Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-438F14.2	Gene	0	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.33	0.05	0.00	0.00	0.14	52.36	20.22	17.90	0.47	1.84	0.00	2.08	1.04	7.28	4.70	24.21	2.29	0.77	0.19	0.00
2	438623	Transcript	0	0.00	4.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	78.75	20.03	16.53	0.38	1.22	0.00	2.36	1.49	8.94	6.61	30.33	2.19	0.64	0.13	0.00
3	436515	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.74	1.41	0.00	0.43	0.00	0.19	0.00	0.55	0.44	1.38	0.00	0.00	0.00	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	2.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	56.38	14.77	7.54	0.00	0.00	0.00	0.41	3.03	6.46	7.16	23.65	2.64	0.91	0.00	0.00
5	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.82	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	2.19	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	83.71	3.82	12.02	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	9.41	6.10	35.23	0.00	0.00	0.00	0.00
7	I1	Intron	0	0.08	0.44	0.00	0.00	0.38	0.03	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.04	3.65	4.93	2.25	0.15	0.44	0.00	0.14	0.00	0.95	0.84	3.08	0.58	0.00	0.03	0.00
8	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.09	0.45	0.00	0.00	0.39	0.03	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.04	3.74	4.93	2.28	0.15	0.45	0.00	0.14	0.00	0.98	0.86	3.11	0.60	0.00	0.03	0.00
9	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.85	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.70	0.00	0.00	0.00	0.00
10	I1	Intron	0	0.12	0.34	0.00	0.82	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	2.87	5.15	2.69	0.18	0.31	0.00	0.41	0.03	0.73	0.41	3.04	0.12	0.00	0.03	0.00
11	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.62	0.00	0.00	0.00	0.00
12	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.17	0.25	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	2.49	4.01	3.30	0.15	0.00	0.00	0.44	0.00	0.84	0.50	3.98	0.24	0.00	0.13	0.00
13	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.41	0.00	0.00	6.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.72	4.05	0.81	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.70	0.42	5.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.08	0.50	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	3.11	6.47	3.09	0.20	0.56	0.00	0.50	0.06	0.82	0.45	2.75	0.11	0.00	0.00	0.00
15	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.37	6.43	2.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	1.97	0.00	0.00	0.00
16	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	70.27	24.83	26.41	0.31	2.51	0.00	2.25	1.40	12.50	8.69	46.67	4.77	1.22	0.26	0.00
17	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E2a_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER2b	ExonRegion	0	0.00	5.68	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	96.15	41.50	30.03	1.14	3.65	0.00	4.63	1.43	10.97	6.56	32.11	3.94	1.02	0.39	0.00
20	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER2c	ExonRegion	0	0.00	5.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.22	0.00	0.00	0.67	55.21	21.17	20.10	0.78	1.19	0.00	2.20	0.97	6.29	2.66	20.03	0.80	1.02	0.21	0.00
22	E2_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	69.36	13.85	16.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	8.68	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER2d	ExonRegion	0	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	2.34	1.47	2.82	0.00	0.87	0.00	0.39	0.00	1.11	0.88	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00
24	IG48_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	2.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.61	0.00	0.00	0.00	0.00