Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-191G24.1	Gene	0	0.58	0.87	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.42	0.16	0.00	0.00	0.00	0.88	17.55	4.84	0.96	3.58	9.47	16.99	2.15	0.58	3.70	1.16	2.62	4.91	1.88	16.61	3.54
2	431943	Transcript	0	0.28	0.30	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.18	0.07	0.00	0.00	0.00	0.44	10.18	2.63	0.46	1.98	5.22	10.46	1.10	0.25	2.35	0.73	1.34	2.40	0.95	7.85	2.07
3	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	8.37	3.82	1.24	0.00	0.00	4.13	2.05	0.00	1.92	0.00	0.00	2.19	0.00	8.27	1.68
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	0.29	2.18	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.48
5	Ix	Intron	0	0.25	0.38	0.05	0.07	0.05	0.04	0.02	0.00	0.06	0.27	0.08	0.03	0.00	0.33	13.55	6.05	0.90	1.34	3.63	8.62	1.52	0.25	1.82	0.55	1.67	3.93	0.62	11.65	2.13
6	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.87	3.41	0.44	0.00	0.93	4.02	0.83	0.00	1.58	0.00	1.67	0.92	0.00	4.74	0.38
7	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.47	1.12	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.66	0.52	0.00	0.00	0.13	26.20	9.26	0.83	0.70	2.81	10.67	0.71	0.54	3.10	0.94	2.47	4.16	0.27	7.95	3.67
8	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.14	13.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	20.16	16.79	4.01	0.00	7.69	11.62	0.29	1.80	5.67	0.00	6.53	3.67	0.00	15.87	5.86
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.21	0.17	0.04	0.09	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.21	0.01	0.04	0.00	0.37	11.44	5.55	0.91	1.51	3.85	8.45	1.70	0.20	1.59	0.52	1.50	4.02	0.71	12.52	1.92
10	I1	Intron	0	0.79	0.68	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.14	0.06	0.15	0.00	0.00	0.85	14.75	2.39	1.04	4.21	10.63	18.72	1.06	0.07	3.56	1.41	2.64	7.03	1.58	15.66	4.31
11	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.79	0.68	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.14	0.06	0.15	0.00	0.00	0.85	14.77	2.39	1.04	4.21	10.63	18.73	1.06	0.07	3.56	1.41	2.64	7.04	1.58	15.67	4.32
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	5.96	0.00	1.22	8.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	14.20	186.36	13.16	10.60	19.26	89.02	245.53	7.22	0.00	72.00	2.81	20.65	31.71	44.08	112.15	48.76
13	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	34.10	16.62	0.00	9.63	27.07	76.96	4.91	0.90	18.95	4.30	5.00	5.50	6.41	16.24	8.90
14	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	3.21	1.89	0.00	24.28	3.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	6.07	1.35
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	I2	Intron	0	0.08	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.21	0.00	0.00	0.00	0.27	12.32	2.45	0.61	1.07	3.07	5.34	0.89	0.20	0.73	0.32	1.85	2.26	0.20	7.82	1.26
17	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.08	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.21	0.00	0.00	0.00	0.27	12.34	2.45	0.61	1.07	3.07	5.34	0.90	0.20	0.74	0.32	1.85	2.27	0.20	7.83	1.26
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.23	0.00	0.00	0.00	49.43	0.00	0.00	0.00	0.00	4.13	4.09	0.00	0.00	0.00	3.86	8.24	0.00	42.24	4.85
19	ER3a	ExonRegion	0	1.08	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.79	10.01	3.12	0.00	1.05	5.62	10.61	3.27	0.00	1.82	0.54	1.80	5.14	1.38	24.14	2.86
20	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	9.97	0.00	0.88	0.00	0.00	3.56	5.41	0.00	0.00	0.00	6.33	7.90	0.00	31.00	2.81
