Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	BMP4	Gene	0	3.27	5.22	16.37	0.53	8.17	7.37	2.38	1.27	6.66	23.97	2.69	14.58	3.44	4.11	4.99	8.04	6.79	6.62	3.30	3.85	3.89	7.94	17.74	40.73	5.87	6.88	2.30	1.56	11.18
2	395600	Transcript	0	0.00	0.00	6.03	0.00	0.00	1.30	0.00	2.24	0.02	3.48	2.08	3.38	0.00	0.00	0.00	1.80	2.04	0.10	0.00	0.00	0.98	1.87	2.03	5.00	0.97	5.63	0.00	0.25	1.32
3	245451	Transcript	0	0.63	0.19	1.94	0.00	0.57	0.88	0.33	0.30	0.27	5.12	1.17	5.08	0.02	1.15	0.00	0.68	0.14	0.00	0.00	0.00	1.99	0.83	3.79	6.85	0.61	1.18	0.00	0.40	1.55
4	417573	Transcript	0	0.41	0.62	1.20	0.00	1.81	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.24	2.93	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.47	0.00	0.00	0.79	0.00	0.00	0.04	2.89	1.37	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.21	0.00	0.00	0.00	3.74	1.60	7.20	0.00	1.09	0.00	0.50	0.00
6	ER1b	ExonRegion	0	4.99	0.00	9.75	0.00	7.47	6.21	0.00	2.62	5.23	23.66	5.20	9.06	0.00	0.78	0.00	9.64	2.25	3.67	3.13	0.00	3.79	5.75	8.17	14.81	2.64	13.84	0.00	1.35	5.32
7	E1_Da	KnownBoundary	0	2.95	0.00	4.63	0.00	7.37	3.80	0.00	0.00	3.11	13.22	2.72	7.32	0.00	0.84	0.00	3.75	0.00	0.00	0.00	0.00	4.01	2.29	4.48	0.00	1.48	6.31	0.00	0.00	5.08
8	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	11.59	0.00	0.00	1.80	0.00	4.48	0.00	4.07	2.78	6.48	0.00	0.00	0.00	3.60	3.92	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	2.46	2.81	1.93	10.17	0.00	0.00	2.64
9	ER1c	ExonRegion	0	1.90	0.57	2.97	0.00	1.72	0.99	0.98	0.90	0.82	5.82	0.54	3.13	0.05	1.42	0.00	2.03	0.41	0.00	0.00	0.00	2.31	2.50	4.24	6.36	1.83	1.65	0.00	1.19	3.09
10	E1b_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.87	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	0.00	9.55	2.97	12.11	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.65	0.00	7.14	12.74	0.00	1.89	0.00	0.00	1.55
11	ER2a	ExonRegion	0	0.83	1.24	1.12	0.00	3.62	0.53	0.00	0.00	0.00	0.02	0.47	0.48	0.73	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01
12	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	3.57	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	7.77	0.00	0.00	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	3.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	5.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.85	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	I2_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.03	0.00	0.00	3.02	5.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00
20	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.56	3.79	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	5.92	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER3a	ExonRegion	0	1.99	3.05	16.22	0.00	5.78	6.72	1.64	3.31	2.93	21.10	6.13	12.74	5.93	3.19	0.63	8.46	5.63	2.84	1.38	9.67	2.04	2.39	16.06	40.49	2.25	3.08	0.86	4.71	6.85
22	E3a_E4a	KnownJunction	0	5.66	18.03	11.36	0.00	5.89	8.36	2.63	5.08	10.66	29.00	4.27	7.74	5.10	2.26	8.37	12.85	7.72	4.62	16.18	11.99	5.98	4.47	12.12	56.35	4.93	3.73	0.00	0.00	0.00
23	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER4a	ExonRegion	0	5.69	5.07	21.86	0.97	10.10	8.29	1.25	0.71	4.23	33.97	2.97	15.94	2.85	5.39	4.23	7.59	6.74	11.07	2.58	5.54	5.14	7.12	19.20	42.07	5.07	7.45	1.45	2.19	7.71
26	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E4a_E5a	KnownJunction	0	11.21	8.53	22.62	0.00	34.48	6.83	4.75	2.24	11.79	51.57	0.00	17.65	1.97	5.49	8.37	3.60	7.11	4.62	8.09	4.13	9.67	19.69	19.50	52.64	7.39	8.67	0.00	0.00	9.28
28	ER5a	ExonRegion	0	3.15	7.17	19.47	0.64	9.72	9.30	3.52	1.41	9.91	27.60	2.80	18.65	4.53	4.96	7.55	10.29	9.25	7.84	4.81	4.07	4.46	10.92	22.78	53.18	8.23	8.68	3.57	1.30	16.09
29	ER5b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00