Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C16orf28	Gene	0	3.85	2.55	6.21	6.44	4.08	2.94	4.12	3.71	6.03	4.16	1.18	4.89	2.99	4.48	3.56	4.27	11.19	4.29	2.18	2.06	2.74	2.12	2.91	4.33	2.48	1.61	0.28	8.38	2.74
2	382757	Transcript	0	3.09	1.06	4.21	0.99	0.00	2.09	2.84	2.80	1.10	3.03	1.16	3.74	0.81	4.66	1.09	5.34	9.48	3.35	2.07	1.55	1.50	1.13	2.45	3.56	1.52	1.75	0.00	4.78	1.61
3	301712	Transcript	0	2.93	7.98	6.78	17.27	10.88	2.31	6.53	5.21	11.72	2.83	0.67	4.62	3.28	5.75	3.61	4.17	8.10	2.61	5.12	1.40	2.23	1.73	2.03	3.44	2.23	0.50	0.22	10.41	2.85
4	ER1a	ExonRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	2.02	1.84	1.12	0.00	0.00	2.47	0.00	0.91	0.00	20.25	3.67	2.73	4.02	0.00	0.00	0.00	3.62	0.00	0.00	2.97	0.00	1.27	0.00
5	ER1b	ExonRegion	0	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	1.05	0.95	0.58	0.00	0.00	1.28	0.00	0.47	0.00	8.94	3.35	0.91	1.56	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	1.65	0.00	0.89	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.22	0.00	3.71	0.56	0.47	0.78	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.76	0.44	0.79	0.33
9	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.66	0.32	0.00	1.84	0.88	0.19	0.59	0.00	0.00	0.74	0.00	1.43	0.97	0.51	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.75	0.00	2.85	0.85
11	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.55	0.00	0.86	1.35	2.06	0.48	0.44	0.58	0.00	0.00	4.04	0.00	2.07	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	2.29	0.00	2.60	0.00
12	ER3a	ExonRegion	0	0.62	0.00	2.45	3.06	5.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	0.53	1.66	0.00
13	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER4a	ExonRegion	0	0.74	2.26	12.07	6.88	2.23	0.00	1.82	0.51	3.18	0.03	0.45	3.89	3.43	1.00	1.21	0.94	5.29	2.65	1.79	0.00	1.00	0.36	1.51	0.00	0.00	0.60	0.00	3.02	1.76
15	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER5a	ExonRegion	0	4.02	7.29	3.14	1.08	7.03	3.61	7.40	3.38	8.96	8.63	1.34	7.79	6.81	7.29	2.59	4.82	18.24	8.95	4.96	3.84	3.83	3.21	2.61	3.23	1.61	4.70	0.00	11.64	2.92
17	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	12.60	5.93	21.57	14.74	0.00	7.44	4.48	11.57	0.00	0.00	3.04	1.88	6.60	0.00	3.82	2.57	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.95	1.49
18	E5a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	Ix	Intron	0	2.53	2.17	0.79	0.85	0.58	0.49	3.57	0.43	2.65	1.36	0.42	0.87	0.69	1.71	2.28	0.88	6.87	3.03	0.75	0.33	0.51	0.85	0.64	0.25	0.67	0.37	0.00	3.27	0.63
20	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.35	2.24	1.07	0.00	0.17	0.60	2.36	0.00	3.18	1.47	0.26	0.47	0.28	1.19	1.54	1.03	5.74	2.81	0.68	0.60	0.31	0.79	0.98	0.01	0.72	0.33	0.00	4.60	0.59
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.31	3.28	0.20	0.00	4.98	0.00	5.62	0.00	2.89	0.79	0.00	1.57	0.00	1.04	9.16	0.38	9.29	2.73	0.00	0.00	0.00	1.91	1.48	2.15	2.60	0.10	0.00	3.95	0.00
22	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.67	1.88	0.52	2.23	0.27	0.43	4.92	1.15	1.87	1.35	0.74	1.31	1.41	2.60	1.98	0.77	8.06	3.44	0.99	0.00	0.89	0.74	0.00	0.22	0.23	0.49	0.00	1.28	0.83
23	E6_Aa	NovelBoundary	0	2.89	0.00	0.97	0.00	7.37	0.00	0.00	2.24	2.83	3.67	0.00	1.54	1.94	1.33	0.00	2.98	10.33	0.00	0.00	6.78	0.00	0.00	0.00	5.38	0.00	1.76	0.00	6.02	0.00
24	ER6a	ExonRegion	0	5.85	3.35	7.62	12.97	7.02	4.62	5.62	5.95	11.88	5.66	1.33	6.19	4.67	4.90	7.23	4.51	13.63	5.22	2.15	2.81	4.45	3.46	4.05	6.89	4.46	1.01	0.44	12.87	4.21
25	E6_Da	NovelBoundary	0	5.43	0.00	0.00	0.00	0.00	3.80	0.00	9.41	1.22	1.80	1.30	1.36	0.00	0.97	0.00	3.14	4.55	0.00	0.00	0.00	3.49	0.00	0.00	5.26	5.49	0.00	0.00	4.09	2.05
26	Ix	Intron	0	3.46	0.43	1.80	0.00	0.00	1.66	2.98	4.71	3.02	2.14	0.00	1.66	0.26	2.98	3.10	5.25	8.24	1.86	1.72	0.00	1.34	0.00	0.73	3.76	2.31	2.96	0.00	7.90	0.99
27	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	3.47	0.43	1.80	0.00	0.00	1.67	2.99	4.72	3.03	2.14	0.00	1.67	0.26	2.99	3.11	5.26	8.26	1.86	1.72	0.00	1.35	0.00	0.73	3.77	2.31	2.97	0.00	7.92	0.99
28	ER7a	ExonRegion	0	4.25	4.37	12.04	4.28	0.00	4.16	7.02	6.66	3.00	7.83	3.00	9.59	2.52	12.47	3.04	7.40	23.61	6.20	2.65	4.88	3.86	3.94	4.24	7.00	4.36	5.17	0.00	10.32	5.02
29	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.72	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.48	0.57	0.00	0.83	0.00	1.29	0.35
31	ER8a	ExonRegion	0	13.39	3.05	17.40	2.67	0.00	9.07	10.81	9.53	3.58	13.38	5.12	14.12	3.12	16.92	4.61	9.74	38.61	14.51	7.83	5.99	6.63	3.97	9.30	16.10	5.10	4.14	0.00	21.86	6.28
32	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER9a	ExonRegion	0	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.83	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00