Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RHBDL2	Gene	0	2.15	3.92	3.33	3.14	0.71	3.26	1.91	0.50	4.26	3.21	1.43	1.59	0.90	3.84	2.81	3.07	3.40	4.14	3.85	1.94	2.73	0.89	1.06	1.69	5.06	2.18	4.65	3.12	1.73
2	478955	Transcript	0	1.13	1.17	0.46	0.00	0.00	1.07	0.34	0.00	2.10	3.33	0.32	0.94	0.00	1.90	0.00	0.00	1.78	0.00	4.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	4.03	0.30	0.00	0.42
3	372990	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
4	289248	Transcript	0	1.49	0.40	0.63	1.37	0.62	1.27	1.78	0.46	2.20	1.23	0.98	0.62	0.16	2.09	3.95	1.56	1.04	1.18	2.01	0.65	1.08	0.46	0.57	0.49	0.71	0.52	0.12	1.74	0.30
5	372985	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
6	IG15_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.05	0.57	0.00	0.84
8	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.54	1.19	0.00	0.00	0.56	0.00	2.48	2.56	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	4.24	1.74	0.00	2.09
9	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	3.43
10	ER2a	ExonRegion	0	1.49	0.40	0.63	1.37	0.62	1.27	1.78	0.46	2.20	1.23	0.98	0.62	0.16	2.09	3.95	1.56	1.04	1.18	2.01	0.65	1.08	0.46	0.57	0.49	0.71	0.52	0.12	1.74	0.30
11	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.61	0.00	0.00	2.80	2.04	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00
12	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	1.42	1.48	1.52	0.00	0.00	1.39	0.00	3.37	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	1.12	0.86	0.00	0.00	0.00
13	E2_Da	NovelBoundary	0	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	1.48	0.00	1.87	0.00	1.02	0.00	2.98	3.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	2.16	0.00
14	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.28	0.00	7.31	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.48	0.86	0.00	0.00	1.86	0.00	3.66	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.28	0.00	7.31	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	2.38	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.36	0.61	0.28	6.24	0.00	0.47	0.34	0.00	2.83	0.74	0.34	0.16	0.44	0.74	0.00	0.63	0.70	0.16	0.82	0.34	0.36	0.31	0.00	0.00	0.61	0.13	0.16	0.56	0.28
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	4.90	7.66	42.45	0.00	0.00	1.88	5.84	0.00	24.09	7.23	8.95	8.89	7.67	11.85	0.00	0.00	5.76	0.00	0.00	0.00	1.56	4.57	0.00	8.49	10.84	11.84	0.00	9.21	0.00
19	ER3a	ExonRegion	0	1.18	3.75	6.32	2.96	0.67	1.33	0.90	0.00	3.00	4.97	1.66	1.15	0.89	4.46	2.78	5.12	4.74	4.34	3.51	2.92	1.18	1.13	1.20	2.07	6.37	3.94	6.83	4.05	1.98
20	E3_Da	NovelBoundary	0	2.89	0.00	4.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.16	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	2.62	0.00	0.00	1.30	0.00	8.44	0.00	0.00	3.65	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	1.92	0.00	5.57	0.00	0.00	10.29	0.00
22	Ix	Intron	0	1.32	1.87	2.25	2.60	0.00	0.55	0.95	0.07	2.83	2.36	0.73	1.30	0.47	2.81	2.04	1.37	1.84	0.07	1.86	0.64	0.88	0.26	0.26	1.33	1.40	0.69	0.33	2.13	0.41
23	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.22	0.85	2.05	3.71	0.00	0.00	0.52	0.00	1.60	1.67	0.89	0.00	0.34	4.51	1.19	1.28	2.32	0.00	0.00	1.23	1.48	0.47	0.47	0.68	0.43	1.22	0.47	1.69	0.52
