	0.00	1.98	1.02	0.00	1.30	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00
8	E1_Da	NovelBoundary	0	5.84	0.00	1.12	10.78	7.37	0.00	0.00	0.00	1.16	2.04	1.23	1.20	0.00	0.00	0.00	11.40	5.76	4.62	0.00	0.00	3.57	2.48	0.00	0.00	1.59	3.73	0.00	10.42	0.00
9	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	I1	Intron	0	4.30	2.77	0.00	2.05	0.00	0.39	1.73	2.64	2.57	1.65	0.68	1.95	0.37	1.30	2.64	4.07	4.70	4.42	0.00	3.16	1.63	0.00	1.04	0.62	2.05	0.45	4.20	3.27	1.34
11	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.34	2.80	0.00	2.08	0.00	0.40	1.75	2.67	2.60	1.67	0.69	1.97	0.38	1.31	2.67	4.11	4.76	4.47	0.00	3.18	1.65	0.00	1.05	0.62	2.07	0.46	4.25	3.31	1.34
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	8.38	0.00	1.54	19.63	21.66	3.64	13.45	4.18	7.67	7.75	1.55	13.07	1.50	3.26	0.00	18.97	12.54	0.00	16.18	3.80	6.10	1.90	2.41	0.00	1.93	7.85	7.45	4.54	6.80
13	E2_Ab	NovelBoundary	0	6.02	4.56	1.54	0.00	13.12	1.96	2.17	9.31	9.50	5.79	7.15	0.00	1.62	1.91	0.00	17.52	10.60	9.25	0.00	8.27	3.77	2.19	9.51	0.00	1.44	1.89	0.00	8.63	0.00
14	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	8.50	0.00	0.95	1.62	1.72	1.36	4.27	0.00	0.00	1.76	0.00	2.83	0.29	2.41	0.00	0.99	2.43	1.59	1.81	0.00	0.67	1.29	0.00	0.86	0.00
15	ER2b	ExonRegion	0	0.00	3.91	0.00	0.00	8.42	0.56	2.02	3.33	2.03	1.20	4.05	0.00	0.00	2.57	0.00	7.23	5.06	1.62	0.00	2.81	4.58	1.55	2.20	2.00	1.43	1.38	6.50	2.17	0.00
16	E2_Da	NovelBoundary	0	2.60	0.00	2.89	0.00	0.00	1.73	2.46	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	1.72	1.29	0.00	0.00	4.97	13.87	8.09	4.13	0.00	0.00	1.82	4.85	0.00	5.54	0.00	5.80	0.00
17	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	8.05	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	3.21	8.91	0.00	0.00	0.00	3.49	2.19	2.31	2.45	0.00	0.00	11.23	1.98	0.00
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.85	2.59	21.35	0.00	0.00	0.00	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	6.15	0.00	0.00	3.31	0.00	0.00	0.00	0.00	7.99	0.00	0.00	2.07	0.00
19	ER3a	ExonRegion	0	8.82	6.66	3.34	14.33	1.68	3.59	4.92	11.93	4.12	6.22	3.12	3.41	2.23	6.49	5.07	7.03	24.07	4.85	9.69	5.05	5.19	2.02	2.57	3.14	4.77	3.35	9.02	3.72	4.84
20	E3_Da	KnownBoundary	0	5.54	7.76	5.28	18.33	0.00	3.68	0.00	19.46	5.48	3.52	5.63	0.00	4.46	2.84	0.00	0.00	17.78	4.62	8.09	11.33	5.21	4.52	2.51	0.00	3.60	1.67	11.33	0.00	0.00
21	E3a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	ER3b	ExonRegion	0	9.16	16.84	2.87	12.95	0.00	4.62	2.60	14.68	8.36	4.70	3.41	3.51	2.65	3.93	4.38	7.98	18.53	9.58	9.23	5.89	4.96	2.49	1.87	2.51	7.73	1.76	5.22	2.59	2.34
23	E3_Ab	KnownBoundary	0	5.54	3.49	1.37	21.57	0.00	1.76	2.92	18.81	7.55	5.31	6.58	8.70	3.98	0.00	8.17	7.65	28.79	0.00	8.09	12.40	5.74	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	0.00	5.84	0.00
24	ER3c	ExonRegion	0	4.80	5.29	2.83	18.28	0.00	3.20	0.58	8.51	2.95	1.70	3.37	3.93	2.01	1.54	2.18	2.48	15.86	4.61	2.08	4.72	2.41	0.90	0.00	2.19	2.74	0.00	0.00	2.20	0.00
25	ER3d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.41	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER3e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	IG49_SR3	SilentIntergenicRegion	0	3.93	4.14	0.92	7.89	3.58	3.28	0.74	5.40	4.32	1.59	3.49	1.47	0.00	2.66	1.01	8.52	7.39	4.24	3.52	2.53	3.14	0.66	0.00	2.37	2.62	0.00	1.34	5.08	0.61
28	IG49_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	5.81	1.32	3.23	13.78	2.79	3.37	1.53	6.76	3.73	2.43	1.17	5.07	2.13	4.08	7.73	14.20	13.40	4.42	3.16	1.91	5.36	0.17	0.00	5.20	2.16	1.13	1.20	4.11	0.93
29	IG49_SR2	SilentIntergenicRegion	0	6.11	2.78	0.40	2.56	1.50	2.96	2.62	3.60	4.57	1.39	1.46	2.87	1.51	3.05	6.13	8.48	10.20	6.63	2.25	1.68	2.20	0.16	0.00	4.29	1.82	1.80	1.31	3.36	0.14