Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC011460.2	Gene	0	1.33	1.95	0.24	1.04	0.93	0.39	0.48	1.49	0.69	1.23	0.11	0.96	0.12	1.36	3.20	2.64	2.20	1.41	0.91	2.55	0.61	0.51	0.17	1.02	0.82	0.45	0.44	1.01	0.13
2	500242	Transcript	0	0.49	1.47	0.59	0.52	0.46	0.17	0.19	0.56	0.37	0.52	0.00	0.41	0.06	1.04	3.13	1.44	0.64	0.76	0.23	1.03	0.37	0.32	0.04	0.48	0.63	0.27	0.27	0.46	0.32
3	499495	Transcript	0	1.59	0.79	0.44	0.00	0.00	0.22	0.24	0.71	0.24	0.72	0.00	0.86	0.00	0.68	0.00	1.31	4.29	0.00	0.13	2.98	0.30	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.06	0.00
4	IG10	Intergenic	0	3.09	6.10	2.13	1.83	7.55	1.80	2.19	2.25	2.26	3.33	5.41	4.80	0.26	7.54	4.49	4.22	7.81	1.61	8.73	3.85	3.78	0.73	1.14	1.31	2.94	2.14	5.38	2.96	0.92
5	IG10_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	4.91	8.03	1.55	4.11	10.80	3.67	6.38	3.82	5.45	6.26	12.01	8.52	0.45	8.19	7.49	7.17	11.15	3.29	11.50	7.62	6.58	1.90	2.12	3.40	3.33	1.05	5.63	3.25	2.04
6	IG10_SR1	SilentIntergenicRegion	0	2.23	5.23	1.31	0.75	6.48	1.05	0.53	1.46	0.91	2.11	2.45	3.05	0.19	5.93	2.91	2.93	5.81	0.88	6.52	2.09	2.40	0.24	0.47	0.49	2.17	1.82	5.17	1.61	0.41
7	IG10_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	2.37	10.27	2.55	4.23	6.59	1.62	0.00	2.84	1.01	1.80	3.65	4.23	0.57	16.23	6.22	5.71	10.91	0.00	11.46	4.11	3.74	0.00	1.47	0.63	5.71	5.48	7.11	9.05	0.40
8	IG10_SR2	SilentIntergenicRegion	0	2.84	3.52	6.47	0.00	5.04	0.71	0.52	1.66	1.16	2.42	3.40	3.79	0.00	8.68	3.43	2.22	7.03	1.49	10.24	2.42	3.08	0.47	1.46	0.28	3.92	4.30	4.96	5.04	0.69
9	ER1a	ExonRegion	0	0.00	3.28	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1b	ExonRegion	0	1.74	1.30	1.12	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	1.19	1.93	0.00	0.00	1.45	6.13	1.45	0.00	0.00	5.17	3.57	0.00	0.00	1.46	3.48	0.95	0.00	0.00	0.00	0.85
11	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	9.11	5.95	0.00	6.19	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	3.04	0.00	5.14	0.00	3.44	2.14	0.00	0.00	2.98	0.00	2.19	4.38	0.00	4.96	0.00	0.00	0.00	1.25
12	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39
14	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.51	3.08	1.94	0.00	1.97	1.46	1.30	0.00	0.00	2.21	0.00	2.47	0.00	3.66	0.00	2.56	2.66	1.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	2.20	0.83	2.40	6.45	0.00
15	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.31	5.17	2.97	0.00	3.05	1.88	0.41	1.14	0.22	2.75	1.66	2.87	0.00	10.18	1.65	3.77	6.04	1.53	4.68	2.40	0.67	0.36	0.61	0.86	2.59	2.11	5.73	5.88	0.28
16	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	1.97	4.55	0.73	0.00	1.40	2.61	0.50	0.22	0.48	2.49	1.20	2.56	0.55	6.37	0.00	4.88	3.02	0.94	6.10	0.00	4.13	0.00	0.77	0.00	0.61	0.81	3.47	1.74	0.18
17	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.10	6.08	0.86	2.46	3.35	0.24	0.00	0.63	0.19	2.73	1.23	3.18	0.00	4.66	0.00	2.44	3.84	1.65	6.03	1.89	2.45	0.00	0.31	0.74	2.70	1.08	5.66	2.24	0.00
18	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.70	3.78	0.49	0.00	7.54	0.89	0.26	0.48	3.45	1.12	0.00	1.36	0.00	2.55	0.17	1.93	5.48	0.48	3.42	0.95	0.92	0.35	0.23	4.58	1.65	0.61	0.00	0.00	0.26
19	I1_SR5	SilentIntronRegion	0	0.71	1.82	1.48	0.00	7.03	1.37	1.78	2.44	2.35	1.28	0.39	1.62	0.29	3.32	0.61	4.11	7.97	0.00	4.58	1.00	0.79	0.40	0.20	3.21	1.93	1.73	0.00	0.54	0.15
20	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	2.45	0.82	2.13	0.00	5.58	0.87	0.77	8.88	4.48	1.10	0.30	3.52	0.16	3.50	1.76	4.19	13.82	0.24	0.41	3.15	0.36	0.00	0.23	2.46	3.63	0.80	2.32	0.00	0.42
21	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	1.80	2.56	0.56	0.00	5.75	2.55	0.00	1.24	3.77	1.22	1.20	3.53	0.00	3.89	0.00	3.94	5.78	0.32	6.45	3.71	1.68	1.21	0.00	2.53	1.92	0.26	0.92	0.00	0.56