24	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.14	1.95	2.46	2.29	0.00	0.73	0.88	0.05	2.88	2.45	0.75	1.43	0.56	2.76	2.05	1.58	1.81	0.09	2.31	0.63	0.76	0.26	0.17	1.53	1.64	0.61	0.27	2.23	0.39
25	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.47	2.67	1.05	3.39	0.00	0.00	2.07	0.25	4.12	2.65	0.41	2.12	0.00	0.92	3.16	0.00	1.45	0.00	1.09	0.00	0.98	0.00	0.62	0.74	0.98	0.54	0.63	2.03	0.43
26	E4_Aa	NovelBoundary	0	8.02	4.85	6.40	0.00	0.00	1.96	0.00	2.54	0.00	2.00	0.00	0.00	1.97	5.81	0.00	0.00	2.75	0.00	16.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	2.44	0.00	0.00
27	ER4a	ExonRegion	0	2.65	4.74	6.54	0.00	0.00	2.72	2.33	0.00	7.20	5.15	2.17	1.69	1.33	6.73	1.58	4.25	5.30	5.07	2.13	1.98	4.29	1.50	0.69	1.21	8.43	6.14	13.52	3.29	4.53
28	E4_Da	KnownBoundary	0	5.66	3.78	2.69	0.00	0.00	1.57	2.92	0.00	9.35	10.55	2.94	0.00	0.00	6.76	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E4a_E5a	KnownJunction	0	2.36	4.27	3.84	0.00	0.00	5.14	0.00	0.00	0.00	3.79	0.00	1.54	1.78	3.57	0.00	0.00	3.29	4.62	0.00	0.00	3.57	0.00	0.00	2.93	5.30	2.10	2.24	6.87	0.00
30	E4a_E6a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.23	0.00	2.16	0.00
31	ER4b	ExonRegion	0	2.25	2.34	0.91	0.00	0.00	2.14	0.68	0.00	4.21	5.48	0.65	1.89	0.00	3.06	0.00	0.00	0.87	0.00	8.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.70	0.00	0.03	0.00	0.00
32	E4_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.17	0.00	6.67	2.04	0.00	1.54	1.24	0.00	0.00	3.82	1.40	0.00	0.00	0.00	3.29	0.00	0.00	2.21	5.38	0.00	0.00	0.00	0.00
33	Ix	Intron	0	0.69	1.97	2.15	5.38	0.00	0.74	1.73	0.20	3.00	0.62	0.51	1.19	0.83	1.31	2.07	0.53	0.80	0.83	1.71	0.59	0.92	0.00	0.39	0.00	1.53	0.67	0.00	1.75	0.00
34	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.69	1.97	2.15	5.38	0.00	0.74	1.73	0.20	3.00	0.62	0.51	1.19	0.83	1.31	2.07	0.53	0.80	0.83	1.71	0.59	0.92	0.00	0.39	0.00	1.53	0.67	0.00	1.75	0.00
35	ER5a	ExonRegion	0	3.24	4.97	8.07	0.00	0.00	3.56	2.78	0.05	7.03	3.87	1.31	0.31	0.87	4.50	2.08	1.21	3.90	4.44	2.96	6.14	2.34	0.54	0.03	1.69	7.39	1.50	4.46	7.37	2.77
36	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	1.80	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	16.74	0.00	2.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	1.42
37	E5a_E6a	KnownJunction	0	2.36	4.85	1.20	0.00	0.00	1.42	4.52	0.00	0.00	2.96	1.58	0.00	3.38	0.00	0.00	0.00	1.10	14.64	0.00	3.97	3.97	2.33	0.00	3.05	10.34	6.57	13.22	0.00	3.57
38	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.54	0.41	1.35	4.86	0.00	0.29	0.26	0.47	2.64	2.08	0.10	0.31	0.49	1.36	2.80	1.16	1.14	0.33	0.68	0.82	0.60	0.00	0.15	0.36	0.61	0.47	0.16	1.10	0.62
39	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	3.96	4.99	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	3.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.58	0.00
40	ER6a	ExonRegion	0	3.06	6.83	4.47	3.62	0.00	5.24	3.47	0.87	0.63	4.49	3.48	2.57	1.63	2.86	0.00	3.53	4.25	7.00	4.26	1.89	2.98	0.30	0.90	2.90	11.87	0.98	2.94	4.12	2.51
41	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.17	0.00	0.00	3.91	0.00	0.00	11.36	12.90	1.30	1.87	0.00	4.43	0.00	0.00	2.23	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	5.98	3.56	1.72	0.00	0.00	0.00
42	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	13.19	7.87	0.00	0.00	10.17	4.58	0.00	0.00	2.04	3.10	1.87	0.00	2.30	0.00	0.00	2.09	4.62	16.18	0.00	1.80	0.00	0.00	5.92	7.16	0.00	4.82	0.00	3.63
