Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-553K8.1	Gene	0	2.10	1.47	0.20	0.00	1.20	1.01	0.25	0.23	0.89	2.83	0.15	0.61	0.00	2.33	3.04	0.91	2.20	0.94	0.00	1.59	3.15	0.22	0.44	1.05	0.53	1.54	1.12	6.19	0.00
2	413577	Transcript	0	1.19	1.14	0.06	0.00	0.37	0.31	0.24	0.30	0.74	1.60	0.05	0.39	0.00	1.18	1.51	0.70	0.81	0.94	0.00	0.49	1.75	0.07	0.14	0.33	0.28	0.93	1.48	2.94	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	4.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	1.82	0.07	0.00	0.00	0.00	0.79	3.73	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	1.27	7.41	1.32	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	3.80	0.00	0.00	24.06	7.63	1.61	1.48	6.50	3.46	33.09	3.75	11.30	0.00	0.00	0.00	4.01	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	5.07	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	2.57	4.76	0.42	0.42	0.29	0.99	0.76	0.24	8.41	2.40	0.85	1.07	1.39	2.54	7.94	2.17	6.00	1.33	2.16	1.31	3.82	0.38	0.28	3.59	2.35	2.87	1.37	6.22	0.92
7	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.81	4.09	0.52	0.45	0.00	0.98	1.01	0.69	15.78	3.69	0.56	1.20	2.18	2.05	13.18	1.68	8.34	0.62	1.74	1.11	2.95	1.24	0.56	3.25	5.25	3.39	1.14	2.92	0.67
8	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.35	7.02	0.57	0.00	0.00	0.24	1.84	0.00	10.09	2.64	0.87	0.40	1.54	2.24	9.78	1.10	9.79	1.32	1.20	0.32	4.06	0.41	0.21	2.65	3.93	3.50	2.51	1.92	0.23
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.20	4.95	0.41	0.54	0.46	1.09	0.57	0.17	6.75	2.02	0.74	1.19	1.19	2.67	6.45	2.39	5.00	1.25	2.67	1.64	4.02	0.17	0.24	4.21	1.48	2.90	1.31	7.66	1.22
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.24	1.80	0.00	0.00	0.00	1.29	0.32	0.00	1.51	1.98	2.41	0.68	0.86	3.09	4.70	3.02	3.24	3.84	0.31	0.43	4.08	0.00	0.00	0.68	0.22	0.49	0.86	8.48	0.00
11	E2_Aa	NovelBoundary	0	4.90	7.27	0.00	0.00	0.00	3.84	0.00	0.00	3.56	0.00	6.45	1.27	0.00	1.37	0.00	3.52	7.61	4.62	16.18	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	1.67	0.00	12.85	0.00
12	ER2a	ExonRegion	0	3.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.18	0.00	1.36	5.21	0.00	1.50	0.00	2.43	0.00	3.01	0.97	4.65	0.00	0.00	4.30	0.00	0.00	0.00	0.87	1.91	0.00	6.00	0.00
13	E2_Da	NovelBoundary	0	2.48	12.80	0.00	0.00	0.00	3.53	0.00	0.00	6.82	1.88	5.31	1.84	0.00	2.22	0.00	7.34	3.94	4.62	0.00	0.00	17.41	0.00	0.00	5.86	1.40	0.00	0.00	7.64	0.00
14	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	Ix	Intron	0	2.83	2.99	0.45	0.00	0.40	0.85	0.16	0.15	2.66	1.87	0.22	1.17	0.37	2.11	4.68	1.48	3.22	0.79	2.84	0.82	3.54	0.05	0.20	0.99	0.89	0.59	0.94	4.71	0.45
16	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.31	6.17	1.71	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	1.44	1.49	1.84	0.00	0.67	3.03	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	1.42	2.20	0.00	0.93	0.00	1.47	0.00	5.66	4.20	0.00
17	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	3.18	1.79	0.38	0.00	0.56	0.94	0.23	0.21	2.72	1.32	0.07	0.88	0.37	2.32	6.07	2.00	2.81	1.56	2.37	0.94	2.68	0.10	0.21	0.74	1.06	1.07	0.21	5.11	0.61
18	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.32	4.50	0.55	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	3.52	2.96	0.20	1.61	0.43	1.19	4.10	0.64	4.26	0.00	4.35	0.07	4.00	0.00	0.00	1.78	0.39	0.26	1.43	3.50	0.66
19	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.98	3.52	0.29	0.00	0.43	0.48	0.18	0.16	2.34	2.21	0.21	1.57	0.28	2.13	3.68	1.18	3.87	0.17	3.27	0.92	4.85	0.00	0.16	1.13	0.79	0.14	1.00	4.83	0.17
20	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.11	0.00	0.00	1.78	0.00	9.77	0.00	3.31	0.00	0.00	3.39	0.00	0.00	0.00	2.57	3.33	0.00	5.67	4.04	0.00
21	ER3a	ExonRegion	0	2.03	1.22	0.32	0.00	1.85	1.56	0.01	0.00	0.53	2.74	0.23	0.47	0.00	2.66	3.83	0.47	3.09	0.00	0.00	2.47	3.25	0.34	0.69	1.63	0.54	1.49	0.00	7.40	0.00