Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-176D17.1	Gene	0	0.00	2.13	0.00	0.00	0.00	2.44	0.20	0.00	0.44	2.42	1.17	0.43	0.51	1.51	0.91	1.71	2.79	0.95	0.31	0.27	3.37	0.00	1.25	5.51	0.70	1.08	0.36	0.64	0.20
2	443622	Transcript	0	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	1.47	0.09	0.00	0.28	1.55	0.66	0.23	0.35	0.94	0.51	1.14	1.93	0.65	0.22	0.12	2.28	0.00	0.86	3.78	0.48	0.74	0.25	0.40	0.14
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	2.18	0.00	0.00	0.00	5.57	0.00	0.00	1.14	6.80	2.01	0.62	1.75	3.82	1.56	4.19	6.55	3.25	1.08	0.00	11.07	0.00	4.28	18.88	2.41	3.72	1.24	1.63	0.67
4	E1_Da	NovelBoundary	0	2.36	4.65	1.02	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	1.37	9.79	7.12	8.61	8.09	8.73	0.00	16.98	6.80	9.25	16.18	0.00	9.23	0.00	8.91	31.64	8.15	0.00	1.94	0.00	2.05
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	I1	Intron	0	1.28	8.77	3.87	1.04	0.84	5.03	0.71	0.24	2.26	9.49	3.69	4.03	2.53	6.69	2.33	9.86	15.60	6.92	2.18	0.81	12.11	0.70	10.09	30.45	11.68	6.75	12.00	2.25	5.27
7	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.75	5.22	2.47	0.93	0.21	4.90	0.35	0.32	2.10	7.59	2.38	2.03	1.80	7.24	3.47	8.94	11.15	7.14	0.42	0.92	10.60	0.70	8.88	23.74	9.06	6.28	7.08	1.91	3.51
8	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	1.57	0.00	0.00	0.00
9	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.17	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.11	0.25	0.00	0.00	1.18	0.22	0.63	1.77	0.21	3.71	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	0.57	1.29	1.69	0.00	0.00	0.00
10	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.59	5.03	3.35	0.82	0.53	3.47	0.69	0.21	1.20	6.59	5.39	2.48	1.79	6.05	2.03	9.52	11.18	5.86	2.18	0.00	12.03	1.23	7.88	20.56	7.36	5.78	8.94	2.57	3.68
11	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	2.04	5.26	1.12	0.00	9.96	2.20	0.00	0.00	0.06	5.99	15.41	4.45	2.79	6.58	0.00	5.82	5.61	9.55	1.36	0.00	10.06	0.00	1.81	15.60	4.50	5.34	12.91	0.57	2.68
12	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.41	8.86	2.10	0.73	0.55	6.71	0.20	0.19	1.13	10.25	3.76	3.04	2.26	8.01	0.98	9.90	13.43	8.59	4.07	0.28	13.64	0.55	8.93	22.08	9.42	3.67	9.62	0.33	3.69
13	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	7.89	2.79	1.88	0.00	7.98	0.00	0.48	0.44	12.04	3.79	2.88	2.32	4.83	1.27	13.21	16.66	12.35	2.82	1.45	12.29	0.00	8.64	17.89	8.91	4.63	14.85	0.43	4.40
14	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	4.60	3.31	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	7.58	8.33	1.79	4.03	5.35	1.68	6.33	14.37	10.23	2.49	1.41	10.56	1.80	3.07	20.87	8.43	11.63	5.49	0.16	0.00
15	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.18	7.64	0.00	0.00	4.87	0.00	0.00	0.00	9.74	3.48	0.92	1.48	4.88	0.00	8.44	21.58	8.45	0.00	1.74	5.95	0.86	5.77	21.03	16.65	8.96	18.49	1.24	2.24
16	I1_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.19	7.10	4.11	0.00	0.44	4.60	0.00	0.00	0.50	7.49	1.30	2.05	2.74	4.68	0.49	6.53	12.42	5.54	1.44	0.25	8.63	0.49	10.73	19.64	10.51	6.61	7.56	1.91	3.36
17	I1_AR11	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.51	4.09	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	2.36	0.00	0.00	0.00
18	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	5.71	3.08	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	2.44	2.64	3.28	0.81	1.91	4.09	2.49	6.96	6.69	1.42	1.96	9.50	0.00	12.80	13.80	6.59	7.71	4.71	2.14	3.48
19	I1_AR12	ActiveIntronRegion	0	2.86	9.61	6.39	0.81	2.04	4.47	0.00	0.00	0.92	15.14	4.59	4.14	3.05	8.82	2.71	13.06	18.04	11.09	1.13	0.44	13.39	0.82	17.21	27.73	16.41	8.03	18.24	3.31	5.82
20	I1_SR5	SilentIntronRegion	0	1.28	11.47	7.70	1.01	2.29	6.79	0.54	0.00	2.05	15.40	3.54	6.01	3.74	8.70	0.00	11.26	20.33	8.38	6.27	0.00	18.04	0.25	17.64	36.62	20.55	10.49	20.84	3.85	8.07
21	I1_AR13	ActiveIntronRegion	0	0.83	12.66	5.34	1.19	0.81	4.38	0.68	0.61	2.38	11.88	5.75	8.07	3.59	8.91	1.54	7.93	25.72	5.80	2.84	1.22	15.27	1.30	13.45	41.73	18.87	10.87	15.55	4.74	7.91
22	I1_SR7	SilentIntronRegion	0	0.53	11.92	1.66	0.00	0.00	4.79	0.00	0.00	5.16	5.75	0.89	2.15	2.10	4.95	3.44	1.68	11.14	6.55	0.00	0.00	9.23	2.69	8.55	24.08	8.89	5.86	10.94	2.84	10.82
23	I1_AR19	ActiveIntronRegion	0	2.11	12.30	4.99	2.14	1.46	6.07	1.92	0.33	4.95	10.81	4.76	6.03	3.20	6.78	4.41	15.18	19.90	6.72	2.48	1.60	13.89	0.54	9.82	51.39	13.30	7.69	16.74	2.48	7.45
24	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.99	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01
25	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.71	0.00	0.00	0.00	1.37	7.97	0.00	5.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER3a	ExonRegion	0	0.00	3.24	0.00	0.00	0.00	1.76	0.43	0.00	0.24	0.92	1.27	0.53	0.00	0.87	0.98	0.53	1.83	0.00	0.00	0.59	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00
28	IG28	Intergenic	0	3.01	2.03	0.69	3.19	2.34	1.60	1.10	1.01	1.07	4.44	0.49	1.41	1.53	2.44	2.13	1.25	3.73	2.34	1.42	0.47	1.61	0.62	0.56	5.44	0.34	2.04	0.19	1.45	0.57
29	IG28_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	3.70	2.42	0.87	4.02	2.95	1.90	1.39	1.27	1.30	5.29	0.62	1.78	1.93	2.98	2.45	1.57	4.63	2.87	1.79	0.59	1.72	0.78	0.70	6.86	0.37	2.57	0.24	1.83	0.72