Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C1orf69	Gene	0	6.10	13.03	9.92	2.99	4.32	10.13	3.02	8.95	8.30	14.70	7.50	8.26	11.53	13.67	9.73	6.17	13.78	16.82	12.78	3.60	9.98	8.11	12.04	13.71	10.48	17.33	6.93	12.05	12.43
2	366711	Transcript	0	10.08	4.87	4.91	11.19	13.47	8.71	10.31	16.53	5.32	8.33	5.64	8.62	14.94	20.06	2.12	4.51	13.64	16.52	17.93	1.32	7.05	18.19	18.35	10.88	6.36	8.78	3.70	10.71	9.15
3	484749	Transcript	0	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.04	0.08	0.09	0.27	0.00	0.12	0.01	0.15	0.10	0.05	0.31	0.21	0.17	0.04	0.26	0.02	0.16	0.00	0.05	0.14	0.58	0.05	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	5.71	1.21	2.73	0.81	0.86	9.95	5.17	7.23	2.26	3.72	2.22	5.24	7.63	10.27	4.25	6.11	7.01	9.93	3.48	2.64	6.67	11.48	11.39	5.12	2.08	6.32	0.54	4.84	5.00
5	E1a_E3a	KnownJunction	0	14.45	8.53	7.10	21.57	26.08	7.48	15.45	25.83	8.37	12.94	9.05	11.99	22.26	29.84	0.00	2.91	20.26	23.12	32.37	0.00	7.42	24.89	25.31	16.63	10.65	11.24	6.86	16.58	13.30
6	ER2a	ExonRegion	0	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.09	0.16	0.18	0.54	0.00	0.24	0.03	0.30	0.20	0.11	0.62	0.42	0.35	0.09	0.53	0.04	0.32	0.00	0.09	0.27	1.16	0.11	0.00
7	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.32	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER3a	ExonRegion	0	14.78	10.88	14.81	3.79	6.23	13.72	6.35	23.08	3.50	19.91	9.12	12.59	29.84	23.12	7.92	5.64	18.32	40.85	14.22	7.15	11.07	28.28	29.60	11.32	8.82	22.81	5.18	11.95	14.79
10	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.57	0.00	7.46	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.86	0.00	0.00	4.91	0.00	8.09	0.00	1.72	0.00	2.41	6.10	3.86	5.36	0.00	2.16	0.00
11	E3a_E4a	KnownJunction	0	16.52	12.99	24.02	9.49	6.78	15.23	5.38	45.09	5.91	17.74	10.44	12.80	19.27	28.12	0.00	0.00	31.47	52.40	8.09	6.78	11.51	27.95	26.59	21.06	18.87	37.38	9.19	6.74	13.37
12	E4_Aa	NovelBoundary	0	6.02	0.00	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	1.72	1.61	1.87	1.27	1.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	3.14	3.77	0.00	0.00	0.00	0.00	4.21	0.00	2.29	0.00
13	ER4a	ExonRegion	0	7.57	17.97	13.29	4.03	5.81	13.18	3.72	11.24	11.48	19.63	10.14	10.84	14.62	17.77	13.20	8.19	18.20	21.40	17.24	4.63	13.19	9.64	15.08	18.73	14.38	23.20	9.21	16.31	16.76
14	IG29_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	1.04	2.14	2.22	3.56	1.58	1.62	0.65	2.03	3.12	4.65	2.04	2.52	4.52	6.17	4.08	0.98	6.17	2.80	8.91	4.79	1.90	0.87	3.51	4.58	0.89	2.54	2.82	0.92	2.37
15	IG29_SR3	SilentIntergenicRegion	0	1.45	3.67	1.46	3.97	1.10	1.71	0.68	1.90	2.25	2.82	3.86	1.06	1.99	2.83	4.23	0.48	6.81	2.60	7.16	1.12	3.01	1.01	2.43	4.43	2.41	2.90	3.64	1.01	2.98
16	IG29_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	6.74	1.44	1.19	1.24	2.99	8.16	5.60	0.00	5.61	0.00	12.22	5.62	3.14	0.00	0.00	13.55	0.00	4.71	13.19	1.30	8.19
17	IG29_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	1.22	5.47	0.48	2.05	1.40	4.94	0.29	0.53	2.75	1.94	7.02	1.39	2.94	3.53	5.24	1.93	4.67	2.48	6.31	2.33	4.75	1.29	2.32	6.11	1.02	1.75	7.79	2.02	4.85
18	IG29_SR4	SilentIntergenicRegion	0	1.34	0.00	0.24	4.30	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	1.10	0.00	3.19	0.99	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00
19	IG29_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	3.00	1.30	0.42	2.32	0.66	1.85	0.27	3.02	0.45	1.56	0.64	0.50	0.79	3.10	0.62	0.00	1.46	0.78	0.00	2.47	2.39	0.24	1.22	3.77	0.77	0.81	3.46	0.66	0.99
20	IG29_SR5	SilentIntergenicRegion	0	0.54	0.92	0.84	0.00	0.25	1.10	0.91	0.92	1.07	1.81	1.25	0.43	1.10	2.32	2.63	1.46	3.37	1.16	4.01	0.55	3.22	0.18	0.54	4.43	0.79	1.34	1.29	0.49	1.78