Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	GLI1	Gene	0	1.22	1.58	1.92	1.32	0.69	0.92	1.68	0.42	2.60	5.77	1.33	6.19	2.41	2.76	1.43	4.72	6.26	2.18	2.76	0.68	1.33	1.28	5.43	1.89	1.36	1.54	0.75	21.15	1.45
2	443131	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	228682	Transcript	0	0.60	0.56	2.27	2.14	0.11	0.85	2.72	0.04	3.61	4.62	1.37	5.24	2.92	2.33	2.34	5.29	6.51	1.60	1.71	0.71	0.97	1.30	4.63	1.68	0.99	0.83	0.19	23.30	1.16
4	IG1_SR1	SilentIntergenicRegion	0	4.67	1.29	1.96	6.75	3.49	1.91	6.08	1.94	4.67	3.03	1.78	3.91	0.83	4.09	3.12	3.05	9.03	1.39	2.58	0.01	2.74	0.92	0.61	1.27	0.61	1.60	3.74	5.91	2.00
5	IG1_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	4.49	0.94	2.73	4.03	1.14	1.94	3.37	2.58	3.99	1.96	0.42	2.60	1.32	5.89	1.47	1.39	6.49	2.55	2.56	2.79	3.96	0.00	0.79	0.02	1.04	1.37	0.00	3.40	0.66
6	ER1a	ExonRegion	0	1.56	0.00	1.12	6.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.28	0.00	0.00	0.14	0.00	1.98	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.94	0.00	0.00	0.00	0.00	4.63	0.55
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	2.65	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	1.36	0.00	0.00	0.86	0.00	3.14	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.46	0.00	0.00	0.00	0.00	10.11	3.37
8	E1a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	1.46	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	8.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.35	0.30	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	1.27	0.00	1.00	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97
10	ER2a	ExonRegion	0	0.74	0.00	0.89	3.17	0.00	0.00	0.81	0.00	0.45	1.65	0.37	0.85	0.00	0.98	0.00	0.54	1.14	0.00	2.57	0.00	0.57	0.00	2.12	0.00	0.57	0.63	0.00	11.54	1.49
11	E2a_E3a	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.91	0.00	1.27	0.00	3.01	0.00	3.06	2.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	6.65	1.55
12	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER3a	ExonRegion	0	0.48	2.54	0.72	0.00	2.68	0.00	1.82	4.04	0.62	4.08	1.13	1.68	1.08	2.00	0.00	3.97	1.77	2.49	0.00	0.00	1.24	0.00	2.96	0.00	0.00	0.00	0.00	22.84	0.29
14	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	4.75	1.17	0.00	0.00	0.00	5.61	0.00	1.25	7.51	1.55	2.71	0.00	2.10	0.00	2.75	1.40	4.62	0.00	0.00	2.05	0.00	2.31	0.00	0.00	0.00	0.00	35.59	0.00
15	ER4a	ExonRegion	0	0.00	1.91	2.03	0.00	0.00	0.36	1.76	1.92	2.77	6.73	1.64	4.97	1.66	5.10	2.63	2.70	3.87	2.09	4.99	0.00	0.90	2.35	5.61	1.12	1.47	0.00	0.00	26.41	3.63
16	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	6.75	0.00	5.60	0.00	2.86	0.00	2.68	7.59	0.00	1.87	0.00	1.93	0.00	0.00	4.19	0.00	0.00	7.03	1.72	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	21.34	0.00
17	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.03	3.23	7.41	0.00	6.27	0.00	0.00	2.14	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	17.12	0.00
18	I4	Intron	0	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.71	2.43	0.25	0.91	0.00	0.76	0.97	0.90	1.26	0.81	2.02	0.00	0.00	1.52	0.38	0.45	0.90	0.00	0.00	8.24	0.00
19	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.72	2.45	0.25	0.92	0.00	0.77	0.98	0.91	1.27	0.82	2.04	0.00	0.00	1.53	0.38	0.46	0.91	0.00	0.00	8.31	0.00
20	E5_Aa	NovelBoundary	0	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	0.97	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	2.46	0.00	0.00	1.76	0.00	5.44	0.00
21	ER5a	ExonRegion	0	0.86	0.00	1.90	2.52	1.72	0.00	0.71	0.00	0.79	6.23	2.08	7.54	0.94	4.60	0.00	2.97	4.68	2.35	4.49	0.97	0.50	0.85	4.69	0.00	0.69	0.05	0.00	20.88	0.70
22	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.60	2.25	0.00
23	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.87	0.00	3.34	0.00	3.52	0.00	3.82	4.64	0.00	0.00	0.00	0.00	3.89	6.80	0.00	3.64	0.00	0.00	17.79	0.00
24	I5	Intron	0	0.31	0.00	0.73	1.04	0.00	0.20	0.59	0.00	0.16	0.42	0.00	0.00	0.19	0.85	0.00	1.70	1.74	0.00	1.39	0.40	0.00	0.00	0.79	0.63	0.42	0.23	0.80	1.89	0.20
25	I5_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	3.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.62	0.00	0.00	1.30	0.39	0.00	1.69	3.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	1.24	0.00
26	I5_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	7.31	0.00	0.00	1.54	0.00	1.12	1.44	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	2.53	4.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.74	0.00
27	I5_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.57	0.00	0.45	0.77	0.00	0.37	0.93	0.00	0.14	0.17	0.00	0.00	0.07	0.96	0.00	2.03	1.49	0.00	0.85	0.74	0.00	0.00	0.97	1.15	0.76	0.00	0.98	2.11	0.00
