Order SeqName SeqType IsAE ABC_RG012 ABC_RG016 ABC_RG015 ABC_RG046 ABC_RG047 ABC_RG048 ABC_RG049 ABC_RG058 ABC_RG059 ABC_RG061 ABC_RG073 ABC_RG074 ABC_RG086 GCB_RG003 GCB_RG005 GCB_RG006 GCB_RG007 GCB_RG010 GCB_RG014 GCB_RG045 GCB_RG050 GCB_RG055 GCB_RG062 GCB_RG063 GCB_RG064 GCB_RG071 GCB_RG072 GCB_RG069 GCB_RG085 1 C1orf145 Gene 0 0.32 0.09 0.39 0.00 0.13 1.00 0.30 0.53 0.87 0.81 0.03 0.09 0.02 1.39 0.15 0.44 1.57 0.13 0.26 0.00 0.23 0.12 0.27 2.30 0.18 0.28 0.13 0.09 1.17 2 472421 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.52 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 337335 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 432630 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 295012 Transcript 0 0.20 0.00 0.80 0.00 0.45 1.07 0.00 0.34 0.75 0.59 0.00 0.11 0.09 1.07 0.00 0.00 1.06 0.36 0.00 0.00 0.13 0.50 0.67 2.93 0.11 0.00 0.00 0.58 2.67 6 472613 Transcript 0 0.26 0.00 1.15 0.00 0.00 1.06 0.00 1.87 0.86 1.33 0.00 0.00 0.00 3.28 0.00 1.89 1.28 0.00 2.25 0.00 0.41 0.00 0.72 3.13 0.86 0.19 0.00 0.00 0.85 7 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.94 1.12 0.42 0.73 1.09 0.00 0.00 0.00 0.41 0.00 0.71 1.72 0.00 0.00 0.00 0.29 0.82 0.82 1.01 0.12 0.69 0.83 0.00 0.70 10 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 4.56 1.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.37 2.92 0.00 0.00 1.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.10 1.89 0.00 0.00 0.00 1.49 12 E1a_E4c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.23 0.41 0.97 0.15 0.67 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.33 1.16 0.00 0.42 0.00 0.21 0.00 0.24 2.82 0.31 0.62 0.24 0.00 0.83 15 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E2a_E4c NovelJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2_Db NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E2b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 Ix Intron 0 0.77 0.00 1.29 0.00 0.00 2.01 0.50 1.12 0.88 0.88 0.03 0.24 0.07 2.31 0.00 0.80 2.93 0.44 0.71 0.00 0.55 0.75 1.15 6.24 0.12 0.35 0.81 0.00 2.52 21 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.66 0.00 1.36 0.00 0.00 2.19 0.47 1.11 1.10 0.67 0.05 0.24 0.10 2.27 0.00 0.66 3.46 0.53 0.74 0.00 0.61 1.05 1.54 6.08 0.15 0.30 1.06 0.00 2.27 22 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 1.05 0.00 1.12 0.00 0.00 1.58 0.59 1.15 0.35 1.40 0.00 0.24 0.00 2.42 0.00 1.18 1.61 0.22 0.62 0.00 0.42 0.00 0.18 6.65 0.04 0.46 0.18 0.00 3.15 23 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 3.60 4.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.13 0.00 0.00 0.00 0.00 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E3_Da NovelBoundary 0 23.06 0.00 46.59 10.57 6.34 8.90 16.36 2.14 33.04 2.04 0.00 36.26 9.39 19.43 16.34 7.11 134.02 0.00 0.00 11.91 4.01 0.00 0.00 8.37 5.64 10.47 0.00 5.98 17.10 26 E3a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E4_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.82 1.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.93 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 28 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 1.48 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER4b ExonRegion 0 0.36 0.14 0.28 0.00 0.00 0.59 0.34 0.08 1.40 0.66 0.10 0.10 0.00 1.25 0.47 0.53 2.13 0.16 0.00 0.00 0.30 0.00 0.08 2.04 0.06 0.47 0.16 0.00 0.45 31 E4_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.88 0.00 1.39 0.00 1.11 0.00 0.00 3.