43	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	3.14	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	16.34	6.81	0.00	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.98	0.00
44	ER7a	ExonRegion	0	1.23	5.06	9.53	0.00	1.22	7.10	3.04	0.00	3.08	4.05	3.71	1.72	1.00	2.78	0.00	0.87	4.98	3.85	3.64	0.14	5.96	0.92	0.03	2.82	11.18	2.29	14.59	0.00	1.34
45	E7_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.61	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	E7a_E8a	KnownJunction	0	2.77	4.75	10.71	0.00	6.78	7.29	2.75	0.00	5.82	6.11	0.00	4.13	1.91	3.10	0.00	3.60	8.73	0.00	0.00	0.00	2.05	2.48	0.00	2.99	10.00	9.66	15.31	4.99	0.00
47	E7a_E9a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.70	0.00	0.00	0.00	0.00
48	Ix	Intron	0	1.65	1.27	1.73	3.15	0.43	0.73	0.53	0.24	4.01	2.67	0.92	0.73	0.68	2.24	2.52	1.47	2.10	0.52	1.05	0.55	1.13	0.52	0.28	0.71	0.88	0.45	0.00	2.58	0.56
49	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.21	2.45	0.65	6.87	1.59	0.45	0.00	0.00	2.74	3.05	0.64	0.70	0.57	1.03	1.50	0.40	0.99	0.63	0.88	0.00	0.73	0.00	0.00	0.70	0.69	0.00	0.00	1.59	0.32
50	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.90	1.11	1.93	2.61	0.25	0.78	0.62	0.29	4.27	2.65	0.97	0.75	0.71	2.46	2.72	1.67	2.31	0.51	1.10	0.64	1.21	0.61	0.33	0.72	0.92	0.53	0.00	2.78	0.60
51	E8_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	2.92	0.00	1.28	7.71	0.00	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00	4.23	0.00	0.00	0.00	4.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
52	ER8a	ExonRegion	0	0.55	4.34	7.62	0.00	2.81	5.65	2.37	0.00	5.84	3.12	2.46	4.29	1.05	7.37	0.00	3.22	5.38	2.42	2.63	0.14	2.12	0.81	0.03	4.37	11.69	3.90	17.05	5.99	0.41
53	E8_Da	NovelBoundary	0	0.00	3.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.03	1.60	0.00	0.00	1.94	2.17	0.00	3.29	1.98	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
54	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.74	0.00	0.00	5.87	5.32	0.00	0.00	0.00	2.85	1.33	1.62	10.92	0.00	6.58	2.63	4.62	0.00	0.00	3.45	1.90	0.00	8.19	11.86	4.08	0.00	4.00	2.64
55	Ix	Intron	0	0.40	1.62	0.32	2.71	0.00	0.78	0.51	0.00	2.96	2.18	0.30	0.43	0.00	0.94	0.87	0.47	1.88	0.24	1.00	0.00	1.70	0.23	0.00	1.08	0.27	0.20	0.00	0.82	0.38
56	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.34	1.69	0.33	2.82	0.00	0.80	0.53	0.00	2.97	2.18	0.31	0.44	0.00	0.97	0.91	0.49	1.96	0.25	1.05	0.00	1.74	0.24	0.00	1.13	0.28	0.21	0.00	0.85	0.39
57	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	2.98	2.26	0.00	0.04	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
58	E9_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.25	3.56	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.08	0.00	0.00	0.00	4.58	1.91
59	ER9a	ExonRegion	0	1.04	8.38	3.82	5.18	0.64	6.32	1.15	0.00	7.96	4.31	0.87	2.51	0.35	6.25	3.62	3.76	3.54	7.96	6.58	2.93	4.85	2.10	2.08	2.52	9.05	2.32	10.04	2.60	2.84
60	E9_Da	KnownBoundary	0	5.78	9.70	3.54	10.78	0.00	3.41	0.00	0.00	6.03	3.60	0.00	1.84	0.00	6.98	0.00	0.00	6.26	4.62	8.09	8.27	5.70	0.00	4.73	0.00	8.98	0.00	2.44	2.29	0.00
61	ER9b	ExonRegion	0	5.44	6.76	2.57	8.60	1.54	5.65	3.57	1.92	6.28	3.83	1.61	3.08	2.70	4.44	3.56	4.26	5.91	6.61	6.77	3.04	5.62	0.93	2.12	2.70	5.35	2.30	3.09	5.51	2.44