Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C1orf132	Gene	0	25.87	3.57	0.54	0.30	0.14	5.13	2.54	10.21	0.82	7.21	1.03	0.38	0.50	11.49	2.69	3.56	4.88	2.50	0.72	2.24	1.82	1.12	0.31	1.55	2.36	1.02	0.34	2.79	0.74
2	415882	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	367039	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
4	487977	Transcript	0	33.99	0.01	0.91	0.37	0.00	3.01	4.30	24.52	0.29	5.90	0.61	0.94	0.53	5.79	1.97	3.02	3.65	3.15	1.30	2.71	2.37	1.62	0.00	0.00	3.09	0.00	0.37	4.31	1.30
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER1b	ExonRegion	0	0.70	0.00	1.37	0.00	0.00	0.55	0.00	0.78	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	0.87	0.00	0.89	0.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.77	0.91	0.00	0.00	0.00	2.40	0.00
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	2.04	0.00	2.98	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.39	0.00
8	ER2a	ExonRegion	0	7.87	0.00	0.06	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	1.10	0.75	0.11	0.00	0.00	2.42	0.00	0.21	0.53	1.00	0.00	1.43	0.74	0.77	0.94	0.00	0.00	1.49	0.00	0.45	0.00
9	E2_Da	NovelBoundary	0	6.02	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E2a_E5a	NovelJunction	0	16.93	0.00	0.00	0.00	0.00	1.53	0.00	2.19	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	3.32	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.04	0.00	1.72	0.00	2.29	1.68
12	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.71	1.86	0.40	0.00	0.00	1.02	1.34	0.00	0.65	1.75	0.29	0.91	0.56	0.67	2.03	0.63	1.76	0.29	1.05	0.00	2.99	0.22	0.00	1.59	0.35	0.58	0.45	0.20	0.00
13	I2_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	1.44	2.38	2.47	0.00	1.81	0.00	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	2.15	0.00	1.57	0.00	0.00	0.00
14	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00	0.79	1.29	0.29	1.18	1.13	1.06	0.95	0.66	2.14	0.40	1.32	0.57	3.75	0.00	0.00	1.03	0.59	0.24	1.11	0.34	0.61
15	I2_AR6	ActiveIntronRegion	0	2.10	0.37	0.96	0.00	1.68	0.88	0.00	0.42	2.62	0.96	0.27	0.62	1.11	1.04	0.00	0.62	3.60	0.00	2.09	0.32	1.78	0.20	0.42	3.12	0.16	1.34	1.49	0.58	1.39
16	I2_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.34	3.18	0.44	0.00	0.00	1.63	0.00	0.99	1.87	1.89	0.31	0.73	0.52	0.60	4.34	0.33	8.16	0.47	0.00	0.73	2.44	0.71	0.71	3.81	1.87	1.01	0.00	1.72	1.70
17	I2_AR8	ActiveIntronRegion	0	2.14	4.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.68	2.50	4.01	0.00	0.69	1.30	0.00	0.00	0.00	1.34	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.78	4.13	0.70	0.00	0.00	1.34
18	I2_AR9	ActiveIntronRegion	0	2.14	5.99	0.00	0.00	0.00	2.59	0.00	3.68	2.25	3.23	0.00	1.24	1.30	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	6.83	2.86	0.00	0.00	0.00	1.34
19	I2_AR10	ActiveIntronRegion	0	3.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	1.14	0.91	0.00	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	1.63	0.00
