Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	TFAP2E	Gene	0	3.60	5.00	3.74	4.68	2.62	5.64	3.90	1.03	5.33	3.93	2.08	2.60	3.78	6.76	6.85	9.33	17.15	3.75	6.33	5.58	5.78	2.86	3.08	6.01	3.76	4.61	1.83	3.23	1.87
2	263543	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
3	373235	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
4	ER1a	ExonRegion	0	2.75	0.50	1.09	0.00	0.00	1.73	1.31	0.40	1.22	1.25	0.00	0.00	0.00	2.06	2.60	6.13	9.13	5.57	1.29	1.20	0.93	0.39	0.00	1.87	0.93	0.68	0.00	1.05	0.00
5	E1_Da	NovelBoundary	0	2.89	0.00	1.45	0.00	0.00	1.96	2.52	0.00	1.49	5.87	0.00	0.00	0.00	5.69	9.77	0.00	14.38	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	0.00	2.69	3.37	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.97	0.00	1.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix	Intron	0	1.22	4.33	0.00	0.00	0.00	5.48	1.72	0.00	1.28	4.94	0.00	0.53	0.37	3.35	4.44	3.53	16.16	5.03	0.00	0.57	2.03	1.03	0.00	0.61	2.44	0.00	0.00	0.46	0.76
8	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.24	4.38	0.00	0.00	0.00	5.55	1.74	0.00	1.29	4.98	0.00	0.53	0.37	3.39	4.49	3.57	16.34	5.09	0.00	0.57	2.05	1.04	0.00	0.62	2.47	0.00	0.00	0.47	0.77
9	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.69	2.12	0.00	1.31	1.96	0.00	0.00	0.00	1.99	8.37	6.96	7.92	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	0.00	1.68
10	ER2a	ExonRegion	0	0.47	0.00	0.53	0.76	1.03	1.77	0.64	0.19	0.59	0.46	0.13	0.00	0.14	1.68	2.71	3.93	5.60	1.63	1.90	0.21	1.20	0.38	0.19	0.91	0.32	0.50	0.00	0.52	0.00
11	E2_Da	NovelBoundary	0	10.56	8.43	3.09	0.00	0.00	3.76	12.70	2.14	14.50	5.47	5.09	0.00	4.43	6.82	28.10	15.68	21.54	4.62	8.09	15.46	2.05	21.29	0.00	5.68	5.53	3.26	2.24	0.00	7.59
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	8.37	10.48	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	0.48	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85	1.83	2.97	1.31	0.00	1.57	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	2.64	0.00	0.00	0.44	0.00
14	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	6.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.75	3.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.72	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.32	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.41	1.42
16	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.35	0.00	1.22	6.03	0.00	0.00	3.22	3.04	0.00	2.75	8.08	4.62	0.00	3.39	0.00	1.90	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	5.53	0.00
17	ER4a	ExonRegion	0	6.10	3.14	3.15	3.74	2.81	3.00	5.88	1.26	3.70	4.36	1.36	2.13	3.85	5.69	3.64	5.75	12.70	1.84	3.65	8.77	2.71	6.81	2.78	5.41	4.30	3.23	0.42	5.47	0.90
18	E4_Da	NovelBoundary	0	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	2.75	2.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.49	0.00
19	E4a_E5a	KnownJunction	0	3.01	4.75	7.35	10.57	7.37	6.91	2.46	0.00	2.74	3.71	0.00	1.54	0.00	7.71	8.37	3.67	15.44	0.00	0.00	11.50	3.21	8.95	8.72	0.00	3.86	3.91	0.00	3.82	3.37
20	Ix	Intron	0	0.78	1.17	0.34	0.58	0.20	0.89	0.08	0.30	1.93	1.17	0.05	0.80	0.00	1.46	3.12	1.81	6.34	0.96	0.91	0.56	1.33	0.51	0.15	2.09	0.46	0.06	0.00	0.53	0.41
