Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC096632.1	Gene	0	10.25	2.12	3.49	5.31	3.62	2.31	1.22	1.92	1.57	2.09	0.44	0.93	0.24	4.43	4.55	6.18	14.27	4.82	1.94	3.06	0.67	2.37	0.61	2.17	1.68	3.12	1.36	2.63	0.90
2	501099	Transcript	0	5.40	1.08	1.77	2.69	1.83	1.17	0.62	0.97	0.79	1.24	0.22	0.47	0.12	2.40	2.31	3.13	7.23	2.44	1.43	1.83	0.34	1.20	0.31	1.10	0.85	1.58	0.69	1.33	0.46
3	ER1a	ExonRegion	0	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	5.16	0.00	0.00	3.45	0.00	0.00	1.94	1.77	0.00	0.69	0.57	0.00	0.00	0.44	0.00	1.72	0.00	2.78	0.00	1.33	1.37	2.60	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00	1.57	1.29
5	Ix	Intron	0	28.77	25.22	10.56	22.64	18.51	15.84	9.23	12.79	10.00	9.12	5.64	8.57	1.12	18.69	31.38	29.16	25.46	21.55	23.71	17.72	9.46	3.70	3.43	22.76	11.05	5.21	6.36	4.63	7.17
6	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	10.10	7.20	3.10	11.84	6.40	6.68	0.00	3.77	2.84	1.65	0.00	1.12	0.00	4.06	17.87	1.45	9.02	2.99	12.72	5.09	2.72	1.20	0.86	7.48	6.06	0.75	6.63	0.08	1.09
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	30.27	26.65	11.15	23.55	19.48	16.59	9.92	13.51	10.57	9.70	6.07	9.15	1.21	19.84	32.54	31.30	26.77	22.99	24.64	18.72	10.00	3.90	3.63	23.98	11.47	5.55	6.39	4.98	7.65
8	Ix	Intron	0	8.13	3.85	5.26	8.62	2.94	8.64	4.85	3.83	6.40	4.61	2.09	2.05	2.46	6.48	10.08	11.10	10.01	10.97	7.24	5.57	6.07	2.25	0.50	11.54	5.29	3.92	2.29	2.49	3.00
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	8.16	3.86	5.28	8.65	2.95	8.68	4.86	3.84	6.42	4.62	2.10	2.06	2.46	6.50	10.12	11.13	10.04	11.01	7.26	5.59	6.09	2.26	0.50	11.58	5.31	3.94	2.30	2.50	3.01
10	Ix	Intron	0	7.64	1.77	3.67	5.90	0.00	4.90	1.11	3.53	2.62	3.96	0.65	1.18	0.00	6.32	2.53	3.40	3.68	7.48	1.75	2.06	1.96	0.00	0.00	2.95	3.92	0.86	0.00	1.34	0.92
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	7.71	1.79	3.71	5.96	0.00	4.95	1.12	3.57	2.64	4.00	0.66	1.20	0.00	6.39	2.56	3.44	3.72	7.56	1.77	2.08	1.98	0.00	0.00	2.96	3.96	0.87	0.00	1.36	0.93
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	5.39	0.00	5.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.46	2.64	0.85	0.91	1.25	4.03	0.51	0.00	1.43	1.84	0.15	0.00	0.99	2.25	0.00	2.44	1.90	2.01	2.04	0.35	2.73	0.23	0.46	1.65	0.91	1.00	0.00	0.84	1.70
14	Ix	Intron	0	5.75	5.38	4.49	4.81	1.46	5.23	1.65	3.29	2.09	3.88	0.53	1.89	0.53	4.89	6.99	6.98	4.45	8.26	5.00	1.53	4.57	0.94	0.27	3.05	4.58	1.99	0.00	1.58	1.94
15	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.47	8.04	5.31	5.98	1.89	3.11	2.66	1.27	2.77	2.32	1.38	3.12	0.25	7.17	5.81	9.34	4.79	8.02	7.41	1.04	5.77	2.91	0.19	5.26	3.68	1.44	0.00	1.54	3.15
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.70	4.61	4.35	2.68	1.68	5.21	1.52	3.66	2.29	4.89	0.25	1.81	0.74	4.27	6.32	6.20	3.56	7.61	4.70	1.65	4.70	0.58	0.36	2.87	5.59	1.67	0.00	1.74	1.41
17	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.14	4.93	8.42	20.72	0.00	8.48	0.00	12.89	3.00	3.13	1.19	2.47	0.00	9.52	22.40	10.12	8.01	2.73	9.05	2.81	3.57	0.00	0.00	4.30	1.43	8.91	0.00	3.26	4.70
18	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	4.05	5.50	3.90	12.09	0.00	8.11	1.05	3.87	0.29	1.53	0.64	0.58	0.00	4.54	10.92	7.33	7.94	12.11	3.05	1.52	2.58	0.00	0.00	0.88	1.56	3.82	0.00	0.83	2.62
19	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00	1.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	1.60	2.00	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	5.37	3.02	1.57	4.49	0.00	0.86	0.63	1.15	0.70	1.36	1.49	0.00	0.41	1.27	2.89	3.88	0.93	1.91	0.00	1.48	0.89	1.13	0.00	0.67	3.13	0.98	2.87	1.53	0.00
21	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	1.63	5.71	1.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.83	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.99	0.00	0.00	3.10	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.87	1.54	0.95	0.00	9.57	1.70	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	0.66	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	1.07	3.32	2.37	0.00	0.00	2.08	0.00	0.87	0.45
24	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.75	0.75	0.42	0.00	0.00	0.48	0.36	0.08	0.79	2.05	0.83	1.26	1.12	0.84	1.69	1.74	2.09	0.45	0.00	0.04	0.58	4.00	1.26	2.66	1.08	2.38	0.00	0.81	2.43
25	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	6.89	1.52	0.00	0.76	1.07	1.40	1.91	1.13	1.55	0.00	0.58	1.73	2.47	0.00	0.77	3.05	1.20	0.50	2.10	0.89	3.09	1.41	3.49	3.46	5.89	0.00	0.00	3.00
26	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	5.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	5.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	Ix	Intron	0	6.94	1.30	2.03	8.71	1.98	1.67	0.00	0.00	1.36	2.92	0.48	1.75	0.00	5.32	0.00	4.74	6.65	2.34	1.29	4.46	1.73	2.92	0.00	1.74	1.74	2.54	0.00	1.98	2.97
29	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.00	1.31	2.05	8.78	1.99	1.68	0.00	0.00	1.38	2.95	0.49	1.76	0.00	5.36	0.00	4.78	6.70	2.36	1.30	4.50	1.75	2.94	0.00	1.76	1.75	2.56	0.00	2.00	3.00
30	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	4.63	2.04	0.00	2.83	0.00	3.48	9.97	3.44	4.93	4.62	0.00	0.00	0.00	3.89	2.12	5.56	0.00	2.06	0.00	0.00	0.00
31	ER2a	ExonRegion	0	10.38	2.15	3.54	5.38	3.67	2.34	1.24	1.95	1.59	2.11	0.45	0.95	0.24	4.48	4.62	6.27	14.46	4.89	1.95	3.09	0.68	2.40	0.62	2.20	1.71	3.16	1.37	2.67	0.91