Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	MTL5	Gene	0	0.95	1.31	0.50	0.35	2.99	0.64	0.20	1.67	0.77	1.61	0.15	0.29	0.55	0.71	0.54	0.61	1.64	1.75	1.14	2.06	0.46	1.98	1.27	0.87	0.48	0.59	0.49	1.30	3.58
2	432435	Transcript	0	6.61	0.00	0.97	8.53	31.55	1.74	0.00	0.00	5.73	3.56	0.00	3.40	1.21	4.50	3.92	0.63	3.86	8.51	1.21	17.19	1.19	3.46	1.02	0.00	3.07	7.99	0.21	6.74	3.27
3	443940	Transcript	0	0.18	0.14	0.10	0.14	0.19	0.00	0.04	0.11	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.02	0.09	0.00	0.09	0.43	0.25	0.04	0.03	0.01	0.04	0.06	0.00	0.00	0.00	0.19	0.12
4	255087	Transcript	0	0.05	1.42	0.64	0.00	0.00	0.28	0.00	2.95	0.13	4.83	0.13	0.07	1.40	0.30	0.06	0.04	2.58	1.75	0.02	0.15	0.60	1.70	1.70	1.76	0.06	0.71	0.16	0.08	3.26
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.41	0.00	5.52	0.69	0.00	3.81	0.57	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	2.77	1.25	0.65	0.97	1.61	0.00	1.57	2.95	2.47	0.00	0.00	0.56	0.00	3.87	3.39
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.42	0.00	12.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.85	6.95	2.27	0.00	0.00	1.97	0.00	2.07	0.00
7	ER2a	ExonRegion	0	3.27	2.50	1.09	1.43	13.04	3.13	1.41	3.42	1.46	3.16	0.36	1.83	1.13	2.89	1.70	2.78	4.00	5.33	4.18	8.94	0.83	5.49	5.86	0.69	1.45	1.57	0.52	4.98	8.20
8	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E2a_E3a	KnownJunction	0	10.50	0.00	0.00	0.00	13.56	3.22	0.00	15.78	16.75	7.07	0.00	2.59	8.88	4.70	8.37	3.14	11.64	28.38	16.18	22.00	0.00	13.32	4.88	2.45	3.86	8.84	8.25	6.52	22.81
10	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	1.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.78	2.24
11	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34
12	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER3a	ExonRegion	0	10.41	7.35	1.78	1.38	27.29	4.74	1.29	13.55	8.64	10.22	0.38	1.14	4.66	6.77	4.26	3.58	11.05	17.08	13.29	18.14	2.75	21.25	9.52	5.15	4.74	4.95	8.07	11.46	31.51
14	E3_Da	KnownBoundary	0	5.66	0.00	1.37	10.78	12.08	1.96	0.00	0.00	8.53	0.00	0.00	4.19	1.62	2.26	0.00	3.52	7.65	4.62	8.09	27.04	0.00	5.83	6.01	0.00	3.18	4.38	1.84	0.00	6.80
15	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	18.91	3.14	0.00	0.00	0.00	1.97	3.35	0.00	0.00	3.76	0.00	0.00	0.00	0.00	4.72	2.02	2.81	0.00	2.19	5.07	6.25	13.44
16	E3a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.23	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00
17	E3a_E6a	NovelJunction	0	0.00	0.00	2.64	0.00	0.00	7.60	0.00	7.37	1.61	1.72	0.00	0.00	4.59	1.17	0.00	0.00	6.89	9.25	0.00	7.28	1.80	7.39	15.32	0.00	0.00	0.00	0.00	2.20	6.97
18	ER3b	ExonRegion	0	6.61	0.00	0.97	8.53	31.55	1.74	0.00	0.00	5.73	3.56	0.00	3.40	1.21	4.50	3.92	0.63	3.86	8.51	1.21	17.19	1.19	3.46	1.02	0.00	3.07	7.99	0.21	6.74	3.27
19	E3_Db	NovelBoundary	0	5.37	0.00	1.15	0.00	13.41	5.33	0.00	2.39	3.17	0.00	0.00	0.00	1.46	2.22	7.57	3.14	5.85	4.62	16.18	0.00	0.00	4.28	4.92	2.99	3.37	1.80	0.00	2.29	6.44
20	I3	Intron	0	1.29	0.81	0.50	1.57	9.37	2.86	0.39	1.82	2.06	3.36	0.62	0.30	1.10	2.29	0.63	1.27	3.68	4.23	3.68	6.65	0.51	1.63	2.43	1.83	0.59	1.51	0.90	4.07	6.93
21	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.31	0.73	0.99	1.13	12.83	4.52	0.32	2.60	1.03	2.28	0.20	0.20	1.66	2.18	0.00	0.91	5.94	5.75	8.17	8.53	1.35	1.99	4.28	0.00	0.23	0.25	1.45	2.43	5.27
