Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC008888.2	Gene	0	0.57	0.74	0.29	0.55	1.12	1.50	0.42	0.53	1.13	1.21	0.93	0.85	0.48	0.96	0.49	0.91	2.86	1.11	0.73	0.18	0.79	1.45	0.97	2.51	2.49	2.28	1.16	1.75	1.23
2	430145	Transcript	0	0.18	0.32	0.06	0.24	0.41	0.58	0.13	0.21	0.55	0.65	0.27	0.28	0.16	0.40	0.21	0.38	1.71	0.34	0.27	0.08	0.62	0.54	0.30	1.48	0.73	0.78	0.40	0.72	0.57
3	474419	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.00	0.00
4	483163	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
5	473944	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E1_Ab	KnownBoundary	0	15.99	7.66	29.90	51.98	109.94	17.65	7.90	2.29	20.59	11.10	4.08	5.30	1.91	9.59	7.77	0.00	14.14	0.00	0.00	0.00	7.42	45.36	26.79	26.38	31.79	9.18	31.11	1.98	10.23
8	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.59	0.77	0.00	1.23	1.50	0.00	1.03	0.63	0.00	0.44	0.00	0.00	3.89	0.00	1.75	0.00	0.00	0.82	0.00	0.00	2.82	2.10	2.39	0.00	0.48
9	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	14.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	3.01	0.00	1.02	0.00	3.52	2.25	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E1a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
11	Ix	Intron	0	5.41	0.61	1.64	3.52	2.39	3.85	1.84	1.03	2.87	3.14	1.50	1.25	0.64	1.81	3.68	3.65	16.73	2.18	2.24	3.47	1.50	2.40	0.63	7.38	3.30	2.53	0.90	0.34	2.90
12	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.96	0.00	0.77	3.31	2.25	2.86	3.72	1.27	3.24	2.33	0.82	0.00	0.00	0.22	1.06	4.01	3.11	1.78	2.95	1.91	1.32	7.07	1.67	4.47	1.98	1.81	0.00	0.38	1.39
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.64	2.33	0.00	5.39	0.00	0.00	0.16	0.00	0.30	0.00	0.16	1.24	1.64	1.65	0.00	0.00	5.43	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	5.32	1.20	0.41	0.00	0.00	0.71
14	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.43	2.96	0.00	13.16	1.49	0.00	2.02	0.00	2.25	0.00	1.19	1.24	2.60	2.81	0.00	0.00	9.02	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	8.60	1.43	3.14	0.00	0.00	1.34
15	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	5.25	0.74	2.29	3.34	2.76	4.87	1.09	1.05	3.00	3.96	2.00	1.91	0.84	2.64	5.48	3.97	25.10	2.67	2.19	4.60	1.79	0.41	0.21	9.16	4.28	3.13	1.47	0.37	3.96
16	Ix	Intron	0	3.05	0.00	2.38	0.00	0.99	1.97	0.41	0.00	0.46	1.76	0.97	1.37	0.39	0.64	2.99	0.87	6.07	0.39	1.30	0.56	0.29	0.73	0.37	4.37	0.87	0.00	1.12	0.33	0.68
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.52	0.00	2.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	1.75	1.45	0.47	0.00	0.82	2.67	2.59	5.59	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	6.02	1.50	0.00	3.34	0.00	0.00
18	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.86	0.00	2.16	0.00	1.52	3.01	0.63	0.00	0.53	1.80	0.74	1.86	0.60	0.56	3.21	0.00	6.42	0.60	1.99	0.86	0.44	0.00	0.56	3.61	0.57	0.00	0.00	0.51	1.04
19	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	2.38	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	2.30	1.04	0.00	0.00	0.65	0.00	1.98	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	Ix	Intron	0	1.12	2.03	0.88	0.00	0.00	1.01	0.42	0.19	0.94	0.30	0.50	0.78	0.14	0.90	0.48	2.98	2.66	0.00	0.67	0.58	1.05	0.00	0.00	4.06	0.45	1.15	0.00	0.17	0.63
22	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.16	2.09	0.90	0.00	0.00	1.04	0.44	0.20	0.97	0.31	0.51	0.80	0.14	0.93	0.50	3.07	2.74	0.00	0.69	0.60	1.08	0.00	0.00	4.18	0.46	1.19	0.00	0.18	0.65
23	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	2.16	0.78	0.00	2.09	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	2.83	0.00	5.06	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00
24	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	1.53	0.14	0.00	1.58	0.40	0.33	0.17	0.00	0.38	0.00	3.22	6.00	0.54	0.00	0.00	1.59	0.50	0.00	0.90	1.34	0.00	0.00	0.00	0.19
25	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.64	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	5.62	3.18	0.00	0.00	0.00	3.37
26	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.23	0.27	0.00	0.00	0.03	0.00	0.37	1.11	0.00	0.19	0.00	0.00	2.09	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	1.93	0.00	0.10	0.00	0.00
27	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.42	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	2.91	5.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	0.00	0.00	0.42	1.07	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	4.96	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	0.00	3.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.50
31	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.50	9.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.27	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E3a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.12	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00
34	E4_Ab	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.49	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.09	0.00	0.00	0.00
36	ER4b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	4.31	0.89	0.33	0.00	0.00	0.50	0.00	0.00	2.14	0.71	0.00	0.00	0.00
37	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00
38	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	8.09	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	4.18	0.78	1.19	0.32	0.00	2.22	3.29	1.44	2.22	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	3.51	4.58	0.00	0.00	0.57
40	E5_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.91	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	2.89	1.78	1.00	0.00	0.00	3.85	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.11	4.33	0.00	0.00	0.00
41	ER5b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.51	0.58	0.62	0.56	1.39	0.00	0.00	1.75	0.80	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	1.52	2.90	0.99	0.00	0.00	0.48
42	E5_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.20	0.00	0.00	0.00	1.97	2.33	6.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00	0.00	0.00	1.16
43	ER5c	ExonRegion	0	0.55	0.00	0.54	0.00	0.00	0.79	0.39	0.00	0.00	0.46	0.53	0.39	0.19	0.25	0.00	0.00	2.20	0.74	0.00	0.00	0.09	0.12	0.92	1.10	1.91	0.83	0.59	0.31	0.26
44	E5_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.13	0.00	0.00	0.00	0.00	3.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	3.82	0.00	0.00	0.00
45	ER5d	ExonRegion	0	0.89	1.61	0.28	1.19	2.03	2.41	0.67	1.07	2.31	2.16	1.34	1.38	0.81	1.64	1.07	1.88	3.11	1.70	1.33	0.39	1.48	2.70	1.51	4.21	3.18	3.91	1.98	3.60	2.34