21	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.02	0.00	0.40	1.70	0.00	0.60	0.00	0.44	1.25	1.32	0.00	0.00	0.00	1.00	4.77	0.00	3.84	0.00	0.00	0.00	1.98	1.68	0.00	1.86	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00
22	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.14	2.99	0.66	0.95	0.00	1.27	0.00	0.24	2.44	1.79	0.00	0.67	0.00	2.14	3.53	2.30	8.25	2.04	0.42	1.10	2.30	0.50	0.00	3.37	0.46	0.00	0.00	0.61	0.18
23	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.83	1.02	0.32	0.00	0.94	1.32	0.00	0.35	1.95	0.28	0.22	1.37	0.00	1.23	3.00	2.03	7.28	0.80	2.46	1.06	0.82	0.04	0.70	0.80	0.36	0.30	0.00	0.63	0.26
24	E5_Aa	NovelBoundary	0	2.89	0.00	0.95	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	4.75	1.64	0.00	0.00	0.00	1.97	7.57	9.64	8.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.46	0.00	1.78	1.59	0.00	3.64	0.00
25	ER5a	ExonRegion	0	1.82	3.09	4.60	1.97	3.10	1.89	2.10	2.58	4.96	1.72	0.00	2.95	2.61	10.56	13.27	9.48	15.63	2.48	3.99	6.52	5.43	7.77	4.36	2.77	2.46	6.70	0.78	2.82	1.58
26	E5a_E6a	KnownJunction	0	3.01	0.00	5.66	0.00	0.00	0.00	5.21	2.24	3.11	0.00	0.00	2.80	3.15	5.54	16.74	3.06	15.33	0.00	0.00	2.98	0.00	9.43	9.36	0.00	1.48	9.66	0.00	2.20	3.04
27	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	1.23	0.00	1.73	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	2.98	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	ER6a	ExonRegion	0	2.05	4.26	3.65	3.09	1.75	5.84	4.37	2.46	5.79	3.11	1.75	2.80	5.31	10.18	9.90	9.46	23.96	4.19	3.47	3.27	2.73	2.21	8.29	2.32	2.48	8.58	0.89	4.34	2.40
29	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.21	2.17	0.00	0.00	8.28	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	0.00
30	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	8.82	3.94	21.57	0.00	12.43	5.21	0.00	4.87	3.95	4.81	1.54	6.69	8.88	0.00	11.17	19.99	23.12	0.00	25.39	7.62	2.67	0.00	0.00	0.00	13.56	7.45	2.29	3.37
31	Ix	Intron	0	1.37	0.46	0.36	1.02	0.00	1.66	1.00	0.13	0.67	0.82	0.51	1.40	0.14	1.41	0.72	0.53	8.25	1.23	0.91	0.59	2.42	0.00	0.00	0.46	0.81	0.00	0.00	0.69	0.28
32	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.37	0.46	0.36	1.02	0.00	1.66	1.00	0.13	0.68	0.82	0.51	1.40	0.14	1.41	0.72	0.53	8.26	1.23	0.91	0.59	2.43	0.00	0.00	0.46	0.81	0.00	0.00	0.69	0.28
33	Ix	Intron	0	1.75	0.00	0.00	0.00	0.57	0.48	0.47	0.21	2.81	0.84	0.00	0.14	0.00	2.32	2.90	1.45	5.40	0.67	1.86	0.64	2.00	0.00	0.21	1.26	1.50	0.37	2.35	0.57	0.00
34	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.76	0.00	0.00	0.00	0.57	0.48	0.47	0.22	2.83	0.85	0.00	0.15	0.00	2.33	2.91	1.45	5.43	0.68	1.87	0.65	2.01	0.00	0.21	1.27	1.51	0.37	2.36	0.57	0.00
35	E7_Aa	NovelBoundary	0	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	3.68	8.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	8.55	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	2.63	1.93	0.00	0.00	2.11	0.00
36	ER7a	ExonRegion	0	5.48	9.78	6.32	8.92	4.26	9.98	6.13	1.21	9.43	6.93	4.21	4.78	6.73	10.14	9.82	14.09	26.23	5.14	11.51	9.24	10.87	3.44	4.62	11.15	6.55	7.45	3.96	4.68	3.60