20	I2_AR11	ActiveIntronRegion	0	1.90	1.47	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	0.28	0.00	0.00	0.73	0.64	0.29	0.00	0.00	5.09	0.00	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	0.51	1.95	0.00	2.36	0.00
21	I2_AR15	ActiveIntronRegion	0	2.69	1.08	0.00	2.90	0.00	0.18	1.94	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.99	0.00	0.95	1.88	1.75	1.87	0.80	0.23	0.00	0.00	0.72	0.72	2.16	1.78	4.51	0.13
22	I2_AR16	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	6.20	0.00	0.46	2.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	1.35	0.00	1.99	2.03	8.19	7.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.14	0.00	0.30	0.85
23	I2_AR17	ActiveIntronRegion	0	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.42	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.17	3.77	0.00	4.41	1.68	4.40	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.07	0.41	0.00	4.00	0.00
24	E3_Aa	NovelBoundary	0	5.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.32	0.00	0.00	2.23	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	0.00	0.00
25	ER3a	ExonRegion	0	15.73	0.03	0.40	0.73	0.00	2.57	5.79	12.27	0.58	6.29	1.23	0.12	1.05	4.39	3.94	2.45	2.00	1.68	2.61	1.62	0.90	0.81	0.00	0.00	1.52	0.00	0.75	4.35	1.05
26	E3_Da	NovelBoundary	0	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	3.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.89	5.21	0.00	0.00	2.51	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E3a_E4a	NovelJunction	0	7.79	9.70	0.00	0.00	0.00	0.00	2.35	2.54	1.80	1.56	0.00	0.00	0.00	4.65	0.00	0.00	1.40	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E3a_E5a	KnownJunction	0	52.26	0.00	1.42	0.00	0.00	3.45	2.80	36.78	0.00	5.51	0.00	1.75	0.00	7.20	0.00	3.60	5.31	4.62	0.00	3.80	3.85	2.43	0.00	0.00	4.66	0.00	0.00	4.27	1.55
29	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER4a	ExonRegion	0	6.81	0.62	0.00	0.00	0.00	1.10	0.16	2.15	0.04	0.40	0.00	0.00	0.00	2.03	0.00	0.47	0.63	0.53	0.00	0.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	0.00	0.01
31	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.06	0.00	18.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E4a_E5a	KnownJunction	0	12.50	4.46	0.00	0.00	0.00	2.88	2.63	4.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.70	0.00	3.60	3.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	1.97	4.25	0.00	0.00	3.22	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	ER5a	ExonRegion	0	84.84	3.70	1.43	0.00	0.00	13.97	9.41	46.25	1.59	15.41	3.80	2.06	2.07	19.89	11.36	8.87	12.86	3.57	4.76	10.65	5.83	4.79	1.05	1.87	6.38	3.34	0.00	8.62	1.53
35	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.60	0.00	0.00	0.00	2.35	9.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	E5a_E6a	KnownJunction	0	77.51	4.36	2.72	0.00	0.00	13.51	10.81	34.54	4.29	16.42	10.03	4.85	0.00	22.42	16.54	7.65	20.21	4.62	0.00	11.58	3.49	4.52	0.00	0.00	10.15	9.66	0.00	9.93	4.82
