Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AL390718.1	Gene	0	0.93	0.70	0.69	0.16	0.21	0.90	0.35	0.36	0.61	0.94	0.08	0.63	0.03	0.77	0.20	0.81	1.04	0.84	0.56	0.06	0.93	0.35	0.08	0.56	0.28	0.55	0.00	0.14	0.35
2	500066	Transcript	0	0.44	0.33	0.33	0.07	0.10	0.42	0.28	0.22	0.37	0.49	0.04	0.35	0.01	0.36	0.09	0.42	0.49	0.39	0.26	0.03	0.48	0.22	0.04	0.33	0.13	0.26	0.00	0.07	0.16
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.27	0.41	0.21	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.27	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	104.99	169.57	180.61	219.79	162.99	110.54	56.36	88.09	154.64	134.10	61.56	79.58	108.72	136.57	51.23	45.06	72.64	221.16	80.70	73.35	153.70	226.02	118.99	330.60	197.95	92.22	120.62	24.89	96.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.62	0.00	0.00	0.00	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	1.44	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.64	2.74	1.61	1.02	0.69	0.39	0.86	0.26	1.66	1.02	0.51	1.35	1.20	1.78	0.00	2.37	4.90	0.27	0.91	0.00	0.20	0.77	0.00	2.74	1.42	1.34	0.00	0.69	0.39
9	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.72	0.00	0.00	0.00
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.98	3.44	2.81	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	1.03	1.32	0.91	3.76	0.79	1.59	0.84	1.79	2.05	2.65	0.49	0.42	0.44	0.00	0.55	1.64	0.87	0.48	0.00	0.75	0.41
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.38	1.15	0.60	5.13	3.50	1.72	0.72	0.66	0.40	1.55	0.21	0.77	0.23	2.36	3.62	0.89	0.80	0.00	0.00	0.00	1.28	0.00	0.32	0.77	1.80	0.56	0.00	0.00	0.97
12	Ix	Intron	0	3.71	1.56	2.63	1.44	0.20	1.83	0.73	0.30	1.54	2.85	0.43	1.22	0.23	1.60	1.22	2.04	3.85	3.82	0.77	1.05	1.32	0.36	0.36	1.91	0.58	0.70	0.00	0.66	0.43
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.72	1.56	2.63	1.45	0.20	1.83	0.73	0.30	1.54	2.85	0.43	1.22	0.24	1.61	1.22	2.05	3.85	3.82	0.77	1.05	1.32	0.36	0.36	1.91	0.58	0.70	0.00	0.66	0.43
14	E2_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	5.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER2a	ExonRegion	0	1.32	0.99	0.98	0.22	0.30	1.27	0.25	0.40	0.69	1.24	0.11	0.78	0.04	1.09	0.28	1.07	1.47	1.18	0.79	0.08	1.23	0.39	0.11	0.66	0.40	0.77	0.00	0.20	0.49