Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	SMAD6	Gene	0	3.19	8.72	3.59	2.06	0.33	4.34	0.72	0.40	3.76	5.88	0.64	0.90	1.51	6.73	3.43	1.98	3.13	6.06	1.94	2.58	3.57	3.26	16.75	12.94	7.22	6.48	3.10	1.49	5.58
2	457357	Transcript	0	0.00	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	1.21	0.00	0.86	0.23	0.05	0.83	0.00	0.00	0.51	3.40	0.09	0.41
3	288840	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	338426	Transcript	0	2.23	20.14	0.00	0.00	0.00	0.73	0.00	0.00	0.59	1.61	0.00	0.00	2.66	3.41	0.00	2.91	1.08	0.00	0.00	0.00	1.94	1.03	4.70	2.45	5.30	5.96	0.00	0.00	6.69
5	IG16_SR4	SilentIntergenicRegion	0	0.24	0.35	0.03	0.00	0.00	0.35	0.00	0.07	1.18	0.08	0.00	0.09	0.08	0.12	0.19	0.34	0.03	22.38	0.06	0.00	0.08	0.13	5.68	0.12	0.10	0.00	0.00	0.54	3.71
6	IG16_AR8	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26
7	IG16_AR9	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68
8	IG16_AR16	ActiveIntergenicRegion	0	1.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	1.08	0.23	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.62	0.51	0.00	0.00	0.58	9.85	0.34	0.69	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.54	0.00	2.58	0.69	0.15	2.49	0.00	0.00	1.44	10.20	0.26	1.23
10	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	4.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.25	0.00	0.00	3.65	1.99	6.45	2.39	0.00	2.10	16.95	0.00	1.62
11	ER1b	ExonRegion	0	1.38	6.79	2.82	2.12	0.29	3.43	0.53	0.05	1.42	5.57	0.49	0.52	0.59	5.30	2.10	1.77	1.74	3.68	1.12	2.15	3.25	1.89	5.59	10.36	6.43	5.97	2.42	1.26	3.40
12	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	2.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	9.70	2.59	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	4.48	7.91	0.00	0.00	0.00	5.92	0.00	0.00	5.02	0.00	0.00	0.00	1.52	6.71	16.30	29.37	6.90	7.68	0.00	7.19	6.73
14	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.34	3.02	0.78	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	1.88	0.71	0.26	0.00	2.19	0.00	0.00	2.41	1.51	1.00	0.00	2.33	0.36	0.78	1.68	2.40	1.60	0.00	0.52	0.42
15	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.25	1.55	0.00	0.00	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	1.06	0.00	0.00	0.89	0.86	1.05	0.00	0.39	0.00	0.00	2.45	2.06	1.21	0.00	0.00	0.00
16	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	1.85	1.26	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00
17	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.78	1.86	0.96	0.00	1.21	0.79	0.00	0.00	0.37	1.43	0.29	0.20	0.21	1.82	1.28	0.00	0.69	0.63	1.43	0.23	0.97	0.15	1.34	1.33	2.74	1.64	0.48	0.25	0.72
18	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.91	0.00	0.00	1.00	1.19	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	4.30	0.81	0.00	1.83	0.00	0.00
19	I1_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.60	0.21	0.00	0.00	0.23	2.73	4.11	0.00	0.71	0.00	0.00	2.25	1.43	0.00	1.33	0.00	0.00
20	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	3.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.59	0.00	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	2.92	3.83	1.61	0.00	0.00	6.45	0.00	0.00	1.40	4.62	0.00	0.00	3.33	0.00	0.00	5.74	7.39	10.13	2.53	0.00	10.07
22	ER2a	ExonRegion	0	1.45	12.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	1.91	2.05	0.00	0.00	0.82	0.00	0.00	0.00	0.55	0.16	2.50	0.00	2.27	2.73	0.00	0.00	0.63
23	E2a_E3a	KnownJunction	0	3.01	28.02	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	1.19	2.04	0.00	0.00	3.41	4.76	0.00	5.81	1.33	0.00	0.00	0.00	3.33	1.90	6.89	4.90	8.33	9.18	0.00	0.00	12.74
24	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	7.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	1.34
25	I2_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	1.34
26	ER3a	ExonRegion	0	4.36	20.17	5.16	5.64	0.00	2.51	0.78	2.20	3.73	6.36	0.40	2.34	4.35	11.06	0.98	0.04	7.35	12.54	1.35	1.18	5.05	9.68	32.61	27.89	11.33	10.17	1.45	5.12	8.57
27	E3a_E4a	KnownJunction	0	2.65	18.03	8.94	0.00	0.00	3.41	2.92	2.39	9.81	4.79	2.53	2.50	2.90	12.25	0.00	0.00	13.28	9.25	8.09	4.13	5.94	11.77	37.43	29.43	11.44	7.81	4.87	0.00	13.73
28	ER4a	ExonRegion	0	8.99	14.61	10.57	0.00	0.00	5.25	0.83	2.01	12.11	11.37	2.84	6.11	1.85	19.54	15.08	7.20	10.27	14.45	7.83	4.72	6.03	9.89	52.35	39.08	10.30	23.45	6.18	1.04	17.34
29	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	E4a_E6a	KnownJunction	0	4.90	22.98	5.78	0.00	0.00	10.55	0.00	2.49	17.39	15.66	0.00	4.91	4.20	14.14	34.28	10.17	10.24	19.91	8.09	10.92	7.42	7.15	54.08	33.14	7.31	21.89	6.71	7.82	20.96
31	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00
32	E5_Da	NovelBoundary	0	2.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	4.88	5.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	I5_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	ER6a	ExonRegion	0	6.29	11.91	4.77	2.22	0.50	6.64	1.14	0.85	7.80	6.69	0.86	1.20	3.10	8.91	5.53	2.34	5.21	10.00	3.26	3.54	4.35	5.26	35.06	16.54	9.16	6.67	4.24	1.93	9.10
35	ER6b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00