37	E5_Db	NovelBoundary	0	6.02	0.00	0.00	0.00	0.00	7.75	0.00	4.58	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	3.68	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	ER5b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	1.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	I5	Intron	0	10.02	2.15	0.23	1.99	0.00	2.93	0.84	4.86	0.10	4.14	0.88	0.23	0.00	6.54	0.94	1.20	2.90	1.37	0.59	0.95	2.05	1.08	0.17	2.19	1.39	0.80	0.00	1.28	0.00
40	I5_SR1	SilentIntronRegion	0	10.04	2.16	0.23	1.99	0.00	2.93	0.84	4.87	0.10	4.15	0.88	0.23	0.00	6.55	0.94	1.20	2.91	1.37	0.59	0.95	2.05	1.09	0.17	2.19	1.39	0.80	0.00	1.28	0.00
41	E6_Aa	NovelBoundary	0	13.21	4.56	0.00	0.00	0.00	5.22	0.00	6.97	0.00	5.07	0.00	0.00	0.00	6.65	18.94	10.33	4.79	9.25	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.04	0.00
42	ER6a	ExonRegion	0	27.11	4.80	0.53	0.29	0.20	5.72	1.81	8.74	0.90	7.93	0.91	0.37	0.36	13.88	2.28	3.90	5.57	2.91	0.18	2.03	1.98	1.07	0.29	2.05	2.63	1.13	0.33	2.39	0.74
43	IG50	Intergenic	0	39.32	8.98	1.14	0.31	0.03	6.45	2.48	17.30	2.64	11.02	1.78	0.98	0.65	18.81	4.68	5.70	13.81	3.44	1.21	5.21	2.93	1.33	0.54	3.14	6.25	1.82	0.70	2.39	1.44
44	IG50_SR10	SilentIntergenicRegion	0	16.77	7.45	0.00	0.00	0.00	5.24	1.25	7.12	0.75	6.64	0.86	0.26	0.81	8.23	0.00	2.79	5.53	2.61	2.43	3.06	2.17	1.12	0.00	3.38	3.09	0.65	0.00	1.96	1.41
45	IG50_AR15	ActiveIntergenicRegion	0	17.37	10.22	0.02	0.00	0.00	2.27	0.51	4.98	1.14	7.97	1.24	0.72	0.46	10.07	2.91	3.44	5.07	3.44	0.15	4.23	1.22	2.03	0.08	1.77	3.72	1.26	0.19	1.66	0.46
46	IG50_SR9	SilentIntergenicRegion	0	10.03	4.39	0.99	0.29	0.00	2.45	0.50	2.89	0.92	3.99	0.25	0.22	0.29	5.87	2.54	2.36	4.99	1.49	0.51	1.02	0.55	0.72	0.20	0.91	2.11	0.77	0.09	1.78	0.21
47	IG50_AR14	ActiveIntergenicRegion	0	22.96	10.62	0.28	0.00	0.00	3.75	0.95	4.35	1.32	8.11	0.75	0.00	0.88	12.87	4.03	3.51	3.42	2.12	0.00	1.93	1.55	0.00	0.85	1.69	3.91	3.23	0.58	1.20	0.85
48	IG50_SR8	SilentIntergenicRegion	0	29.22	8.63	0.71	0.00	0.00	8.31	1.57	9.73	1.48	8.29	2.43	0.59	0.00	15.05	0.00	3.61	7.11	1.50	1.24	6.14	3.39	1.17	0.95	2.30	3.32	1.84	2.85	2.51	0.00
49	IG50_AR13	ActiveIntergenicRegion	0	36.37	8.76	0.83	0.00	0.00	10.01	1.78	8.57	3.15	8.91	1.69	0.19	0.91	16.57	0.00	3.65	12.05	1.06	7.01	7.86	4.80	0.33	0.64	1.11	3.81	0.15	0.00	2.72	0.00
50	IG50_AR12	ActiveIntergenicRegion	0	42.77	7.46	1.16	1.00	0.00	7.78	2.88	16.30	4.46	10.57	1.12	0.34	0.30	19.96	1.40	3.32	12.00	3.36	2.43	3.99	4.40	0.50	0.73	3.28	5.44	1.04	0.51	3.29	0.64
51	IG50_AR11	ActiveIntergenicRegion	0	54.48	10.01	0.26	0.00	0.00	7.77	2.67	20.85	2.72	16.02	0.50	0.00	0.00	23.10	0.00	5.30	11.41	1.71	1.89	2.55	1.89	0.00	0.17	10.91	10.67	0.00	0.00	0.91	1.25
52	IG50_AR10	ActiveIntergenicRegion	0	47.71	10.95	1.12	0.00	0.00	7.03	2.02	12.68	2.95	25.13	0.00	0.00	0.48	20.19	0.00	11.72	13.13	0.00	0.00	8.43	6.71	0.00	0.00	7.57	5.40	1.69	0.00	0.48	2.93
53	IG50_SR7	SilentIntergenicRegion	0	56.44	10.95	1.12	0.00	0.00	6.87	2.02	5.52	1.12	16.12	0.00	0.00	1.30	14.66	0.00	12.65	11.35	2.27	0.00	6.56	7.61	0.00	0.00	4.30	1.91	6.29	0.00	1.63	4.03
