Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP1-102G20.3	Gene	0	0.34	0.75	0.35	1.13	0.00	0.00	0.32	0.19	2.98	1.67	0.81	0.81	0.44	0.36	7.81	1.17	1.33	0.71	1.17	0.00	0.75	0.28	0.09	1.02	1.13	0.99	0.48	0.77	1.09
2	452442	Transcript	0	0.00	0.10	0.27	0.00	0.00	0.00	0.20	0.08	0.98	0.59	0.43	0.00	0.08	0.08	3.36	0.44	0.37	0.32	0.39	0.00	0.42	0.14	0.00	0.26	0.29	0.34	0.41	0.00	0.17
3	448686	Transcript	0	0.26	1.66	0.00	2.43	0.00	0.00	0.34	0.04	4.24	2.70	1.54	2.26	1.14	0.92	9.36	2.09	2.28	1.31	0.81	0.00	1.14	0.31	0.31	1.62	1.39	0.80	0.00	1.01	2.25
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.73	1.40	0.00	0.00	0.63	0.66	7.63	1.21	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.65
5	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	6.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	35.28	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	3.05	3.22	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix	Intron	0	0.81	1.30	0.16	1.69	0.85	0.22	0.89	0.67	2.69	2.25	1.91	0.61	1.06	0.22	10.44	1.34	3.22	1.14	0.85	0.71	1.41	0.28	0.20	1.18	2.83	1.68	1.50	1.00	2.51
8	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00	4.72	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.29	0.32	0.00	0.00	0.66	0.19	0.40	0.75	1.82	1.18	0.49	0.33	1.42	0.12	8.78	1.55	1.37	1.03	0.87	0.96	1.36	0.72	0.25	0.00	1.17	1.50	1.49	0.36	0.83
10	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.95	0.48	0.00	0.00	2.90	0.48	1.72	0.00	3.08	1.88	0.00	1.10	2.47	0.20	9.10	1.26	4.47	2.40	0.95	0.59	2.45	0.28	0.54	0.78	1.57	0.93	2.50	0.91	2.75
11	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	4.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.20	1.08	2.00	0.00	0.00	2.81	1.43	1.80	0.00	2.15	1.43	0.00	1.83	3.26	0.19
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.88	1.58	0.21	2.20	0.60	0.18	0.84	0.75	2.80	2.48	2.41	0.59	0.82	0.24	10.92	1.34	3.35	1.00	0.85	0.69	1.29	0.21	0.15	1.42	3.29	1.83	1.37	1.11	2.76
13	E2_Aa	NovelBoundary	0	6.02	0.00	3.94	10.78	6.93	0.00	0.00	7.42	5.97	0.00	6.26	1.78	1.62	1.06	51.62	0.00	4.30	9.25	16.18	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	2.24	0.00	2.58
14	ER2a	ExonRegion	0	0.71	0.00	0.55	2.37	0.00	0.00	0.00	0.00	3.16	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	9.93	0.82	1.48	0.00	3.17	0.00	0.00	0.60	0.00	1.42	2.39	2.04	0.61	2.70	0.89
15	E2_Da	NovelBoundary	0	5.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.56	3.81	2.04	6.20	0.00	0.00	1.11	32.29	0.00	7.07	9.25	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.54	0.00	0.00	5.98	9.01
16	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.78	0.00	0.00	1.33	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	2.87
18	ER3a	ExonRegion	0	1.96	1.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14	3.01	4.11	0.30	0.28	0.27	0.00	5.29	0.07	0.00	0.00	1.15	0.00	0.28	0.00	0.00	0.85	1.25	1.22	0.00	0.39	1.00
19	E3_Da	KnownBoundary	0	5.78	9.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	9.53	6.99	1.55	1.20	2.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.09	0.00	1.80	0.00	0.00	3.05	1.67	0.00	0.00	2.16	1.91
20	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER3b	ExonRegion	0	0.26	1.66	0.00	2.43	0.00	0.00	0.34	0.04	4.24	2.70	1.54	2.26	1.14	0.92	9.36	2.09	2.28	1.31	0.81	0.00	1.14	0.31	0.31	1.62	1.39	0.80	0.00	1.01	2.25
