Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	GNG2	Gene	0	509.03	294.75	462.14	489.42	22.35	688.88	370.96	152.03	489.25	724.84	711.51	301.41	177.05	410.94	143.23	427.64	184.79	594.14	173.57	257.81	506.97	246.71	197.19	269.56	191.62	358.44	578.71	269.25	168.34
2	335281	Transcript	0	958.74	192.34	518.87	423.33	44.93	503.86	487.11	325.54	359.93	705.37	432.93	292.22	209.71	487.24	120.96	529.22	198.91	685.39	94.19	284.32	431.82	505.42	244.11	170.22	242.37	678.09	301.27	329.53	278.23
3	ER1a	ExonRegion	0	179.99	24.18	293.13	233.51	16.81	88.61	116.30	51.16	50.95	159.75	73.43	78.31	60.55	85.40	27.33	148.91	54.56	162.85	15.24	50.20	74.91	113.13	76.81	21.78	38.62	234.16	91.66	160.02	74.66
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.32	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	926.31	130.69	427.89	747.59	134.11	378.65	814.11	242.56	434.53	972.00	407.93	326.80	289.21	518.82	91.49	608.70	239.54	470.95	48.55	260.17	411.73	561.77	282.45	151.39	262.92	1293.05	258.73	623.33	469.06
6	E1a_E3a	NovelJunction	0	230.22	4.75	22.65	8.20	5.89	20.91	24.49	41.85	5.57	21.09	7.31	0.00	10.67	27.43	0.00	7.57	2.32	28.90	8.09	28.94	23.18	56.25	6.99	2.75	5.23	19.96	15.61	7.82	10.83
7	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	3.28	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	1.12	0.00	3.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	0.00	4.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.96	0.18	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	2.45	2.68	0.00	1.95	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	4.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00
9	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.95	6.57	0.37	0.00	0.00	1.57	0.00	2.56	2.62	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	3.35	0.00
10	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.42	1.18	1.27	2.88	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00	2.00	3.52	0.41	0.00	0.00	0.00	1.11	0.83	0.00	1.14	0.00	0.74	0.00	0.34	0.00
11	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	3.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	3.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER2a	ExonRegion	0	1137.40	167.61	416.59	269.68	50.67	535.02	521.15	431.94	379.23	670.33	371.60	302.83	263.67	515.60	115.84	556.64	221.19	724.23	72.97	296.22	509.22	621.24	244.51	136.57	300.65	821.62	171.76	322.51	352.57
13	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	5.34	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E2a_E3a	KnownJunction	0	1349.88	176.64	265.84	145.38	11.79	634.56	507.55	547.62	331.72	604.06	372.15	222.68	200.97	452.77	136.53	646.34	131.97	1095.12	80.92	350.98	559.50	726.93	229.80	164.49	325.51	667.32	162.71	190.87	236.67
15	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.74	0.00	0.68	0.00	0.00	3.21	0.58	0.00	1.74	1.37	1.45	1.20	0.61	0.57	0.00	2.25	1.21	0.98	0.00	0.00	3.04	0.00	0.00	0.29	0.00	1.59	0.49	0.00	0.15
16	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	1.23	1.16	0.52	0.55	0.02	1.46	0.71	0.21	4.54	1.99	1.08	0.82	0.59	0.37	1.62	1.10	1.94	0.76	0.53	0.19	3.29	0.24	0.30	1.25	0.62	1.23	1.42	1.02	0.47
17	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.28	0.34	0.82	0.00	0.00	0.35	0.21	0.39	1.73	3.94	0.25	2.41	1.14	1.19	0.98	1.70	1.41	0.41	0.68	0.29	3.70	0.59	0.39	0.43	1.52	2.03	4.11	0.87	1.71
18	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.14	2.96	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.20	0.00	3.71	1.30	0.91	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	5.13	0.00	0.00	0.00	2.86	1.57	0.00	0.33	0.00
19	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.14	3.28	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.33	0.00	4.95	1.14	0.91	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	2.81	5.71	3.61	0.00	0.00	1.43	1.57	0.00	1.63	0.00
