Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	LRRN2	Gene	0	4.29	4.67	4.37	6.82	0.26	2.11	0.96	6.30	3.50	4.69	3.96	2.15	1.31	7.08	10.42	7.78	32.39	4.77	2.98	3.24	2.09	0.45	4.53	47.16	8.20	14.73	3.26	0.79	5.01
2	367177	Transcript	0	3.01	0.00	1.36	1.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00	1.17	0.00	1.19	0.00	0.36	2.73	0.00	0.44	0.13	0.00	0.00	3.71	8.62	0.89	5.60	1.48	0.02	0.05
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6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	1.00	0.00	0.72	0.79	0.00	0.89	0.25	0.00	0.00	0.82	5.82	1.78	3.21	0.42	0.03	0.10
7	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	21.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.10	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.44	0.00	0.00	2.39	0.00	3.33
8	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.75	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	2.81	0.00	8.28	0.00	2.25	0.00
9	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	14.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	0.42	0.00	2.73	2.62	0.00	0.00	0.65	0.00	0.00	1.81	4.30	0.00	4.96	1.83	1.63	1.34
10	ER1c	ExonRegion	0	3.51	0.00	1.02	5.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.31	0.00	1.20	0.00	1.04	0.00	2.38	3.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.34	6.84	0.09	8.72	2.72	1.53	0.41
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.24	0.00	0.00
13	E1a_E4b	KnownJunction	0	6.02	0.00	2.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	1.36	0.00	1.37	0.00	0.00	4.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.60	11.42	0.00	7.98	2.53	0.00	0.00
14	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E2a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E3_Aa	NovelBoundary	0	10.15	12.60	5.48	9.92	6.34	20.07	7.21	19.36	31.88	14.54	11.10	7.02	8.31	18.12	0.00	6.04	28.05	0.00	0.00	3.56	27.56	10.26	14.82	44.86	16.86	9.53	2.04	13.79	7.56
17	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	0.68	0.00	0.00	0.01	0.00	1.41	0.00	0.00	0.00	0.00	6.91	1.43	1.60	0.66	0.00	0.00
18	E3a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	14.06	3.83	1.63	0.00	0.00	0.00
19	Ix	Intron	0	3.05	5.83	6.61	12.21	0.00	2.08	1.57	8.94	7.62	4.15	3.83	1.38	2.09	0.90	10.15	8.27	26.37	2.55	1.20	0.52	1.00	0.59	0.90	1.65	1.27	2.21	0.17	0.28	0.42
20	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.79	3.06	2.64	3.95	0.00	1.18	0.74	4.12	2.63	1.74	2.79	0.23	0.30	0.42	11.83	4.60	15.81	0.53	0.59	0.00	0.78	0.99	0.88	0.02	1.19	1.55	0.00	0.45	0.00
21	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.47	8.82	5.14	4.34	0.00	1.99	2.37	7.28	8.29	2.73	2.16	1.21	2.66	1.17	10.72	7.67	23.31	1.46	2.27	0.24	0.27	0.22	1.36	2.57	0.98	0.95	0.83	0.00	0.00
22	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	2.65	5.15	7.74	12.51	0.00	2.45	1.22	10.97	9.58	4.50	4.89	1.89	2.46	0.52	8.78	9.92	30.40	4.02	1.79	0.88	1.26	0.73	0.72	1.90	1.49	2.41	0.18	0.32	0.66
23	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.15	8.79	10.53	15.96	0.00	4.02	2.88	13.21	11.42	6.85	3.88	1.36	2.20	1.35	11.71	10.72	30.97	2.75	0.67	0.87	1.34	0.57	1.12	3.08	1.08	4.50	0.00	0.34	0.35
24	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.73	6.65	7.95	24.42	0.00	1.29	2.01	10.08	7.75	5.26	4.19	2.12	3.05	1.70	10.96	9.31	31.57	2.95	1.02	0.44	1.25	0.43	1.03	1.32	1.40	1.24	0.15	0.26	0.64
25	E4_Aa	NovelBoundary	0	9.67	3.97	8.75	51.33	0.00	0.00	0.00	8.56	8.62	9.95	3.23	2.65	1.97	2.90	8.17	2.98	50.13	4.62	8.09	0.00	1.64	0.00	0.00	2.87	0.00	10.69	0.00	0.00	0.00
26	ER4a	ExonRegion	0	4.36	7.63	4.73	5.52	0.75	1.53	0.88	7.07	4.04	4.52	4.89	1.27	2.04	1.68	12.79	8.69	33.58	4.32	2.62	0.92	1.74	0.69	0.79	2.48	2.18	4.00	0.85	0.88	0.93
27	E4_Ab	KnownBoundary	0	5.37	4.85	1.07	0.00	0.00	1.88	0.00	2.34	8.92	0.00	2.63	2.65	0.00	2.15	18.14	2.98	77.77	4.62	0.00	0.00	3.29	0.00	0.00	5.38	4.81	0.00	0.00	0.00	0.00
28	ER4b	ExonRegion	0	7.06	7.37	6.17	5.75	0.00	2.34	0.97	12.73	3.76	4.25	3.67	2.44	1.74	11.10	26.37	9.40	52.99	8.17	7.19	0.72	2.56	0.00	3.58	61.08	8.83	18.67	2.71	0.52	3.49
29	E4_Da	KnownBoundary	0	8.38	13.57	3.11	0.00	0.00	0.00	0.00	7.32	0.00	7.79	2.78	2.80	1.56	9.93	19.93	3.52	57.31	4.62	16.18	0.00	3.13	0.00	4.24	77.58	12.88	12.49	7.55	0.00	8.88
30	ER4c	ExonRegion	0	4.89	3.30	4.92	8.84	0.00	3.01	1.24	6.47	3.90	5.97	4.24	3.12	1.03	12.04	9.30	8.63	36.61	5.83	3.29	5.96	2.78	0.44	8.27	88.07	14.15	24.94	5.72	0.91	9.31