22	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.48	3.93	0.64	0.00	0.53	1.74	0.00	0.39	1.33	1.70	0.00	1.94	0.00	1.90	0.85	1.62	3.29	0.00	2.26	1.35	0.54	0.78	0.09	2.29	0.77	0.98	2.39	0.09	0.00
23	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.12	0.00	0.87	0.00	0.00	3.03	0.00	0.00	0.87	1.09	0.00	0.00	0.00	3.04	0.00	0.00	4.14	0.00	6.65	0.00	1.48	0.94	0.07	0.46	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00
24	Ix	Intron	0	2.97	2.84	0.26	0.00	0.75	1.48	0.93	0.28	1.04	0.89	0.55	1.14	0.00	0.63	0.71	4.59	3.68	0.59	2.95	4.13	0.22	0.56	0.56	0.66	0.88	1.45	3.39	0.00	0.00
25	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.99	2.86	0.26	0.00	0.76	1.49	0.94	0.29	1.04	0.90	0.55	1.15	0.00	0.63	0.71	4.62	3.70	0.60	2.97	4.15	0.22	0.56	0.56	0.67	0.89	1.46	3.41	0.00	0.00
26	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.91	0.00	0.00	0.00	3.99	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	5.81	6.19	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	8.75	2.14	3.77	0.00
27	ER2a	ExonRegion	0	6.16	2.31	0.00	0.00	0.00	0.99	1.42	0.00	0.00	1.04	0.00	0.14	0.00	1.88	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	1.43	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.15	0.00	19.45	0.00	2.92	0.00	3.01	1.72	0.00	2.77	0.00	1.06	0.00	3.67	6.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.27	3.67	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.88	0.46	0.00	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00	2.03	0.00	0.00	1.51	2.04	2.87	0.00	2.63	0.00	0.39	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00
31	E3_Aa	NovelBoundary	0	7.79	8.63	10.96	28.04	7.37	0.00	5.49	5.08	7.73	8.99	20.31	37.41	38.88	17.06	8.77	7.19	69.44	0.00	0.00	0.00	0.00	6.76	12.56	0.00	0.00	2.19	2.53	6.87	24.33
32	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.17	1.14	1.32	0.00	1.53	0.00	0.00	0.00	0.29	2.65	0.00	0.00	1.99	0.76	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E3_Da	NovelBoundary	0	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.06	0.00	1.52	0.00	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	4.70	0.00	0.00	3.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E3a_E4a	KnownJunction	0	2.89	0.00	2.67	0.00	0.00	0.00	0.00	2.44	0.00	1.88	0.00	2.77	0.00	2.22	0.00	3.52	19.36	0.00	0.00	12.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	7.05	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER4a	ExonRegion	0	0.51	2.16	0.00	0.00	0.00	0.31	0.00	1.67	0.29	0.08	0.00	0.73	0.00	0.00	0.00	1.06	3.76	0.00	0.76	2.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.39	0.00
37	E4_Da	NovelBoundary	0	5.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	4.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
38	ER5a	ExonRegion	0	1.19	1.80	0.15	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.93	0.39	0.00	0.69	0.00	1.46	0.46	3.37	0.42	0.54	0.00	0.81	1.19	0.53	0.00	0.61	0.80	0.44	0.51	0.00	0.08
39	E5_Da	NovelBoundary	0	5.07	0.00	5.86	0.00	0.00	1.73	2.46	4.28	2.86	5.43	0.00	11.14	0.00	2.90	0.00	15.99	12.18	0.00	0.00	3.56	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	5.54	0.00	0.00	4.59
40	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	E6_Aa	NovelBoundary	0	13.68	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	18.31	9.04	3.87	0.00	4.40	0.00	3.52	9.37	3.60	28.95	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	4.53	0.00	3.37	1.97	0.00	2.25	0.00
42	ER6a	ExonRegion	0	1.26	2.27	0.34	2.58	2.30	0.48	0.95	2.81	0.92	2.19	0.00	1.37	0.31	2.20	6.81	3.81	2.81	3.24	1.13	3.57	0.67	1.05	0.22	1.76	1.18	0.92	0.86	2.29	0.16