20	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.93	0.78	0.30	0.14	0.23	1.04	0.42	0.18	2.90	1.53	0.55	0.88	0.61	0.38	1.58	0.45	1.08	0.47	0.36	0.07	2.76	0.32	0.07	1.00	0.35	1.10	0.62	0.94	0.26
21	I2_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.91	0.92	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	3.05	0.62	0.00	0.44	0.00	0.13	0.00	0.00	0.21	0.83	1.78	0.00	1.63	0.52	0.78	0.00	0.41	1.80	1.05	0.70	0.19
22	I2_SR6	SilentIntronRegion	0	2.39	0.60	1.26	0.00	0.00	0.17	0.00	0.00	2.61	1.52	0.60	0.34	0.33	0.30	0.00	0.00	0.74	0.50	0.42	0.77	2.59	0.00	0.56	0.00	0.36	1.50	0.69	1.84	0.42
23	I2_AR10	ActiveIntronRegion	0	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	4.49	3.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	I2_AR11	ActiveIntronRegion	0	12.64	2.20	3.63	2.84	0.00	1.61	1.30	1.60	2.36	3.40	2.71	0.55	0.40	2.51	2.35	1.65	1.01	4.70	1.11	0.93	3.23	0.66	1.56	0.27	0.13	3.67	1.70	1.91	4.52
25	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.38	0.00	0.00	0.00
26	ER3a	ExonRegion	0	1177.34	214.11	609.56	422.24	22.03	521.17	425.06	381.64	251.45	662.32	463.81	294.93	192.55	578.38	103.23	558.24	175.02	802.66	95.90	300.04	386.80	607.41	303.13	191.90	251.96	545.59	234.82	246.26	192.30
27	E3_Da	NovelBoundary	0	7.67	0.00	0.00	0.00	0.00	3.91	0.00	0.00	0.00	0.00	5.44	1.42	0.00	1.82	0.00	7.65	2.27	13.87	0.00	0.00	2.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E3a_E4a	KnownJunction	0	1416.54	295.60	1137.71	614.08	56.30	587.22	622.38	469.29	510.41	1061.35	526.56	486.77	269.12	809.96	210.88	724.90	366.99	895.80	145.66	447.40	508.16	659.49	362.23	216.29	307.21	821.42	524.06	478.88	443.97
29	I3	Intron	0	8.94	3.00	1.65	2.25	0.08	8.38	1.12	0.52	2.81	8.15	1.88	1.29	0.20	3.37	1.10	6.28	2.11	4.76	1.08	1.15	3.65	0.42	0.33	0.86	0.80	1.03	1.00	1.56	0.24
30	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	10.18	3.08	1.15	1.64	0.00	8.89	1.62	0.11	1.64	6.78	1.77	1.34	0.00	2.85	0.26	9.48	1.20	5.57	2.01	1.10	3.51	0.31	0.21	1.85	0.41	0.81	0.84	1.87	1.03
31	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.67	2.32	0.26	0.00	0.00	0.86	1.15	0.32	2.42	2.04	0.00	0.53	0.00	1.12	0.00	3.67	0.88	1.87	0.00	0.00	0.00	0.81	1.17	0.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	8.19	2.14	1.82	1.71	0.00	8.08	0.95	0.63	1.18	8.02	1.82	1.09	0.15	3.08	0.86	5.14	1.56	4.00	0.98	0.91	3.46	0.33	0.33	0.35	0.50	0.91	0.48	1.62	0.05
33	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.83	6.40	1.90	4.11	0.73	9.41	1.71	0.28	8.30	7.44	1.14	1.48	0.29	4.64	2.64	7.23	4.74	5.72	0.96	0.83	4.45	0.58	0.36	0.65	0.61	1.14	1.28	1.76	0.47
34	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	12.75	5.97	1.36	5.00	0.28	9.70	1.26	0.53	10.00	11.08	2.77	2.26	0.64	5.10	2.67	8.67	4.85	7.67	0.74	2.56	4.79	0.94	0.39	2.50	2.79	1.92	3.75	1.02	0.32
35	E4_Aa	NovelBoundary	0	27.90	0.00	7.47	10.14	0.00	3.64	2.86	12.19	12.76	11.50	6.04	4.76	3.18	5.36	28.30	3.29	15.37	24.66	0.00	0.00	5.17	0.00	4.48	6.04	6.67	1.72	0.00	2.16	12.12
36	ER4a	ExonRegion	0	523.76	337.57	481.38	530.84	22.78	781.84	403.19	154.56	561.23	807.79	815.04	333.22	191.90	449.73	161.42	460.81	203.12	646.11	200.05	285.21	572.43	247.98	209.84	309.11	209.75	363.48	665.14	284.86	178.42
37	IG33_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04	1.52	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.81	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00
38	IG33_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.23	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	IG33_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	1.55	0.43	0.19	0.00	0.24	0.00	0.00	0.21	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.73	0.00	0.26	0.00	0.53	0.27
40	IG33_AR8	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00