Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AL592300.3	Gene	0	0.55	0.17	0.24	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.21	0.32	0.09	0.00	0.24	0.27	0.17	0.45	1.26	0.21	0.00	0.30	0.16	0.13	0.00	0.24	0.31	1.27	0.47	0.42	0.10
2	500186	Transcript	0	0.28	0.09	0.12	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.10	0.16	0.04	0.00	0.12	0.13	0.09	0.23	0.64	0.11	0.00	0.15	0.08	0.07	0.00	0.12	0.16	0.64	0.24	0.21	0.05
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.87	7.52	3.34	2.93	0.00	1.06	0.00	0.97	1.33	0.96	0.40	0.19	0.00	2.17	9.01	0.00	3.11	0.79	6.52	0.00	2.33	0.32	0.22	0.00	0.69	0.00	0.75	3.31	0.55
6	Ix	Intron	0	5.38	15.34	7.70	6.00	3.53	8.84	6.83	5.82	10.94	7.42	3.94	2.84	1.45	6.90	13.39	8.12	12.33	10.30	13.37	2.95	4.67	0.96	0.34	4.18	7.62	3.17	1.67	4.22	3.25
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.84	0.00	5.45	0.00	0.71	2.16	0.58	2.89	1.61	2.89	0.00	0.71	0.00	2.46	8.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	1.23	0.22	0.00	0.00	0.00
8	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	8.20	7.44	11.44	6.90	8.44	8.41	9.30	10.91	15.49	9.64	2.98	3.18	0.75	8.90	12.87	12.01	12.64	13.59	9.84	5.15	5.22	1.73	0.70	5.77	12.35	3.93	0.00	4.08	1.54
9	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	8.78	10.27	3.05	3.26	2.22	9.39	8.26	8.38	11.23	3.94	3.79	4.48	0.88	4.94	6.70	3.39	10.88	11.40	20.37	1.25	5.85	0.82	0.00	0.98	9.76	0.72	0.83	0.74	2.73
10	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	4.23	18.25	7.23	6.13	2.35	8.95	6.03	4.13	9.73	7.25	4.26	2.57	1.73	6.62	14.37	7.67	12.52	9.34	13.65	2.57	4.42	0.77	0.29	4.14	6.11	3.27	2.25	4.70	3.82
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.37	3.39	0.00	0.00	2.57	3.11	0.00	0.46	0.58	3.93	0.95	0.00	0.00	0.72	0.00	0.00	0.88	1.54	2.76	4.39	4.17	0.00	0.00	1.55	1.14	0.00	0.00	1.17	0.00
12	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	3.88	2.33	0.00	5.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04	0.00	0.00	1.17	0.49	0.00	0.00	0.54	0.70	0.00	0.72	3.10	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.59	0.00
13	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.59	0.61	0.00	0.89	0.61	0.00	1.35	0.64	2.73	0.87	0.04	0.00	1.41	4.54	0.45	2.14	0.70	0.58	0.00	0.78	0.17	0.00	0.79	0.26	0.75	2.30	2.08	0.00
14	Ix	Intron	0	11.00	5.07	5.05	1.08	2.21	11.41	3.95	3.06	1.78	5.45	7.18	2.61	1.86	23.07	4.18	11.73	13.96	10.13	14.46	2.38	9.47	0.27	0.82	6.49	1.29	8.54	0.55	3.44	1.41
15	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	11.05	5.08	5.08	1.09	2.22	11.48	3.98	3.07	1.79	5.48	7.23	2.62	1.87	23.20	4.20	11.79	14.05	10.19	14.55	2.39	9.53	0.27	0.82	6.53	1.30	8.58	0.56	3.46	1.42
16	Ix	Intron	0	7.81	6.95	6.34	4.35	0.99	12.27	2.28	4.69	6.84	7.75	5.62	2.89	2.15	27.60	10.05	11.06	25.87	11.25	7.67	2.23	9.14	1.31	1.32	10.04	4.43	7.14	2.12	7.48	4.51
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	11.78	2.96	9.70	5.38	1.22	10.69	1.12	3.28	1.69	3.88	4.27	3.06	1.11	24.94	7.58	5.24	22.27	11.60	7.23	0.69	6.73	0.00	1.20	3.46	2.70	8.59	1.37	11.61	2.01
18	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	8.55	7.36	6.40	3.82	0.98	13.33	2.39	4.70	5.70	8.51	6.29	2.88	1.70	29.61	9.74	11.46	25.67	11.94	8.28	3.07	8.56	1.54	1.17	9.45	4.82	6.66	2.85	7.02	3.30
19	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.80	14.43	7.40	6.46	0.00	20.53	3.61	5.66	17.64	10.16	6.79	5.32	4.50	42.83	8.94	16.34	48.68	13.90	13.97	1.39	17.77	0.35	2.93	15.93	5.46	8.86	0.64	8.15	6.15
20	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	5.17	7.66	6.95	7.46	0.00	11.24	0.08	5.05	11.41	13.87	2.10	5.34	7.77	36.96	0.00	8.98	54.80	15.41	14.46	0.00	14.01	0.00	7.13	16.03	7.29	9.43	0.00	9.27	6.24
21	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	7.96	6.55	6.48	5.48	0.83	11.51	2.57	6.13	7.27	7.20	5.98	2.62	3.44	23.14	12.65	11.77	28.38	11.62	7.11	0.47	10.75	2.14	0.92	10.62	4.35	11.02	0.47	9.12	9.34
