Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-275I14.1	Gene	0	3.68	1.23	1.43	2.73	2.79	3.41	0.96	0.88	3.79	3.86	1.82	1.35	0.00	2.15	2.89	1.35	4.27	2.39	0.91	1.28	3.26	0.17	0.00	0.82	2.04	0.30	0.87	1.86	1.34
2	440540	Transcript	0	1.40	0.47	0.55	1.04	1.06	1.60	1.35	0.74	1.47	1.82	0.69	0.79	0.00	0.82	1.10	0.51	1.62	1.33	0.39	0.49	1.56	0.07	0.00	0.79	1.09	0.11	0.33	0.71	0.51
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.06	0.46	1.42	0.10	1.25	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	0.14	0.00	1.10	0.00	0.00	1.66	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	4.85	1.05	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	8.89	11.30	7.09	2.59	1.21	2.19	19.93	3.67	7.95	5.39	8.09	0.00	7.94	0.00	2.36	2.81	1.93	0.00	2.53	0.00	2.01
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	4.34	9.47	0.64	2.29	3.96	3.43	2.06	1.45	6.26	10.65	2.99	2.72	2.28	5.39	9.83	3.73	8.02	8.01	5.99	1.40	6.63	1.19	1.16	5.45	3.87	2.11	5.19	3.02	3.26
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.50	0.51	0.00	0.65	0.00	0.00	9.55	1.34	1.00	9.63	3.99	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.22	0.00	0.00
8	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.92	8.80	0.19	2.06	3.05	4.87	2.69	0.94	6.43	13.66	3.86	3.62	2.54	5.05	14.86	5.45	9.19	11.25	6.55	2.12	8.72	1.05	0.84	5.64	4.54	1.26	5.08	3.32	2.96
9	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	4.14	9.85	0.84	2.42	4.38	2.85	1.82	1.69	6.22	9.47	2.65	2.36	2.19	5.59	7.69	3.03	7.59	6.61	5.78	1.10	5.80	1.26	1.30	5.43	3.61	2.50	5.29	2.93	3.43
10	Ix	Intron	0	6.81	6.75	1.82	1.87	6.80	5.50	3.33	0.96	4.12	12.25	4.35	3.00	1.58	6.55	9.00	5.89	9.81	5.00	6.12	3.28	5.59	0.55	0.94	3.93	5.78	2.12	2.95	2.41	1.80
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	6.66	7.15	1.85	1.51	7.45	5.86	3.39	1.07	4.48	12.61	4.20	2.92	1.67	7.04	9.34	6.25	10.76	5.14	5.72	3.28	5.93	0.66	1.05	4.07	6.62	2.40	3.38	2.83	2.07
12	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.60	4.90	1.70	3.64	3.72	3.84	3.07	0.47	2.41	10.62	5.13	3.44	1.15	4.25	7.47	4.23	5.30	4.40	8.11	3.30	3.98	0.00	0.46	3.27	1.81	0.79	0.93	0.41	0.51
13	E2_Aa	NovelBoundary	0	12.33	8.82	0.00	0.00	7.37	3.45	2.63	3.88	13.28	18.93	22.40	1.42	0.00	12.67	16.74	9.87	9.18	4.62	8.09	13.48	0.00	2.48	0.00	8.13	6.74	0.00	0.00	6.29	1.65
14	ER2a	ExonRegion	0	4.20	1.40	1.64	3.12	3.19	3.74	1.03	0.80	4.31	4.22	2.07	1.41	0.00	2.46	3.30	1.54	4.87	2.51	1.02	1.46	3.57	0.20	0.00	0.70	2.18	0.34	1.00	2.12	1.53