Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	MATN1	Gene	0	0.62	0.14	0.35	0.79	0.05	0.64	0.69	0.08	0.26	0.42	0.21	1.05	0.03	0.43	0.54	0.71	0.91	0.35	0.14	0.18	0.22	0.20	0.12	0.55	0.40	0.87	0.12	0.11	0.12
2	373765	Transcript	0	1.03	0.25	0.27	0.08	0.00	0.82	0.23	0.25	0.20	0.28	0.14	0.96	0.00	0.41	1.83	1.14	1.23	0.28	0.02	0.18	0.17	0.26	0.00	0.54	0.28	0.31	0.03	0.01	0.03
3	477320	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	494561	Transcript	0	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.20	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.91	0.84	0.00	0.00	0.00
5	ER1a	ExonRegion	0	5.09	1.26	1.31	0.00	0.00	1.62	0.79	1.44	0.43	1.13	0.47	1.36	0.00	1.30	2.15	4.59	2.34	0.76	0.00	1.08	0.00	0.71	0.00	2.53	1.12	0.62	0.00	0.00	0.00
6	E1_Da	NovelBoundary	0	5.31	3.88	2.64	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	2.00	0.00	1.30	0.00	1.99	0.00	2.98	14.61	0.00	0.00	0.00	2.01	0.00	0.00	2.63	1.63	3.43	0.00	2.02	0.00
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	Ix	Intron	0	5.67	1.41	5.72	1.75	0.20	3.64	1.48	0.97	2.72	2.94	1.21	2.13	1.19	4.85	3.30	10.16	9.67	1.50	0.91	1.17	4.47	1.69	1.03	4.64	2.80	2.43	0.15	1.46	0.60
9	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	5.91	1.09	7.09	1.17	0.00	3.29	2.21	1.57	3.46	3.33	1.91	3.54	2.65	5.47	3.48	11.26	13.22	1.83	1.17	1.25	4.65	1.54	1.99	4.20	4.62	1.86	0.00	3.18	0.33
10	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.82	1.74	5.28	1.85	0.33	3.97	1.23	0.75	2.38	2.95	0.96	1.56	0.50	4.55	3.50	9.84	8.17	1.49	0.87	1.12	4.48	1.96	0.49	5.41	1.96	3.00	0.25	0.57	0.74
11	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.32	0.00	2.93	3.83	0.00	2.46	0.00	0.00	2.11	0.92	0.00	0.33	0.00	4.49	0.61	7.68	5.56	0.00	0.00	1.23	3.55	0.00	1.12	0.00	1.22	0.23	0.00	0.87	0.77
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.54	4.56	6.00	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	6.34	8.37	10.86	6.28	4.62	0.00	0.00	0.00	4.96	0.00	8.67	1.74	0.00	0.00	1.93	0.00
13	ER2a	ExonRegion	0	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.50	0.21	0.00	0.79	0.00	0.78	0.00	1.82	1.54	0.57	0.00	0.00	0.84	0.79	0.00	0.32	0.21	0.23	0.00	0.00	0.00
14	E2_Da	NovelBoundary	0	22.65	0.00	8.12	0.00	0.00	11.36	16.59	0.00	8.56	5.47	1.27	5.57	1.82	15.58	7.97	33.66	47.07	4.62	0.00	0.00	5.82	4.76	1.92	11.36	6.78	15.02	7.06	8.36	1.32
15	E2a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E3_Aa	NovelBoundary	0	4.78	0.00	0.00	9.49	0.00	1.84	2.92	1.84	0.00	3.28	0.00	1.51	1.46	1.13	7.37	0.00	4.64	4.62	0.00	7.36	2.05	0.00	0.00	0.00	1.74	2.19	0.00	0.00	1.65
17	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	1.00	0.00	0.67	0.00	0.31	0.00	1.71	0.71	0.44	0.00	1.18	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.37	0.00
20	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.56	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	3.14	0.00	0.00	0.00	2.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E3a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER4a	ExonRegion	0	0.87	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11	1.63	0.00	0.36	1.93	0.00	2.36	0.00	0.00	0.00	3.01	1.06	0.78	0.00	1.27	0.00	0.00	0.44	1.28	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.28	3.91	0.00	1.36	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER5a	ExonRegion	0	2.00	0.00	0.45	6.28	0.00	0.37	0.54	0.00	0.34	0.27	0.00	2.37	0.00	1.09	0.00	0.00	0.55	0.91	0.00	0.74	0.76	0.48	0.41	1.57	0.76	0.84	0.00	0.87	0.00
28	E5_Ab	KnownBoundary	0	3.01	0.00	0.00	32.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00
29	ER5b	ExonRegion	0	0.51	0.00	0.66	9.12	0.00	0.00	3.77	0.00	0.04	0.68	0.00	1.57	0.00	0.63	0.00	0.00	1.07	1.10	0.00	0.15	0.00	0.84	0.56	2.01	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00
30	E5_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	2.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00
31	ER5c	ExonRegion	0	1.87	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	2.03	0.00	0.98	0.63	0.00	1.97	0.00	0.57	0.00	0.00	2.35	0.00	1.39	1.06	0.52	0.11	0.70	1.88	0.00	2.50	0.17	0.56	0.59
32	E5_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	12.18	0.00	0.00
33	E5b_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.82	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	1.56	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	1.89	0.00
34	ER6a	ExonRegion	0	0.52	0.00	0.73	0.00	1.33	1.83	2.67	0.61	0.22	1.17	0.40	1.90	0.00	0.70	4.61	1.65	4.06	0.00	1.06	0.00	0.30	0.74	0.60	0.72	0.00	2.69	0.48	0.12	0.39
35	E6a_E7a	KnownJunction	0	2.65	0.00	1.47	0.00	5.89	0.00	4.86	0.00	1.55	3.52	0.00	5.48	0.00	1.09	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	2.05	2.43	0.00	0.00	0.00	8.33	0.00	0.00	1.25
36	ER7a	ExonRegion	0	0.37	0.00	0.39	0.00	0.55	2.34	0.90	0.00	0.29	0.52	0.00	2.49	0.00	1.28	4.84	0.00	3.22	0.00	0.00	0.00	0.48	0.71	0.00	0.00	0.90	1.84	0.02	0.00	0.12
37	E7_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.37	0.00	2.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	ER7b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.20	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.91	0.84	0.00	0.00	0.00
40	E7_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	2.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.64	0.00	0.00	0.00	0.00
41	E8_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.70	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER8a	ExonRegion	0	0.46	0.21	0.29	0.47	0.00	0.78	0.61	0.04	0.29	0.31	0.36	1.06	0.00	0.38	0.47	0.43	0.71	0.35	0.14	0.00	0.19	0.08	0.00	0.37	0.37	1.02	0.20	0.07	0.17