21	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	I3	Intron	0	0.29	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	13.43	3.00	2.12	1.32	3.24	7.68	2.32	0.00	1.35	0.15	1.45	3.08	0.87	13.23	0.68
23	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.29	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	13.47	3.01	2.13	1.33	3.25	7.70	2.32	0.00	1.35	0.15	1.45	3.09	0.87	13.26	0.68
24	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	25.71	6.66	0.00	4.62	0.00	14.97	5.78	0.00	1.87	3.05	3.37	0.00	0.00	1.98	0.00
25	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	14.06	0.00	0.83	0.00	1.77	4.58	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	1.73	0.00	5.37	0.74
26	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.94	1.40	0.00	0.00	4.13	1.76	0.00	2.12	0.00	0.00	1.89	0.00	8.40	1.68
27	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	I4	Intron	0	0.32	0.48	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.09	0.00	0.00	0.54	12.70	3.77	1.33	1.31	3.09	6.88	1.59	0.40	0.94	0.48	1.81	3.62	0.82	11.51	2.29
29	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	0.32	0.48	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.09	0.00	0.00	0.54	12.74	3.78	1.34	1.32	3.10	6.90	1.60	0.40	0.94	0.48	1.81	3.63	0.82	11.55	2.29
30	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	8.17	3.82	3.38	4.62	0.00	12.07	0.00	0.00	2.51	0.00	1.93	3.78	0.00	6.69	1.55
31	ER5a	ExonRegion	0	0.46	2.78	0.00	0.00	2.11	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	14.52	5.90	1.61	2.15	6.27	10.72	1.54	1.56	1.95	0.00	2.78	6.79	3.56	16.96	2.02
32	E5_Da	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	8.17	6.96	1.40	0.00	0.00	4.05	0.00	2.33	2.07	0.00	3.64	3.43	0.00	27.23	1.91
33	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	I5	Intron	0	0.71	1.36	0.11	0.24	0.33	0.32	0.00	0.00	0.26	0.05	0.28	0.00	0.00	1.49	43.58	5.70	4.72	2.36	2.87	16.40	2.23	0.78	6.56	1.43	3.62	10.10	0.43	27.79	7.46
35	I5_SR1	SilentIntronRegion	0	0.71	1.37	0.11	0.24	0.33	0.32	0.00	0.00	0.26	0.05	0.28	0.00	0.00	1.49	43.64	5.71	4.73	2.37	2.88	16.42	2.23	0.78	6.57	1.43	3.62	10.11	0.43	27.82	7.47
36	E6_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	67.77	6.66	1.06	0.00	0.00	6.95	0.00	4.76	3.94	2.27	7.16	10.56	0.00	27.45	6.54
37	ER6a	ExonRegion	0	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	35.77	2.24	1.33	2.78	4.25	7.35	1.28	0.00	1.70	1.92	2.56	6.33	0.00	10.95	6.63
38	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.86	76.14	6.96	2.95	0.00	0.00	28.94	1.85	0.00	2.51	5.32	9.02	13.09	0.00	21.61	1.35
39	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	I6	Intron	0	0.63	0.38	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.17	0.35	0.00	0.00	2.62	32.85	9.21	3.44	6.10	6.99	11.68	2.95	1.39	4.39	1.65	2.79	8.83	1.63	22.76	6.53
41	I6_SR1	SilentIntronRegion	0	0.64	0.38	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.17	0.35	0.00	0.00	2.63	32.92	9.23	3.45	6.11	7.01	11.70	2.96	1.39	4.40	1.66	2.80	8.85	1.63	22.81	6.54
42	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.90	0.00	16.68	6.19	14.13	24.28	17.86	7.58	2.48	4.43	6.10	4.93	3.91	0.00	40.21	8.35
43	ER7a	ExonRegion	0	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.89	0.00	0.00	0.00	0.70	13.67	3.54	1.81	8.16	17.40	13.18	2.17	0.55	2.69	1.96	3.91	3.34	0.00	20.24	3.22
44	IG7	Intergenic	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	12.22	4.93	0.00	4.04	4.23	9.13	0.00	0.00	1.20	0.00	0.95	0.00	0.00	7.56	0.00
45	IG7_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.62	12.47	5.06	0.00	4.15	4.34	9.37	0.00	0.00	1.23	0.00	0.97	0.00	0.00	7.69	0.00