Order SeqName SeqType IsAE ABC_RG012 ABC_RG016 ABC_RG015 ABC_RG046 ABC_RG047 ABC_RG048 ABC_RG049 ABC_RG058 ABC_RG059 ABC_RG061 ABC_RG073 ABC_RG074 ABC_RG086 GCB_RG003 GCB_RG005 GCB_RG006 GCB_RG007 GCB_RG010 GCB_RG014 GCB_RG045 GCB_RG050 GCB_RG055 GCB_RG062 GCB_RG063 GCB_RG064 GCB_RG071 GCB_RG072 GCB_RG069 GCB_RG085 1 RP11-480I12.3 Gene 0 1.29 0.20 0.27 1.00 0.45 0.70 0.61 1.83 0.97 1.07 0.22 0.34 0.15 0.57 4.43 0.81 0.41 0.87 1.63 0.56 1.16 0.13 0.38 0.75 0.56 0.54 0.98 1.28 0.79 2 430114 Transcript 0 1.39 0.00 0.79 1.54 0.70 0.99 0.31 1.71 0.64 0.63 0.26 0.74 0.19 0.72 8.53 0.53 0.32 0.69 2.52 0.00 0.61 0.00 0.13 0.62 0.21 0.45 0.26 1.63 0.71 3 443294 Transcript 0 0.87 0.10 0.08 0.32 0.44 0.62 0.73 1.01 1.34 1.49 0.27 0.39 0.18 0.61 3.63 0.80 0.40 1.00 0.72 0.58 1.59 0.24 0.49 0.95 0.45 0.70 1.40 1.47 0.58 4 449915 Transcript 0 0.94 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.09 0.00 0.61 0.00 0.02 0.00 0.01 0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 5 ER1a ExonRegion 0 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 6 ER1b ExonRegion 0 1.85 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 0.16 5.62 0.53 0.46 0.00 0.00 0.00 0.07 1.47 1.47 0.28 0.00 3.05 0.00 0.45 0.00 0.58 0.00 1.82 0.00 0.58 0.00 0.79 7 E1a_E2b KnownJunction 0 2.95 0.00 1.54 0.00 0.00 0.00 2.52 13.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 2.91 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.47 8 ER2a ExonRegion 0 0.94 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.09 0.00 0.61 0.00 0.02 0.00 0.01 0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 9 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2b ExonRegion 0 2.58 0.00 0.22 1.50 0.00 0.44 1.21 5.36 0.39 0.33 0.00 0.67 0.00 0.15 3.61 1.22 0.83 0.31 2.22 0.31 0.00 0.00 0.42 0.00 0.99 0.00 0.42 0.00 0.84 11 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 2.54 0.00 0.00 0.00 1.54 0.00 0.00 7.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER3a ExonRegion 0 3.69 0.00 1.39 4.63 2.10 2.96 0.93 2.17 1.93 1.88 0.77 0.69 0.56 2.15 18.22 1.60 0.96 2.07 7.56 0.00 1.84 0.00 0.39 1.85 0.62 1.34 0.79 4.90 1.83 14 E3_Da NovelBoundary 0 3.01 0.00 0.00 9.92 0.00 0.00 2.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.14 0.00 0.99 0.00 0.00 0.00 3.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.52 15 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.27 0.00 0.00 0.48 0.00 0.57 2.44 0.00 0.31 0.47 1.54 1.33 0.34 0.44 0.00 1.04 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 16 Ix Intron 0 0.00 2.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 2.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER4a ExonRegion 0 0.00 1.03 0.00 1.26 0.00 0.14 0.00 0.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 0.00 0.00 0.71 0.00 1.55 0.72 0.00 0.00 0.39 0.23 0.28 0.59 0.00 1.03 19 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.52 0.00 0.00 2.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER4b ExonRegion 0 0.87 0.10 0.08 0.32 0.44 0.62 0.73 1.01 1.34 1.49 0.27 0.39 0.18 0.61 3.63 0.80 0.40 1.00 0.72 0.58 1.59 0.24 0.49 0.95 0.45 0.70 1.40 1.47 0.58