Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC020763.1	Gene	0	3.26	2.74	4.41	1.02	0.46	2.42	1.20	0.57	3.57	5.05	1.25	6.05	1.32	0.93	2.55	1.76	1.81	3.91	3.11	0.98	3.36	1.54	0.82	1.23	1.66	1.94	1.09	1.47	0.43
2	398177	Transcript	0	0.57	0.91	1.54	0.12	0.06	0.46	0.50	0.15	0.68	1.61	0.15	2.14	0.26	0.19	1.13	0.32	0.27	1.52	0.77	0.36	0.58	0.25	0.32	0.15	0.33	0.35	0.13	0.50	0.10
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	1.40	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.57	0.98	0.00	0.00	0.65	0.00	1.39	0.00	0.62	0.00	0.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.83	0.00	0.00	4.34	1.53	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	8.09	0.00	0.00	2.33	6.50	0.00	1.44	0.00	0.00	2.11	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	0.64	0.48	1.87	0.00	0.00	1.33	0.45	0.27	1.30	1.08	1.24	2.25	0.97	0.51	0.00	0.37	0.89	1.60	0.48	0.41	0.96	0.27	1.48	0.32	0.96	0.00	0.00	1.46	0.00
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.64	0.48	1.87	0.00	0.00	1.34	0.45	0.28	1.30	1.08	1.25	2.26	0.97	0.51	0.00	0.37	0.89	1.61	0.48	0.41	0.96	0.27	1.49	0.32	0.96	0.00	0.00	1.46	0.00
8	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	1.54	0.00	0.00	17.94	7.27	2.14	4.62	0.00	3.47	3.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.00	1.68
9	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	3.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	2.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	5.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	4.14	0.00	3.49	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.94	2.22	4.09	2.78	0.00	1.44	1.57	0.45	2.21	1.19	0.40	3.96	2.69	0.76	1.31	0.32	0.19	1.75	1.50	2.08	1.40	2.90	3.02	0.56	1.30	2.39	0.00	0.42	0.00
13	E3_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.37	0.00
15	E3_Da	NovelBoundary	0	3.01	4.75	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
16	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.73	0.27	1.75	0.45	0.00	0.30	0.13	0.04	0.36	1.89	0.07	0.56	0.09	0.06	0.35	0.15	0.49	0.25	0.70	0.00	0.98	0.17	0.00	0.00	0.27	0.93	0.00	0.20	0.17
18	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.59	0.95	2.31	0.00	0.00	0.25	1.66	0.28	0.35	5.34	0.64	1.45	1.01	0.00	4.38	0.00	0.91	1.17	1.31	0.00	2.89	0.00	0.74	0.88	0.00	0.00	0.00	0.22	0.55
19	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.54	1.64	4.84	1.14	0.00	0.00	0.00	0.00	2.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00	7.75	0.00	2.91
20	ER4a	ExonRegion	0	0.96	2.48	1.88	0.00	0.00	1.23	0.00	0.00	1.75	1.06	0.00	4.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	0.01	1.41	0.00	0.73	0.60
21	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.87	0.00	0.00	0.00	5.84	0.00	2.59	0.00	0.00	4.49	0.00	0.00	0.00	0.00	4.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	0.00	1.98	0.00
22	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	5.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.78	0.55	0.91	0.33	0.00	0.81	0.37	0.42	2.38	1.78	1.08	1.71	1.00	0.45	0.00	0.31	0.75	1.17	0.73	0.00	1.43	0.25	0.00	0.78	0.85	0.14	0.00	0.15	0.94
24	E5_Aa	NovelBoundary	0	343.89	234.81	116.55	221.95	144.28	254.65	156.25	185.98	359.37	369.30	123.75	153.01	143.62	198.74	411.59	242.20	334.22	18.49	55.52	197.07	303.15	97.96	151.98	233.16	147.83	432.23	124.19	428.11	146.12
25	ER5a	ExonRegion	0	1.12	3.02	2.16	0.00	0.00	0.76	4.20	0.96	1.19	2.83	0.06	1.45	0.68	0.00	9.66	1.34	0.00	8.02	3.33	2.87	1.48	0.00	1.88	0.02	1.47	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E5_Da	NovelBoundary	0	2.24	0.00	2.82	0.00	0.00	0.00	2.80	0.00	4.99	0.00	0.00	3.10	1.46	0.00	8.37	0.00	2.59	0.00	0.00	0.00	0.00	3.99	2.51	2.51	0.00	4.21	4.92	3.86	0.00
27	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	Ix	Intron	0	1.18	0.39	3.44	0.20	0.54	0.79	0.44	0.30	2.22	2.78	0.36	3.32	0.44	0.67	2.88	0.30	1.15	1.20	0.61	0.00	0.90	0.30	0.10	0.65	0.82	0.73	0.10	0.94	0.57
29	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.67	0.33	2.36	0.00	1.03	0.78	0.28	0.00	2.06	2.14	0.67	3.09	0.00	0.54	1.43	0.18	2.00	0.95	0.68	0.00	0.40	0.51	0.00	0.46	1.01	0.44	0.00	1.38	1.23
30	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.42	0.64	4.15	0.00	0.00	0.41	0.60	0.36	1.11	2.75	0.12	3.97	0.51	0.81	3.63	0.66	0.73	0.65	0.63	0.00	0.99	0.00	0.18	1.36	0.71	1.36	0.00	0.65	0.33
31	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.23	0.26	4.12	0.59	0.40	1.13	0.50	0.61	3.32	3.53	0.20	3.05	0.91	0.71	3.96	0.15	0.50	1.95	0.53	0.00	1.41	0.30	0.15	0.29	0.71	0.55	0.30	0.67	0.00
32	E6_Aa	NovelBoundary	0	2.71	0.00	1.02	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	6.91	3.91	0.00	1.27	3.34	1.95	17.14	6.12	13.87	0.00	0.00	3.89	7.26	1.99	2.31	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER6a	ExonRegion	0	4.15	3.13	5.32	1.34	0.61	3.04	1.32	0.69	4.49	6.26	1.63	7.29	1.65	1.14	2.76	2.23	2.33	4.41	3.79	1.12	4.27	1.97	0.90	1.61	2.09	2.45	1.43	1.68	0.52