Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	TRIM17	Gene	0	4.27	1.28	1.52	1.12	0.97	3.05	1.23	2.41	2.59	5.22	0.90	1.62	1.87	5.27	7.20	7.10	14.40	5.04	0.45	1.40	1.79	1.41	0.59	4.84	3.11	5.01	0.96	1.39	3.15
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15	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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18	ER1d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.23	0.00	0.45	0.62	0.00	2.30	0.00	0.15	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00
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20	E1a_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E1a_E2c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E1a_E2d	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER1e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.76	0.81	0.00	0.30	0.00	0.31	1.77	0.00	1.83	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00
24	E1_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	1.59	0.00	0.00	3.44	5.04	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E1b_E2c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00
26	E2_Aa	NovelBoundary	0	6.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.33	1.23	1.43	2.10	25.71	17.14	7.47	9.25	0.00	0.00	5.54	0.00	1.97	2.51	1.93	3.69	0.00	0.00	0.00
27	ER2a	ExonRegion	0	4.78	0.90	1.49	1.20	1.63	2.88	0.68	2.74	3.31	5.42	0.58	2.07	3.46	5.30	6.50	9.07	15.16	2.41	0.00	1.18	1.90	1.55	0.10	3.40	3.82	8.42	0.68	1.59	5.23
28	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	5.84	1.89	13.79	7.51	1.39	1.30	0.00	9.24	27.51	10.63	8.87	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	3.05	3.75	0.00	2.19	2.29	2.51
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30	E2_Ac	KnownBoundary	0	5.37	0.00	1.25	10.78	0.00	0.00	0.00	2.49	4.60	2.04	2.78	4.73	4.20	9.51	7.57	3.82	13.24	9.25	0.00	0.00	3.85	0.00	0.00	0.00	1.93	7.51	0.00	0.00	3.63
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32	E2_Ad	KnownBoundary	0	2.60	0.00	2.47	0.00	0.00	1.88	0.00	2.34	0.00	5.35	0.00	0.00	0.00	3.06	7.97	10.33	21.47	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	2.96	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER2d	ExonRegion	0	3.13	2.18	0.72	0.00	0.00	2.65	0.00	0.71	1.29	4.10	0.68	1.59	0.96	5.06	10.95	4.00	12.12	2.64	0.46	0.57	2.66	0.65	0.52	4.34	2.71	3.39	0.26	1.17	1.29
34	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.59	0.00	0.00	1.42	0.00	4.83	0.00	1.80	0.00	0.00	1.40	3.41	15.95	6.96	10.58	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.64	0.00	0.00	2.77
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36	I2	Intron	0	2.06	1.03	0.54	0.00	1.57	2.20	0.00	0.59	1.98	5.09	0.38	1.19	0.83	1.89	12.40	5.92	1.44	0.72	0.00	0.00	1.37	0.58	1.16	4.83	1.38	4.03	0.59	0.00	1.29
37	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	2.99	2.25	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	4.03	0.83	1.73	0.91	1.90	13.50	3.47	0.00	1.57	0.00	0.00	1.00	1.26	1.26	1.50	1.00	0.00	0.00	0.00	0.94
38	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.30	0.00	1.00	0.00	2.97	2.50	0.00	1.12	3.73	6.12	0.00	0.75	0.79	1.91	11.73	8.19	2.72	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	1.10	7.84	1.74	7.63	1.11	0.00	1.63
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40	E3_Ab	NovelBoundary	0	2.65	0.00	1.45	0.00	0.00	1.84	0.00	2.54	9.90	5.79	0.00	1.87	5.45	2.15	34.88	10.33	16.90	4.62	0.00	0.00	5.58	0.00	4.19	11.60	1.93	0.00	0.00	0.00	1.32
41	ER3a	ExonRegion	0	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00	1.03	0.00	1.84	0.42	2.21	0.52	0.00	0.73	1.13	15.93	0.00	4.01	2.64	0.00	0.00	1.96	0.28	0.68	2.29	1.52	0.00	0.00	0.00	0.46
42	ER3b	ExonRegion	0	1.58	3.46	1.59	0.00	0.00	2.59	0.02	1.36	5.30	6.38	1.10	0.00	0.75	4.34	7.78	2.45	10.87	5.66	1.72	0.00	2.45	5.22	1.73	7.70	5.40	8.47	1.97	2.64	3.35
43	E3_Da	NovelBoundary	0	4.72	0.00	1.42	0.00	13.71	7.02	0.00	0.00	6.06	3.87	8.07	5.93	0.00	4.03	32.49	20.27	16.66	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	6.04	3.18	20.90	0.00	0.00	0.00
44	E3a_E4a	KnownJunction	0	2.89	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	0.00	0.00
45	I3	Intron	0	4.67	2.76	2.08	0.56	1.14	5.89	1.73	4.73	5.94	8.77	1.11	2.01	3.22	5.00	14.19	12.73	21.50	6.20	1.99	1.93	4.89	2.81	1.27	9.04	6.68	7.59	2.99	1.65	6.87
