Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C16orf46	Gene	0	4.03	3.07	7.12	2.76	5.20	6.57	3.74	1.58	3.15	4.97	3.72	6.55	6.53	7.35	10.52	3.83	4.33	5.78	10.71	1.68	7.27	2.94	14.17	5.31	4.37	4.27	8.54	5.80	3.53
2	393327	Transcript	0	0.90	0.00	0.18	2.53	2.99	2.00	0.00	0.13	1.33	0.95	0.19	1.33	0.00	0.68	1.43	0.83	0.86	0.00	0.00	2.56	0.41	0.66	1.18	0.00	0.34	2.17	3.53	1.48	1.64
3	378611	Transcript	0	3.56	3.59	2.21	3.06	3.33	5.87	5.41	1.73	2.46	2.15	1.37	2.84	4.28	3.35	15.06	1.69	2.82	3.20	12.53	1.88	6.39	1.61	8.62	3.67	2.56	1.88	5.86	5.35	2.82
4	299578	Transcript	0	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	2.55	0.39	0.00	0.21	0.00	0.00	1.95	0.78	2.14	0.00	0.06	0.29	1.10	1.22	0.00	3.54	0.00	1.85	0.41	0.00	0.00	0.86	3.73	0.76
5	444657	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.28	0.00	0.05	0.64	0.00	0.00	0.00	0.10	0.45	0.82	0.00	0.71	0.00	0.03	0.06	0.58
6	ER1a	ExonRegion	0	0.90	0.00	0.18	2.53	2.99	2.00	0.00	0.13	1.33	0.95	0.19	1.33	0.00	0.68	1.43	0.83	0.86	0.00	0.00	2.56	0.41	0.66	1.18	0.00	0.34	2.17	3.53	1.48	1.64
7	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.34	3.76	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	1.87	0.00	1.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	2.34	4.31	0.00
8	E1_Ac	KnownBoundary	0	6.02	0.00	2.42	0.00	21.96	3.45	0.00	2.39	7.58	6.11	4.59	1.51	0.00	7.69	0.00	0.00	2.77	0.00	0.00	0.00	5.82	4.81	7.49	0.00	1.93	8.75	22.41	8.90	10.56
9	ER1b	ExonRegion	0	4.29	0.00	2.24	7.31	14.94	5.01	0.00	1.84	4.49	4.33	1.19	3.00	0.00	4.47	5.60	2.53	2.00	1.17	0.00	0.00	4.18	3.61	5.42	0.00	1.43	7.86	14.65	8.15	6.71
10	ER1c	ExonRegion	0	1.74	0.00	3.13	7.78	9.88	2.12	0.00	0.96	1.48	5.23	1.49	2.67	0.00	4.59	1.24	2.73	1.22	5.98	7.76	0.00	2.17	3.00	2.67	0.00	0.54	2.72	5.52	5.64	4.05
11	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.86	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.40	0.00
13	E1a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E1a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	3.76	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	2.27	0.00	1.93	0.00	0.00	1.93	1.62
15	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	4.36	1.16	0.00	0.64	0.00	0.00	1.51	0.90	1.76	0.00	0.17	0.86	3.31	3.66	0.00	2.52	0.00	3.37	1.23	0.00	0.00	0.33	2.73	0.39
16	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00
17	E2a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	1.43	3.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.10	0.00	2.17	0.00	0.00	0.00	2.24	4.04	1.88
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.96	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.05	0.10	0.00	0.09	1.29	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.05
20	ER3b	ExonRegion	0	0.00	1.73	1.84	1.48	2.02	6.01	0.83	0.26	1.51	3.64	3.28	5.45	4.29	5.28	0.00	2.26	2.29	2.98	5.28	0.00	4.98	1.31	10.94	6.87	1.09	1.98	7.62	3.01	1.32
21	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	4.85	4.29	0.00	0.00	3.80	0.00	2.34	1.67	1.64	4.18	0.00	12.58	4.94	0.00	2.98	0.00	4.62	0.00	0.00	4.09	2.48	4.19	3.05	1.74	12.02	5.81	2.20	3.70
22	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.16	0.00