22	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	5.33	2.67	2.08	0.00	2.03	3.99	0.84	3.05	2.79	1.20	0.49	0.51	0.54	9.38	6.10	4.12	4.95	8.39	1.32	0.00	8.88	0.00	0.00	1.78	1.78	1.95	2.28	2.03	0.00
23	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	1.78	5.14	4.17	1.99	1.35	4.95	0.00	1.02	5.91	3.20	0.99	3.58	0.72	11.28	14.00	8.55	12.00	3.29	2.66	4.58	4.74	0.00	1.00	7.75	1.98	2.61	4.06	4.07	4.08
24	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.61	1.87	1.44	5.16	0.00	0.00	10.58	0.00	3.37	10.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	1.05	0.00	1.09	0.00
25	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	5.98	4.08	5.48	5.88	1.59	8.77	2.98	4.82	9.18	8.75	5.81	1.52	1.80	27.49	10.70	11.13	17.28	8.90	4.19	1.81	6.08	1.48	1.48	15.86	4.45	4.89	1.50	8.01	5.16
26	Ix	Intron	0	1.68	1.12	2.19	0.63	1.28	1.44	0.00	3.70	2.99	3.66	1.46	1.02	0.90	3.36	1.22	1.46	3.66	1.57	0.56	0.72	3.74	0.63	1.11	1.31	0.37	1.51	0.00	1.42	0.94
27	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.86	1.24	2.42	0.69	1.42	1.59	0.00	4.09	3.31	4.05	1.61	1.13	1.00	3.72	1.35	1.61	4.04	1.74	0.62	0.80	4.13	0.70	1.22	1.45	0.41	1.67	0.00	1.57	1.04
28	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.13	3.99	0.63	0.00	0.00	2.43	3.20	3.31	3.34	7.02	1.59	0.96	0.00	4.47	11.20	3.59	10.24	1.18	1.89	0.90	0.70	1.46	1.81	2.87	0.95	1.57	6.72	4.09	1.34
29	Ix	Intron	0	0.00	8.42	0.00	0.00	3.19	0.00	0.00	2.41	0.00	6.61	0.00	1.62	0.00	1.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.18	1.41	0.00	1.03	9.58	1.07	0.00
30	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	8.64	0.00	0.00	3.28	0.00	0.00	2.47	0.00	6.78	0.00	1.66	0.00	1.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.21	1.44	0.00	1.05	9.83	1.09	0.00
31	Ix	Intron	0	2.27	5.26	3.18	1.52	0.00	4.95	0.85	1.56	3.56	1.83	1.51	0.79	1.51	5.17	3.11	4.05	5.05	5.30	1.35	0.00	1.21	0.38	0.38	4.55	3.02	0.67	4.65	0.34	0.99
32	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.28	5.28	3.20	1.52	0.00	4.97	0.86	1.56	3.58	1.84	1.52	0.79	1.52	5.19	3.13	4.07	5.08	5.32	1.36	0.00	1.21	0.38	0.38	4.57	3.04	0.67	4.67	0.35	1.00
33	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	1.62	0.00	1.08	0.00	0.68	0.00	1.48	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	2.89	0.00	1.24	0.00	0.91	0.00	2.53	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.73	0.00	0.00	1.77	0.45	0.00	0.37	0.00	0.75	0.00	0.00	2.47	1.28	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.14	0.41	0.67	0.00	0.59	0.89
36	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.27	0.00	1.45	0.00	0.00	0.21	0.25	0.91	0.43	2.87	0.29	0.31	0.16	1.03	3.18	0.31	1.74	0.77	0.00	0.68	0.00	1.54	0.00	0.54	0.98	1.23	0.00	2.02	1.08
37	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	2.23	0.00	1.95	0.00	0.00	2.57	0.00	1.22	0.00	3.89	0.47	0.11	1.02	2.22	6.42	1.97	2.11	1.34	0.91	0.00	0.30	0.32	0.00	1.41	0.00	0.87	0.00	1.44	1.29
38	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.35	0.47	0.69	0.00	0.00	1.41	0.00	2.00	1.49	0.90	0.00	0.57	0.53	1.95	2.86	3.77	2.57	0.79	0.18	0.00	0.72	0.94	0.00	0.58	0.00	0.51	0.00	3.59	0.43
39	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.62	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00
40	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00
41	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	1.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER2a	ExonRegion	0	0.56	0.17	0.25	0.00	0.00	0.10	0.00	0.14	0.21	0.32	0.09	0.00	0.24	0.27	0.17	0.46	1.28	0.21	0.00	0.31	0.16	0.13	0.00	0.24	0.32	1.29	0.48	0.42	0.10
43	IG44_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.45	0.82	0.00	0.00	0.33	1.28	0.71	0.00	0.00	0.54	0.00	0.74	0.89	0.00	0.00	0.00	2.11	0.00	0.00	0.64	1.27	1.40	0.00	0.48	0.00