28	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.72	0.00	1.49	1.51	0.00	1.37	0.00	0.00	2.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	1.98	0.00
29	ER6a	ExonRegion	0	2.26	1.46	2.49	4.06	2.16	1.92	0.58	0.00	0.10	7.70	1.39	7.08	3.94	2.39	0.00	6.97	7.41	1.09	1.41	0.00	0.73	2.14	4.42	0.00	0.97	0.80	0.00	23.58	1.97
30	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.37	0.00	6.19	1.96	2.92	0.00	1.19	3.60	0.00	12.62	2.55	4.56	0.00	0.00	6.24	0.00	8.09	0.00	0.00	2.48	4.28	0.00	1.93	0.00	0.00	34.82	0.00
31	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.81	0.00	0.00	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER7a	ExonRegion	0	2.36	0.24	2.17	0.00	0.40	0.58	2.60	0.00	1.18	4.79	1.31	10.59	2.76	2.48	0.00	2.31	8.46	1.42	0.26	0.73	2.16	3.49	6.39	0.79	1.83	1.16	2.03	22.96	2.06
33	E7_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	1.72	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	3.37	2.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.26	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	5.03	0.00	3.28	1.27	2.37	0.00	3.82	11.21	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	2.02	0.00	0.00	0.00	0.00	16.67	6.31
35	E8_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.85	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER8a	ExonRegion	0	0.01	0.07	3.04	4.88	0.07	0.65	3.06	1.07	1.32	5.80	1.20	6.60	2.31	3.24	0.00	6.70	7.23	1.42	4.34	1.61	0.97	2.03	5.18	1.46	0.10	2.42	3.00	25.11	1.47
37	E8_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.16	5.88
38	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.76	0.00	0.00	0.00	2.92	2.29	1.55	5.79	0.00	12.14	1.21	1.11	0.00	6.35	8.19	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	13.40	0.00	1.59	6.57	0.00	41.43	0.00
39	E9_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.97	0.00	5.60	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	2.74	0.00	0.95	0.00	5.81	4.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER9a	ExonRegion	0	0.00	2.93	2.26	0.00	2.96	2.97	1.58	0.68	2.02	9.88	2.91	8.61	1.46	3.13	1.70	6.55	9.81	1.29	5.92	0.00	2.65	1.54	6.92	2.66	1.52	2.48	0.67	24.12	0.63
41	E9_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.44	2.30	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	5.07	0.00	7.71	0.00	2.33	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	6.80	0.00	1.82	2.15	0.00	22.15	1.68
43	E10_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	8.57	0.00	10.13	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	ER10a	ExonRegion	0	0.95	0.71	4.42	0.25	0.00	2.12	2.98	0.04	3.61	8.40	0.02	9.02	0.92	4.14	8.27	2.23	6.47	2.62	3.53	0.00	0.94	0.49	9.49	2.25	2.95	2.91	1.62	20.09	1.03
45	E10_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	5.94	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.82	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.52	8.41	0.00	0.00	8.47	0.00	1.37	3.87	0.00	3.04	1.34	2.15	9.97	2.98	5.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.43	2.51	0.00	0.00	0.00	23.09	1.35
47	E10a_E12b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	E11_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	1.42	1.24	0.00	8.17	6.81	7.41	0.00	0.00	3.47	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	ER11a	ExonRegion	0	1.63	0.61	4.04	1.15	0.00	0.33	3.18	0.00	6.78	5.85	2.37	7.86	3.31	3.74	0.56	8.74	7.92	2.88	4.26	2.10	2.17	3.02	6.01	0.92	1.66	1.79	0.35	27.18	1.14
50	E11_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	2.29	0.00
51	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.21	0.00	0.00	1.69	0.00	0.00	6.15	3.83	3.10	6.33	2.52	1.09	0.00	7.27	8.24	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	4.33	0.00	0.00	0.00	0.00	35.68	1.91
52	E12_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	3.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
53	ER12a	ExonRegion	0	1.39	2.09	2.15	1.16	0.53	0.42	1.41	0.20	2.89	7.59	1.38	6.79	4.46	3.20	1.17	5.61	9.18	2.95	2.09	0.74	1.31	1.01	7.44	1.98	1.77	2.33	0.59	27.81	0.37
54	E12_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.81	0.00	0.00	7.20	1.72	2.59	0.00	9.87	11.48	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	0.00	0.00	0.00	3.60	0.00	16.98	1.52
55	ER12b	ExonRegion	0	1.91	2.64	0.53	1.37	0.93	1.30	1.54	0.35	2.94	3.73	1.37	5.51	1.12	1.41	1.48	4.92	4.39	1.92	2.28	0.71	1.39	1.01	3.57	3.22	0.89	1.35	1.05	15.41	2.85
56	E12_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.28	0.00	8.73	7.93	1.13	0.00	6.43	3.60	4.62	0.00	0.00	5.98	0.00	0.00	5.14	1.59	0.00	0.00	4.09	0.00
57	ER12c	ExonRegion	0	0.00	0.10	0.42	0.00	0.00	1.79	0.51	0.00	0.86	1.98	0.00	2.17	2.97	1.50	0.00	1.86	2.04	2.16	2.18	0.70	1.37	0.46	0.92	3.01	1.53	0.00	0.00	2.72	1.01