Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-504P24.4	Gene	0	0.64	1.44	0.50	1.07	0.00	0.61	1.20	0.27	0.00	0.21	1.07	0.55	0.00	0.34	2.74	1.11	0.44	0.57	1.43	0.41	0.85	0.27	0.00	0.00	0.64	0.23	0.27	0.24	0.00
2	327086	Transcript	0	0.41	0.92	0.32	0.68	0.00	0.39	1.35	0.18	0.00	0.48	0.97	0.67	0.00	0.22	1.66	0.72	0.28	1.30	0.91	0.95	0.54	0.17	0.00	0.54	0.41	0.48	0.17	0.87	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	2.04	4.61	1.59	3.42	0.00	1.97	3.84	0.88	0.00	0.53	1.78	1.77	0.00	1.08	2.46	2.37	1.42	1.22	4.57	0.26	2.72	0.86	0.00	0.00	2.04	0.10	0.87	0.11	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	16.75	3.78	1.52	30.84	24.32	24.02	28.44	24.98	0.00	15.06	7.62	2.98	3.31	6.56	42.06	18.05	12.04	27.74	40.46	26.63	19.65	0.00	0.00	5.56	3.71	0.00	0.00	1.71	2.05
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	1.72	1.33	1.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	3.39	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	1.63	0.00	3.55	0.00
6	E1a_E3a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
7	Ix	Intron	0	4.86	6.46	0.79	7.26	4.14	4.86	4.84	4.86	2.51	6.70	2.70	3.10	0.96	4.58	4.58	8.36	11.92	3.39	7.97	2.68	4.83	0.15	0.37	1.03	2.88	0.87	0.52	3.05	0.81
8	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.26	3.16	0.00	0.00	0.00	3.11	0.11	0.14	0.00	2.59	0.13	0.39	0.00	0.37	1.14	4.50	0.24	1.72	5.70	0.42	1.82	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	10.16	3.63	0.33	14.23	7.75	8.63	9.57	10.94	1.56	8.92	3.75	3.47	0.64	7.19	6.52	12.21	12.39	4.99	12.75	7.41	7.27	0.00	1.44	1.71	2.20	1.56	1.45	4.21	0.66
10	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	17.00	16.14	2.34	34.57	12.17	12.27	14.94	34.33	7.87	16.29	4.83	5.01	3.03	12.35	28.34	25.03	19.31	7.25	23.68	9.75	11.36	0.25	1.01	6.89	10.47	3.07	1.95	10.21	4.20
11	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	3.72	5.73	1.26	6.61	3.23	5.41	5.03	2.61	1.54	7.37	2.68	2.72	0.98	4.55	2.15	7.82	13.02	2.35	6.08	2.88	5.65	0.40	0.35	0.61	3.15	1.03	0.65	2.83	0.91
12	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	3.15	15.07	0.00	0.00	0.00	2.02	0.95	1.84	2.18	7.56	0.07	3.42	0.00	3.41	0.00	5.06	11.31	2.09	0.00	0.17	1.43	0.00	1.81	0.00	2.19	0.00	0.00	1.63	4.03
13	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	6.34	8.79	0.77	7.39	4.81	6.32	4.15	2.63	2.57	5.94	1.59	4.27	1.58	5.43	2.84	9.61	12.13	5.99	10.48	1.69	3.79	0.00	0.71	0.00	2.50	0.31	0.42	3.00	0.24
14	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	3.16	5.86	0.39	1.83	4.22	2.72	3.06	1.48	2.59	3.97	2.06	2.56	0.81	3.39	3.23	5.73	10.39	2.89	7.48	1.81	4.17	0.00	0.08	0.24	0.91	0.54	0.00	2.51	0.19
15	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	2.82	7.58	0.00	2.11	1.30	2.12	3.36	1.57	1.71	5.97	2.09	3.30	0.00	2.53	3.23	6.51	10.94	3.70	4.72	0.60	2.85	0.00	0.00	0.75	2.87	0.06	0.00	0.93	0.26
16	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	5.99	9.90	0.00	5.96	4.98	6.36	4.36	2.86	2.34	8.24	6.53	4.64	1.13	2.26	3.38	4.09	20.09	3.94	4.62	1.33	5.27	0.00	0.00	3.65	4.22	0.94	0.55	1.76	0.00
17	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	1.73	0.00	0.00	0.00	3.27	1.25	0.00	0.65	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.68	0.00	0.71	0.00
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	Ix	Intron	0	5.35	11.75	0.00	7.67	2.44	4.81	4.74	2.50	6.59	3.19	0.93	2.29	0.46	4.51	2.95	8.88	10.86	4.86	7.52	3.12	3.97	0.00	0.13	0.92	1.02	0.11	0.00	1.16	1.14
20	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.36	11.79	0.00	7.69	2.45	4.82	4.76	2.50	6.61	3.20	0.94	2.29	0.46	4.52	2.95	8.90	10.89	4.87	7.54	3.13	3.98	0.00	0.13	0.92	1.02	0.11	0.00	1.17	1.15
21	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00