46	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.30	1.73	0.00	0.00	2.62	0.74	0.00	3.95	1.81	3.88	2.56	0.99	0.70	4.62	2.48	8.58	8.01	2.07	0.00	2.96	0.77	0.97	0.00	4.62	0.00	10.97	0.00	0.88	0.00
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48	E4_Aa	NovelBoundary	0	5.60	4.56	1.15	0.00	0.00	6.98	5.84	6.67	15.17	24.61	0.00	7.17	3.41	14.80	17.74	28.53	54.52	18.49	0.00	0.00	20.66	0.00	0.00	8.67	13.87	25.58	0.00	0.00	13.77
49	ER4a	ExonRegion	0	8.83	2.01	2.67	3.17	0.00	5.16	3.29	2.85	5.26	6.81	0.26	1.63	3.40	8.56	13.07	9.64	20.93	10.63	0.71	0.61	3.12	1.19	1.59	10.03	5.77	7.27	2.83	1.79	4.11
50	E4_Da	NovelBoundary	0	13.57	0.00	2.19	0.00	0.00	7.56	0.00	2.49	7.13	8.99	1.42	2.62	1.97	6.69	17.94	13.62	21.50	15.28	0.00	0.00	0.00	2.24	2.51	2.69	8.94	7.55	0.00	0.00	3.63
51	E4a_E5a	KnownJunction	0	2.71	3.88	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	3.44	3.67	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
52	I4	Intron	0	4.07	2.56	0.98	2.10	1.43	3.31	3.68	3.50	1.48	6.75	1.39	1.53	2.65	4.24	13.16	10.26	14.29	6.90	2.33	1.61	2.08	0.53	0.26	3.30	5.22	9.07	0.80	2.50	4.69
53	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	4.08	2.57	0.98	2.10	1.43	3.32	3.69	3.51	1.48	6.77	1.40	1.54	2.66	4.25	13.20	10.29	14.33	6.91	2.34	1.62	2.09	0.53	0.27	3.31	5.24	9.10	0.81	2.51	4.71
54	Ix	Intron	0	7.68	0.00	0.46	0.00	1.35	4.93	2.22	4.06	1.85	3.98	0.00	1.52	1.78	3.25	5.57	2.54	10.29	5.31	0.00	1.52	0.39	0.50	0.50	1.78	2.36	6.07	1.01	0.45	1.66
55	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	7.77	0.00	0.47	0.00	1.36	4.98	2.25	4.10	1.87	4.02	0.00	1.54	1.80	3.27	5.63	2.57	10.40	5.37	0.00	1.54	0.40	0.50	0.50	1.79	2.39	6.13	1.02	0.45	1.68
56	E5a_E6a	KnownJunction	0	3.24	0.00	1.20	0.00	0.00	1.84	2.23	0.00	1.55	5.31	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	ER5a	ExonRegion	0	2.14	1.29	1.02	0.00	0.00	1.02	2.72	0.00	3.37	4.14	0.00	0.00	0.11	0.91	0.00	0.00	1.96	0.83	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	0.94	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
58	Ix	Intron	0	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	2.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00
59	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00
60	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.74	0.00	0.00	1.69	2.69	4.53	0.00	3.52	0.00	2.86	1.50	4.36	8.77	0.00	11.61	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.21	0.00	10.26	0.00	0.00	6.47
61	ER6a	ExonRegion	0	5.59	1.23	2.76	0.00	0.00	3.07	1.88	4.05	2.81	6.93	0.24	0.00	2.41	6.92	7.86	12.12	9.10	8.29	1.57	5.03	1.23	0.88	0.00	13.36	1.90	1.83	2.66	0.86	0.25
62	E6_Da	KnownBoundary	0	10.97	0.00	2.22	0.00	0.00	3.22	2.17	4.58	7.19	7.31	1.61	0.00	3.53	11.59	16.14	14.31	12.06	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	19.62	5.34	6.18	0.00	0.00	3.14
63	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
64	E6a_E7b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
65	ER6b	ExonRegion	0	5.28	2.02	1.46	2.29	1.56	5.00	3.04	3.68	3.25	11.02	1.25	1.67	2.66	8.16	10.78	10.77	26.48	9.10	0.76	2.88	2.26	1.89	0.16	9.26	2.43	5.90	0.88	2.35	4.64
66	E6_Db	KnownBoundary	0	5.13	0.00	4.14	0.00	0.00	3.61	2.40	5.08	1.22	13.26	0.00	0.00	3.25	10.21	0.00	9.94	37.73	9.25	0.00	7.44	4.09	4.42	2.51	10.53	6.25	8.02	0.00	4.58	3.76
67	ER6c	ExonRegion	0	7.69	0.00	2.04	0.00	3.19	3.38	6.10	2.38	1.87	7.27	0.00	0.81	0.67	6.50	0.00	9.28	16.32	18.54	1.04	2.59	0.97	1.69	0.53	3.06	1.54	8.30	0.00	0.92	3.34
68	E6_Dc	NovelBoundary	0	5.54	4.56	6.08	10.78	0.00	3.72	7.44	0.00	3.14	4.07	0.00	1.14	0.00	3.83	0.00	5.89	13.24	4.62	0.00	3.31	1.72	0.00	2.46	5.92	3.49	6.27	0.00	4.36	1.42
69	E7_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	1.61	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	3.80	1.97	0.00	2.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
70	E7_Ab	NovelBoundary	0	2.48	0.00	1.00	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	1.98
71	ER7a	ExonRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.72	0.00	2.10	1.22	0.00	0.00
72	ER7b	ExonRegion	0	5.22	1.50	2.40	1.34	1.53	4.17	1.51	3.68	2.14	5.41	1.93	2.19	1.01	6.31	7.36	8.72	17.61	7.42	0.80	2.27	1.78	1.92	1.47	5.64	4.11	3.72	1.60	1.83	3.22