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER4c ExonRegion 0 0.89 1.34 0.84 0.00 0.00 3.64 0.84 2.29 1.67 2.22 0.00 1.32 0.00 6.64 0.00 2.12 5.61 0.00 0.55 0.00 0.51 0.00 1.00 7.17 1.19 0.03 0.00 0.00 1.42 33 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.96 0.00 0.00 0.00 1.95 0.00 3.75 6.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.36 7.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.02 0.00 0.00 1.96 0.00 0.00 1.28 3.95 0.00 0.00 0.00 2.75 0.00 3.75 0.95 0.00 8.09 0.00 1.52 0.00 0.00 2.87 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 35 ER4d ExonRegion 0 0.52 0.00 0.19 0.00 0.00 1.07 0.24 0.66 0.54 0.93 0.00 0.00 0.00 1.41 0.00 0.49 0.80 0.12 0.38 0.00 0.26 0.00 0.07 1.72 0.00 0.00 0.00 0.00 1.57 36 E4_Db NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.55 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 ER5a ExonRegion 0 1.05 0.00 2.07 0.00 0.00 0.54 0.00 0.74 0.68 1.37 0.00 0.00 0.00 3.20 0.00 0.44 1.67 0.00 0.91 0.00 0.10 0.00 0.63 6.95 1.64 0.77 0.00 0.00 0.41 38 E5_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.52 0.00 0.00 1.73 0.00 6.72 1.46 0.00 0.00 0.00 0.00 7.16 0.00 0.00 2.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.27 2.69 1.82 0.00 0.00 0.00 1.32 40 E6_Aa NovelBoundary 0 2.48 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.75 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.05 41 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 0.94 0.00 3.78 2.46 0.29 0.00 0.00 0.00 4.79 0.00 0.00 2.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 1.51 0.90 0.00 0.00 0.00 3.08 42 E6_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 2.26 0.00 0.00 2.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.40 43 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.93 0.00 0.00 0.92 2.09 0.00 0.00 0.37 1.94 0.00 0.00 3.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.23 0.00 0.00 0.30 3.20 44 E6_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.88 0.00 0.00 1.28 2.04 0.00 0.00 1.43 0.97 0.00 0.00 4.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.51 1.48 0.00 0.00 1.80 4.56 45 ER6c ExonRegion 0 0.20 0.00 0.80 0.00 0.45 1.07 0.00 0.34 0.75 0.59 0.00 0.11 0.09 1.07 0.00 0.00 1.06 0.36 0.00 0.00 0.13 0.50 0.67 2.93 0.11 0.00 0.00 0.58 2.67 46 IG29_SR5 SilentIntergenicRegion 0 0.54 0.92 0.84 0.00 0.25 1.10 0.91 0.92 1.07 1.81 1.25 0.43 1.10 2.32 2.63 1.46 3.37 1.16 4.01 0.55 3.22 0.18 0.54 4.43 0.79 1.34 1.29 0.49 1.78 47 IG29_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 3.00 1.30 0.42 2.32 0.66 1.85 0.27 3.02 0.45 1.56 0.64 0.50 0.79 3.10 0.62 0.00 1.46 0.78 0.00 2.47 2.39 0.24 1.22 3.77 0.77 0.81 3.46 0.66 0.99 48 IG29_SR4 SilentIntergenicRegion 0 1.34 0.00 0.24 4.30 0.00 0.00 0.00 1.55 0.00 0.00 2.38 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 1.10 0.00 3.19 0.99 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 49 IG29_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 1.22 5.47 0.48 2.05 1.40 4.94 0.29 0.53 2.75 1.94 7.02 1.39 2.94 3.53 5.24 1.93 4.67 2.48 6.31 2.33 4.75 1.29 2.32 6.11 1.02 1.75 7.79 2.02 4.85 50 IG29_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.75 0.00 0.00 6.74 1.44 1.19 1.24 2.99 8.16 5.60 0.00 5.61 0.00 12.22 5.62 3.14 0.00 0.00 13.55 0.00 4.71 13.19 1.30 8.19 51 IG29_SR3 SilentIntergenicRegion 0 1.45 3.67 1.46 3.97 1.10 1.71 0.68 1.90 2.25 2.82 3.86 1.06 1.99 2.83 4.23 0.48 6.81 2.60 7.16 1.12 3.01 1.01 2.43 4.43 2.41 2.90 3.64 1.01 2.98 52 IG29_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 1.04 2.14 2.22 3.56 1.58 1.62 0.65 2.03 3.12 4.65 2.04 2.52 4.52 6.17 4.08 0.98 6.17 2.80 8.91 4.79 1.90 0.87 3.51 4.58 0.89 2.54 2.82 0.92 2.37