Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP5-1011O1.2	Gene	0	5.52	5.28	0.00	38.78	0.00	7.61	1.56	17.55	3.48	1.86	4.29	10.24	2.25	0.82	24.67	13.15	0.58	0.00	27.15	12.79	28.84	7.66	4.19	4.71	8.28	5.06	37.03	3.36	2.24
2	434300	Transcript	0	7.83	9.18	0.00	37.07	0.00	7.20	0.63	25.59	5.77	2.65	5.93	13.66	2.97	1.52	44.62	14.26	0.23	0.00	37.93	16.75	47.03	7.67	5.39	4.30	9.22	5.81	54.48	6.23	5.75
3	ER1a	ExonRegion	0	21.46	27.02	0.00	48.72	0.00	7.98	0.00	48.52	16.73	7.26	10.66	15.84	1.61	4.56	132.84	16.32	0.00	0.00	82.55	29.65	135.57	6.60	8.10	9.18	13.55	14.41	71.40	18.69	3.80
4	E1_Da	NovelBoundary	0	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	25.88	0.00	6.10	0.00	17.47	0.00	0.00	4.24	16.11	4.90	0.00	0.00	14.00	0.00	0.00	16.18	11.50	0.00	8.51	4.73	0.00	6.97	0.00	62.52	0.00	11.55
6	I1	Intron	0	0.50	0.20	0.07	0.10	0.00	0.17	0.07	0.11	0.53	0.12	0.09	0.20	0.08	0.12	0.17	0.83	0.13	0.06	0.25	0.09	4.06	0.01	0.03	0.08	0.10	0.13	0.40	0.27	0.01
7	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.50	0.20	0.07	0.10	0.00	0.17	0.07	0.11	0.53	0.12	0.09	0.20	0.08	0.12	0.17	0.83	0.13	0.06	0.25	0.09	4.06	0.01	0.03	0.08	0.10	0.13	0.40	0.27	0.01
8	Ix	Intron	0	0.50	0.10	0.05	0.11	0.00	0.13	0.28	0.00	0.04	0.09	0.07	0.12	0.23	0.12	0.09	0.12	0.05	0.00	0.70	0.09	3.63	0.06	0.00	0.17	0.09	0.10	0.46	0.26	0.00
9	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	3.66	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	1.20	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	0.00
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.08	0.22	0.06	0.00	0.00	0.28	0.61	0.00	0.08	0.19	0.13	0.21	0.39	0.17	0.00	0.17	0.10	0.00	0.64	0.19	4.21	0.12	0.00	0.29	0.19	0.21	0.74	0.27	0.00
12	Ix	Intron	0	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER2a	ExonRegion	0	2.04	0.53	0.00	36.61	0.00	7.53	1.90	10.78	0.58	0.68	2.90	9.02	2.39	0.00	1.03	12.46	0.70	0.00	15.05	9.11	5.53	7.89	3.34	3.73	7.13	3.02	29.52	0.01	1.90
15	IG11	Intergenic	0	0.22	0.18	0.01	4.35	0.00	2.01	0.15	0.52	0.34	0.10	0.48	2.55	0.12	0.09	0.56	1.62	0.06	0.02	2.94	1.21	3.24	0.25	0.21	0.51	0.80	0.10	3.33	0.29	0.20
16	IG11_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.27	0.00	11.62	0.00	4.55	0.55	1.21	0.69	0.08	0.92	3.69	0.28	0.11	0.00	3.11	0.08	0.11	5.11	2.96	2.94	0.54	0.60	1.24	0.98	0.30	6.42	0.31	0.33
17	IG11_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	7.75	0.00	1.74	0.00	0.60	0.00	0.00	0.22	3.37	0.21	0.00	0.00	3.23	0.16	0.00	1.66	1.04	4.25	0.59	0.00	0.00	0.47	0.00	9.80	0.00	0.00
18	IG11_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.21	0.64	0.00	7.33	0.00	1.10	0.00	0.91	0.00	0.09	0.74	6.74	0.00	0.00	0.00	2.00	0.15	0.00	5.37	0.82	2.77	0.18	0.15	0.43	3.16	0.00	5.15	1.13	0.20
19	IG11_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	5.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.00	3.34	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	6.15	0.00	2.88	1.73	0.27	0.00	2.32	0.00	1.80	0.00	0.00
20	IG11_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.43	0.00	0.35	0.00	0.31	0.41	0.24	0.20	2.18	0.00	0.00	0.00	0.42	0.31	0.00	0.87	0.00	2.18	0.92	0.31	0.36	1.94	0.00	0.96	0.00	0.00