54	IG50_AR9	ActiveIntergenicRegion	0	61.15	10.63	1.12	0.00	0.00	9.14	1.30	5.20	1.12	9.60	0.00	0.00	1.30	14.46	0.00	7.89	9.66	7.55	0.00	3.47	6.63	0.00	0.00	3.04	2.27	6.29	0.00	1.63	4.03
55	IG50_AR8	ActiveIntergenicRegion	0	49.47	16.42	0.41	0.00	0.00	12.77	0.00	8.04	0.71	9.88	0.75	1.07	1.98	21.29	2.06	6.53	9.20	8.91	0.95	4.88	3.45	0.00	0.00	2.15	4.29	3.27	0.00	0.82	2.01
56	IG50_AR7	ActiveIntergenicRegion	0	40.37	16.42	0.00	0.00	0.00	18.79	0.34	7.98	1.12	11.79	2.38	1.24	1.73	17.84	11.20	10.12	9.35	0.00	4.53	6.09	2.14	0.30	0.00	6.45	2.86	0.00	0.00	0.00	0.45
57	IG50_SR6	SilentIntergenicRegion	0	41.04	20.68	0.00	0.00	0.00	19.40	2.02	7.71	1.79	13.37	2.29	1.47	0.87	15.92	9.54	10.87	13.32	0.00	4.19	5.41	4.02	1.80	1.67	5.58	4.50	3.14	0.00	3.26	1.34
58	IG50_AR6	ActiveIntergenicRegion	0	44.60	6.95	0.83	0.00	0.00	8.33	2.34	8.87	1.36	12.55	3.10	1.15	0.45	21.51	3.98	6.35	10.07	2.90	1.40	7.63	3.29	0.93	0.25	3.83	5.20	0.98	0.17	2.68	0.65
59	IG50_SR5	SilentIntergenicRegion	0	43.99	9.43	0.49	0.00	0.00	7.72	2.55	13.40	3.03	14.73	2.23	0.92	0.83	24.72	1.93	10.64	18.22	3.23	0.25	6.16	4.62	1.58	0.95	2.35	5.91	1.61	1.34	2.13	1.40
60	IG50_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	27.53	6.70	0.77	0.00	0.00	4.19	1.24	7.94	1.15	9.23	0.71	1.25	0.54	14.05	1.45	5.70	10.37	3.27	0.53	3.57	1.56	0.78	0.12	2.17	4.03	2.02	0.00	2.21	0.40
61	IG50_SR4	SilentIntergenicRegion	0	60.60	7.23	1.59	0.52	0.00	7.28	2.95	21.84	4.00	13.51	2.72	1.08	0.81	33.73	3.58	7.80	24.50	4.82	1.68	6.37	3.35	1.72	0.44	2.40	9.49	1.05	1.02	2.91	1.11
62	IG50_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	67.69	7.33	1.84	1.04	0.00	14.75	2.61	16.99	3.49	20.08	4.69	1.12	0.38	32.50	13.28	8.37	23.64	5.51	1.73	9.01	6.74	2.43	0.88	5.84	8.90	4.97	0.09	5.49	1.76
63	IG50_SR3	SilentIntergenicRegion	0	21.43	18.19	2.24	0.00	0.00	1.43	0.47	12.32	2.20	10.22	2.29	1.24	0.00	23.69	8.83	2.04	19.15	5.14	2.79	3.24	2.52	0.07	1.18	2.73	6.93	2.18	0.00	4.89	0.00
64	IG50_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	56.70	14.99	1.59	1.49	0.00	7.40	5.03	42.86	3.29	14.12	1.85	1.56	0.76	23.62	10.47	4.38	21.51	5.26	0.79	9.11	3.43	2.50	1.13	7.06	10.20	2.11	0.51	3.30	3.34
65	IG50_SR2	SilentIntergenicRegion	0	48.44	1.31	1.61	0.00	0.00	2.25	0.47	18.96	0.67	3.47	1.35	0.87	0.00	9.43	1.49	2.70	9.72	1.00	0.00	2.44	0.24	0.00	0.00	2.65	7.58	5.61	1.28	2.39	1.48
66	IG50_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	70.73	16.19	2.98	0.00	0.00	8.73	6.22	48.38	5.76	13.76	3.84	2.21	0.75	23.69	11.00	8.15	22.09	5.92	3.00	7.13	3.63	1.74	0.75	5.33	13.47	3.41	2.59	1.91	4.56
67	IG50_SR1	SilentIntergenicRegion	0	30.64	6.22	1.96	0.00	0.76	4.55	3.64	23.83	4.30	10.37	0.86	1.96	1.32	14.05	9.00	2.75	14.38	2.54	0.68	4.43	2.83	1.59	0.35	2.44	5.96	2.41	1.42	1.69	2.96
68	IG50_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	33.05	16.46	0.17	0.00	0.00	11.27	2.98	46.82	6.23	15.88	0.00	1.09	3.40	21.21	10.42	7.59	10.05	1.14	5.00	10.56	4.99	3.21	1.07	3.43	8.18	1.86	0.00	2.14	0.80