22	E3_Db	NovelBoundary	0	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.49	0.00	2.40	0.00	0.00	0.00	0.00	3.67	0.92	0.00	0.00	0.00	5.33	0.00	0.00	0.00	0.00	7.21	0.00	1.71	1.42
23	Ix	Intron	0	1.08	2.68	0.07	0.88	1.13	0.82	0.58	1.15	5.04	2.26	2.48	1.09	1.27	0.26	10.00	2.25	4.25	1.25	1.57	1.31	2.19	0.93	0.37	0.82	2.45	1.56	2.39	2.15	2.45
24	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.46	0.00	1.85	2.62	0.38	0.66	0.00	2.38	2.86	3.62	1.25	0.00	0.00	19.04	0.00	5.80	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	1.53	0.20	0.00	1.75	1.07
25	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.11	2.70	0.07	0.88	1.13	0.86	0.56	1.17	5.21	2.27	2.45	1.10	1.35	0.27	10.06	2.34	4.33	1.33	1.61	1.36	2.33	0.99	0.37	0.86	2.54	1.65	2.51	2.19	2.54
26	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.91	1.37	0.00	0.00	0.00	0.17	0.86	1.56	2.21	1.66	2.50	0.78	0.00	0.00	1.40	1.41	0.70	0.00	0.19	1.17	0.00	0.00	0.00	0.25	0.52	0.00	0.78	1.34	0.86
27	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	5.39	1.52	5.09	0.00	1.62	0.00	25.11	7.65	1.40	0.00	8.09	3.72	2.05	0.00	0.00	3.05	3.52	4.38	0.00	2.29	2.05
28	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.73	1.89	2.33	0.00	0.00	0.00	9.05	0.00	0.98	0.00	2.09	0.00	0.00	1.09	0.00	1.41	0.93	0.00	1.20	0.00	0.00
29	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.40	0.00	7.37	1.96	0.00	2.24	1.89	2.00	6.93	1.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	0.00	2.29	1.78
30	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	Ix	Intron	0	0.89	2.21	0.23	0.99	0.68	0.44	0.28	0.93	4.70	1.60	1.75	0.17	0.33	0.13	10.28	1.36	2.68	0.56	1.03	0.25	1.31	0.50	0.33	0.79	0.92	1.38	0.84	0.98	1.63
32	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.74	2.41	0.19	0.83	0.57	0.64	0.00	1.50	7.48	2.52	2.77	0.21	0.60	0.00	13.01	2.35	3.64	1.19	0.74	0.64	1.99	1.05	0.21	1.00	1.66	1.46	1.28	1.51	2.17
33	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.36	2.29	0.28	1.21	0.82	0.35	0.51	0.62	3.17	1.10	1.20	0.16	0.16	0.23	9.37	0.78	2.26	0.16	1.35	0.00	0.96	0.15	0.46	0.73	0.48	1.46	0.62	0.69	1.41
34	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.95	2.04	0.00	2.80	0.00	0.00	19.13	0.00	3.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	1.67	0.00	0.00	0.00
35	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.58	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	2.12	0.03	1.12	0.00	0.00	0.00	4.77	2.34	0.00	0.05	0.00	0.00	3.37	0.05	0.00	0.00	0.00	2.23	0.86	0.00	0.07
36	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.24	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	7.57	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.49	1.32
37	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	Ix	Intron	0	0.00	2.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	2.11	1.48	0.00	0.64	1.99	0.00	5.98	0.00	1.28	0.00	1.64	0.00	2.20	0.00	0.00	1.10	1.22	0.54	3.45	1.39	1.03
39	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	2.12	1.49	0.00	0.64	2.01	0.00	6.02	0.00	1.29	0.00	1.65	0.00	2.21	0.00	0.00	1.11	1.23	0.54	3.47	1.40	1.03
40	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	2.04	0.00	1.54	1.59	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	2.05
41	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.77	0.55	0.00	0.00	0.00	0.67	0.61	2.23	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	5.46	0.00	1.98	0.60	1.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.52	1.21	0.00	0.61