Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	ZNF774	Gene	0	3.12	2.09	0.86	3.87	1.71	5.53	1.41	3.33	1.16	3.43	0.39	1.86	0.72	1.28	1.99	2.31	3.18	1.92	1.12	0.81	1.62	1.56	2.63	3.83	3.82	1.36	4.50	0.79	3.14
2	354377	Transcript	0	4.22	1.25	0.44	2.41	4.77	4.07	1.90	3.03	0.69	2.17	0.19	1.88	2.32	0.71	5.97	1.29	4.31	0.96	0.57	0.35	1.01	0.70	2.78	2.32	6.42	0.75	2.66	0.43	1.78
3	379090	Transcript	0	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	2.58	1.88	3.41	1.06	0.00	0.00	3.61	0.00	0.00	7.95	1.10	0.98	2.59	6.61	1.33	0.69	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	1.59	4.63
4	ER1a	ExonRegion	0	0.65	0.02	0.00	2.19	0.00	0.42	0.62	0.56	0.07	0.00	0.36	0.38	0.00	0.47	0.00	1.52	0.49	2.35	0.00	0.00	0.44	2.20	1.66	0.66	0.87	0.96	1.68	0.50	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER2a	ExonRegion	0	3.97	2.64	1.74	0.00	0.00	3.90	0.39	3.11	0.60	0.60	0.77	1.03	0.80	1.12	2.28	1.03	1.45	2.75	0.00	0.00	0.00	3.74	0.96	2.22	3.43	0.86	0.00	0.00	2.76
8	E2a_E3a	KnownJunction	0	2.89	0.00	2.19	0.00	0.00	3.61	5.72	1.94	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	3.72	0.00	0.00	1.40	13.87	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	3.05	5.27	3.35	0.00	0.00	6.93
9	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER3a	ExonRegion	0	4.65	0.00	1.18	0.00	1.02	5.00	1.19	4.42	0.90	1.38	0.24	2.12	0.70	1.42	1.83	1.28	2.86	1.15	2.03	3.57	0.00	0.86	1.88	1.55	2.39	1.26	5.24	1.11	3.07
11	E3a_E4a	KnownJunction	0	5.13	0.00	0.00	0.00	7.37	1.76	2.17	2.44	0.00	0.00	0.00	1.69	3.82	0.00	9.97	0.00	4.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	8.41	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E3a_E5a	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	2.92	4.63	1.25	0.00	0.00	4.88	0.00	0.00	7.97	0.00	1.78	4.62	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	2.29	6.40
13	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER4a	ExonRegion	0	3.30	2.51	0.89	4.82	2.17	6.37	1.63	3.63	1.37	4.35	0.38	2.07	0.82	1.43	1.98	2.59	3.78	1.91	1.13	0.70	2.02	1.40	3.05	4.65	4.43	1.50	5.32	0.87	3.55
15	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	3.88	0.00	0.00	0.00	3.91	0.00	2.54	0.00	1.48	2.85	0.00	0.00	2.30	0.00	3.60	0.00	0.00	0.00	3.14	1.97	0.00	0.00	0.00	3.79	0.00	0.00	0.00	0.00
16	I4	Intron	0	1.75	0.24	0.12	1.06	1.81	2.04	1.04	0.27	0.79	2.67	0.18	1.78	0.67	0.80	5.36	2.97	2.10	1.31	1.66	0.61	0.32	1.20	0.80	2.23	1.59	0.12	2.98	0.00	0.84
17	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.08	0.00	0.00	0.00	1.58	2.07	1.20	0.60	0.82	2.34	0.00	1.70	0.62	0.58	3.13	4.51	1.70	1.30	1.03	0.45	0.23	0.96	0.88	2.60	2.78	0.00	2.08	0.00	0.98
18	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	6.53	1.91	2.22	0.90	0.00	0.74	1.94	0.00	5.45	2.05	0.91	0.48	7.05	1.53	2.09	0.00	1.61	0.00	2.95	0.00	1.24	0.00	0.00	1.71	0.00	0.00
19	I4_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.96	0.59	0.31	1.52	2.36	2.31	1.07	0.00	0.90	3.63	0.44	1.56	0.61	1.17	9.64	1.05	3.00	1.41	2.92	0.74	0.52	1.38	0.99	2.36	0.78	0.29	4.73	0.00	0.97
20	E5_Aa	NovelBoundary	0	2.24	0.00	0.00	0.00	7.37	5.87	0.00	0.00	0.00	5.07	1.49	3.43	0.00	2.13	0.00	3.82	5.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.68	1.93	0.00	2.04	0.00	1.52
21	ER5a	ExonRegion	0	1.09	0.00	0.00	0.00	0.00	3.55	0.84	2.19	0.87	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	7.93	2.20	0.19	0.57	5.12	2.65	1.37	0.00	0.00	0.00	0.27	0.00	0.00	0.89	2.86
22	IG50_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.63	0.00	0.00	0.00	1.21	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00