23	ER4a	ExonRegion	0	4.20	1.92	10.24	1.18	4.34	5.55	1.62	1.44	2.85	6.14	4.53	8.32	7.34	9.21	4.44	4.99	4.97	6.88	5.37	1.36	6.28	3.16	16.01	4.43	4.98	6.33	7.96	3.64	2.83
24	E4_Da	KnownBoundary	0	4.54	4.56	9.94	0.00	27.41	5.03	2.63	0.00	2.65	1.64	3.23	2.89	11.30	14.93	8.17	7.04	1.40	4.62	8.09	0.00	3.97	4.08	0.00	12.98	5.49	5.71	2.29	2.29	1.95
25	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER4b	ExonRegion	0	2.86	1.75	9.38	2.93	19.48	3.09	0.67	0.00	1.70	5.29	5.34	2.69	9.90	10.66	7.72	4.50	4.01	3.21	6.54	0.00	3.87	4.69	3.94	8.13	9.08	4.23	3.26	1.30	1.67
27	E4_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	8.12	10.57	7.07	1.84	0.00	0.00	2.83	0.00	4.24	4.52	2.99	8.09	17.74	3.21	4.93	0.00	0.00	0.00	5.82	8.31	6.75	3.05	7.35	1.72	4.17	0.00	0.00
28	ER4c	ExonRegion	0	3.15	1.89	15.04	1.34	7.50	7.93	0.59	0.00	4.35	7.52	7.69	9.79	6.67	9.25	5.50	5.25	7.44	6.87	9.75	0.81	5.86	5.33	18.11	7.23	7.90	2.22	11.50	9.50	5.98
29	E4_Dc	NovelBoundary	0	0.00	4.85	2.59	0.00	0.00	1.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.03	4.94	0.00	0.00	5.65	0.00	0.00	0.00	4.05	2.48	5.02	2.75	3.33	1.93	1.94	0.00	1.75
30	E4_Dd	NovelBoundary	0	0.00	0.00	5.38	0.00	0.00	7.02	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	7.89	2.90	0.84	0.00	0.00	3.08	0.00	8.09	0.00	1.76	0.00	4.38	2.99	5.38	3.82	15.61	0.00	0.00
31	ER4d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	1.51	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	1.12
32	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.71	0.00	3.45	0.06	7.98	8.40	0.00	1.33	2.10	6.31	2.49	5.20	0.00	4.33	1.99	1.99	3.01	2.50	9.82	0.69	5.46	0.63	5.95	3.77	4.25	3.65	4.61	3.91	4.70
33	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	1.58	3.79	3.16	1.21	2.83	3.19	1.14	0.87	3.16	2.86	2.44	4.08	2.65	2.41	1.98	1.43	1.39	3.61	3.06	1.00	4.06	1.15	6.92	3.29	2.44	2.91	3.76	3.19	2.04
34	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.83	1.88	1.74	1.86	0.63	4.21	0.82	0.72	1.85	2.72	1.47	2.45	2.85	3.25	1.91	1.52	1.93	2.94	7.05	1.79	3.53	0.23	7.46	1.84	2.34	1.44	5.11	1.48	1.30
35	I4_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.07	0.00	1.88	2.65	1.04	0.00	2.37	1.67	3.36	1.03	2.17	0.87	0.00	0.64	0.96	0.99	4.10	0.35	1.28	0.46	2.09	3.04	1.10	0.61	0.71	1.88	1.28
36	I4_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.24	1.09	0.00	0.00	0.55	2.64	1.59	0.42	0.51	1.14	0.54	0.49	1.39	0.61	0.00	0.00	0.17	1.38	1.80	0.45	1.93	0.00	1.43	1.70	1.77	1.24	1.45	0.37	0.15
37	I4_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.07	0.00	0.00	1.62	2.11	1.34	0.00	1.52	0.48	0.00	1.77	0.43	1.25	0.00	1.53	0.00	0.64	1.06	0.00	1.70	0.00	0.66	1.42	1.89	0.15	3.41	0.00	0.00
38	I4_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.90	2.77	0.00	1.62	2.28	2.00	0.00	2.41	0.00	0.00	1.43	1.92	1.05	1.53	0.82	0.99	0.64	3.14	0.00	1.89	0.00	1.80	5.70	2.37	0.00	4.25	1.08	2.66
39	E5_Aa	NovelBoundary	0	5.13	9.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.59	0.00	6.20	2.80	2.15	7.57	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	11.15	0.00	2.36	12.80	0.00	3.60	5.67	5.66	0.00
40	ER5a	ExonRegion	0	7.13	7.19	4.42	6.11	6.66	9.89	10.82	3.45	4.92	4.31	2.74	5.67	8.55	6.70	30.12	3.39	4.68	6.41	25.07	3.76	12.77	3.23	17.25	7.34	5.12	3.75	11.72	10.70	5.64