Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	SLFNL1	Gene	0	1.83	1.42	0.93	0.34	0.52	1.15	0.19	1.18	1.17	1.33	0.59	1.06	0.67	0.70	0.77	0.71	2.70	1.93	1.44	0.85	1.89	0.28	0.49	0.48	1.12	0.91	0.74	1.83	0.48
2	359345	Transcript	0	2.49	1.63	1.59	0.00	1.17	1.87	0.41	1.78	1.58	1.54	1.14	1.54	0.80	1.35	1.10	1.31	4.33	2.40	2.51	0.66	2.92	0.43	0.93	0.37	1.63	1.13	1.44	2.09	0.27
3	372611	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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9	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	1.51	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	2.20	0.00
10	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.08	3.20	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1_Ae	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.81	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00
13	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	1.99	0.00	3.68	2.06	3.37	0.00	3.71	0.00	1.81	3.73	0.98	0.00	4.25	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	1.43	1.05	0.00	1.90	0.00
14	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	3.68	1.12	4.33	0.00	2.47	0.00	1.81	5.60	2.53	0.00	5.46	0.00	0.00	3.74	0.00	0.00	0.00	1.43	1.57	0.00	0.00	0.00
15	ER1d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	3.68	1.12	4.33	0.00	2.47	0.00	1.36	5.60	2.53	0.00	5.46	0.00	0.00	4.28	0.00	0.00	0.00	1.43	1.57	0.00	0.00	0.00
16	ER1e	ExonRegion	0	2.94	0.00	1.20	0.00	2.71	3.36	0.00	0.78	1.03	2.68	0.56	1.16	0.80	0.93	1.22	1.90	1.75	1.78	0.00	0.00	1.72	0.00	0.94	0.49	0.79	0.50	0.00	2.53	0.00
17	E1_Da	KnownBoundary	0	2.24	0.00	0.00	0.00	0.00	3.91	0.00	0.00	1.34	0.00	1.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00
18	E1a_E1f	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E1_Db	KnownBoundary	0	6.02	0.00	1.49	0.00	7.37	0.00	0.00	2.24	2.71	0.00	0.00	1.54	1.40	0.00	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E1b_E1g	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER1f	ExonRegion	0	6.43	0.00	1.28	0.00	0.00	2.75	0.00	3.16	4.49	0.00	1.19	1.77	1.30	0.00	0.00	0.00	2.43	0.00	3.88	0.00	0.00	0.00	0.77	2.15	0.20	0.00	0.00	1.63	0.77
22	ER1g	ExonRegion	0	4.02	2.29	1.27	0.00	0.36	1.91	0.30	1.37	2.57	2.29	0.98	1.79	1.03	0.62	1.03	0.74	3.85	3.48	1.87	1.44	3.35	0.27	0.41	0.88	1.39	1.41	1.50	2.20	1.12
23	E1_Af	KnownBoundary	0	0.00	11.63	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	4.58	3.11	1.64	0.00	0.00	1.94	1.09	0.00	0.00	2.32	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42
24	ER1h	ExonRegion	0	0.62	4.33	0.46	0.00	0.00	1.24	0.00	2.59	3.52	2.24	0.66	0.00	0.55	1.52	3.41	1.87	1.61	0.00	0.00	7.45	2.71	0.00	0.00	0.00	2.03	2.82	0.00	4.98	1.46
25	E1_Dc	KnownBoundary	0	3.01	13.09	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	2.04	7.98	5.87	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	10.65	4.39
26	E1c_E1g	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER1i	ExonRegion	0	0.77	9.32	0.00	0.00	0.00	1.45	0.00	1.88	2.12	1.44	0.19	0.16	2.05	0.03	0.00	0.00	3.63	1.52	1.68	0.56	2.75	0.17	0.21	0.00	0.07	1.97	0.00	3.26	0.61
28	E1_Ag	KnownBoundary	0	0.00	14.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	1.23	2.99	0.00	0.00	0.00	3.71	13.74	0.00	0.00	1.72	1.85	1.92	0.00	0.00	2.19	0.00	3.86	0.00
29	ER1j	ExonRegion	0	1.78	1.85	0.93	1.32	0.00	0.51	0.00	1.54	0.62	2.00	0.11	1.12	0.64	0.58	0.93	0.46	3.25	2.79	1.80	2.04	1.55	0.64	0.64	1.19	2.11	1.52	0.00	4.29	1.18
30	E1_Dd	NovelBoundary	0	2.89	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	7.22	0.00	1.80	1.49	1.45	1.40	2.06	24.91	0.00	3.38	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	4.03	0.00	0.00	1.49
31	E1d_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E1d_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	Ix	Intron	0	3.17	3.78	1.31	0.33	1.13	4.76	0.65	1.44	4.09	3.40	0.60	3.10	3.23	2.03	6.36	2.05	8.75	5.39	5.90	1.14	6.32	0.92	0.83	2.88	1.98	3.84	2.03	5.57	2.66
34	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.42	4.71	1.26	0.00	0.37	4.55	0.61	1.66	4.55	2.39	0.54	3.25	2.24	1.57	5.19	2.08	7.19	4.54	3.12	1.24	6.12	0.81	0.95	2.91	1.83	3.07	1.38	4.17	2.67
35	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.75	3.80	1.50	1.69	2.31	5.10	0.24	0.84	2.88	5.05	0.84	3.04	4.08	1.79	8.25	2.33	11.25	6.54	9.35	1.95	6.89	1.70	0.43	3.73	2.64	5.37	3.46	6.84	4.43
36	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	6.05	0.79	1.31	0.00	2.38	5.12	1.22	1.37	3.87	5.00	0.58	2.73	5.58	3.78	8.28	1.66	11.33	7.03	11.39	0.00	6.46	0.44	0.88	1.91	1.81	4.81	2.68	8.84	0.81
37	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.49	1.47	0.00	0.00	1.61	0.00	6.47	4.14	4.75	0.00	3.70	2.99	0.86	0.00	3.82	11.37	18.49	16.18	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	3.33	1.85	0.00	0.00	0.00
38	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38
39	E2_Ab	KnownBoundary	0	5.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	3.28	0.00	3.40	1.40	0.00	0.00	0.00	10.26	4.62	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	2.97
40	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.18	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	E2_Da	NovelBoundary	0	11.74	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	11.61	4.98	1.77	1.68	0.00	1.60	1.94	7.56	7.97	2.98	7.90	4.62	0.00	0.00	1.52	2.14	0.00	0.00	1.52	4.38	0.00	0.00	0.00
42	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	2.42	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	E3_Aa	NovelBoundary	0	8.49	8.73	1.10	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	4.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.37	10.63	6.26	4.62	0.00	0.00	2.05	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.12	0.00	0.31	1.12	0.00	0.00	0.00	0.51	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	E3_Da	NovelBoundary	0	9.02	0.00	1.20	0.00	0.00	3.49	0.00	1.94	4.23	3.60	1.14	0.00	0.00	1.06	0.00	3.44	9.12	0.00	8.09	3.72	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	6.27	0.00	1.89	0.00
47	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	2.44	0.00	1.72	0.00	1.23	1.34	0.00	0.00	0.00	1.17	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	E4_Aa	NovelBoundary	0	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.75	3.40	3.13	0.00	5.00	0.95	9.37	22.80	3.58	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.38	0.00	1.75	1.82
49	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.13	0.24	0.00	0.00	0.00	0.12	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00