22	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	1.18	2.36	0.54	0.00	16.72	3.89	0.44	1.43	1.63	4.43	1.42	0.32	0.69	2.57	0.00	2.16	4.36	3.46	2.30	6.55	1.46	2.31	2.35	1.65	0.72	1.61	0.00	3.36	9.38
23	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.14	1.05	0.00	0.00	3.62	8.12	0.73	1.34	6.49	8.73	0.81	0.00	5.20	1.69	0.00	0.00	8.20	5.21	1.23	2.94	0.00	0.00	3.62	3.32	2.53	0.00	2.50	9.71	12.26
24	I3_AR3	ActiveIntronRegion	0	4.29	0.00	0.00	0.00	6.05	5.01	0.00	3.55	6.10	7.01	0.17	0.00	5.20	2.79	0.00	5.06	6.87	5.46	4.53	17.27	0.00	0.52	4.13	4.30	1.33	0.00	5.49	8.27	11.22
25	I3_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.69	0.58	0.52	3.31	7.37	1.87	0.66	1.47	2.50	4.47	0.73	0.57	0.97	2.60	0.61	1.38	3.31	4.43	1.35	6.24	0.00	1.72	2.18	2.52	0.54	2.65	1.39	5.42	7.36
26	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.62	0.22	0.00	7.78	2.63	0.00	1.96	1.90	1.67	0.41	0.00	0.80	1.83	1.34	0.96	2.32	3.24	4.96	6.02	0.41	1.13	1.59	1.86	0.73	0.68	0.00	3.00	6.05
27	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	8.95	2.04	0.00	0.00	0.00	5.87	16.54	3.82	4.93	4.62	0.00	14.31	0.00	2.48	4.68	2.63	0.00	0.00	0.00	2.29	3.53
28	ER4a	ExonRegion	0	0.90	2.71	0.52	0.00	12.35	1.16	0.00	4.34	1.37	2.52	1.50	0.00	0.00	1.86	0.00	2.11	5.00	2.57	4.19	4.27	0.00	3.26	1.02	3.61	1.35	0.97	4.90	2.03	13.63
29	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	5.08	1.67	2.04	0.00	0.00	0.00	3.72	0.00	0.00	4.95	0.00	16.18	0.00	0.00	2.38	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	2.07	1.62
30	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	2.51	2.93	1.63	0.00	5.07	0.00	5.94
31	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	8.12	1.33	0.00	2.17	0.00	1.14	0.00	0.00	0.00	1.84	2.44	2.90	0.99	2.95	5.69	10.29	0.00	1.51	0.00	1.53	0.37	0.00	2.84	2.84	5.89
32	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	1.12	1.01	0.35	0.00	12.88	1.44	0.21	3.59	0.41	2.37	0.04	0.78	0.82	1.57	0.17	4.98	2.85	0.65	4.36	5.15	0.00	1.09	2.28	1.88	0.40	0.82	2.14	2.95	5.21
33	I4_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.89	1.42	0.44	0.00	8.48	2.79	0.00	2.11	0.89	2.39	0.28	0.76	1.47	1.13	0.32	0.81	5.47	2.12	2.82	4.79	0.76	1.07	0.64	2.03	1.14	0.00	0.16	4.17	2.50
34	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
35	ER5a	ExonRegion	0	0.00	3.67	1.88	0.00	0.13	0.91	0.00	4.04	1.49	1.76	0.00	0.00	0.00	0.55	0.00	2.30	1.86	2.59	0.82	0.07	0.00	3.32	1.76	3.88	0.95	0.00	1.09	0.00	8.33
36	E5_Da	NovelBoundary	0	2.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	3.60	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	4.38	0.00	5.71	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	3.60	5.94	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.00	5.32	1.63	0.00	0.00	0.00	9.28
38	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.76	0.00	4.28	0.00	1.88	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
39	ER6a	ExonRegion	0	2.05	1.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	4.86	0.64	2.94	0.62	0.00	4.07	1.59	0.00	2.25	5.38	3.56	0.00	3.16	0.82	3.44	1.04	1.67	0.63	0.18	0.00	1.98	8.61
40	E6_Da	KnownBoundary	0	4.66	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.07	1.27	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.14	0.00	2.81	0.00	0.00	7.60	0.00	0.00
41	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.45	0.00	0.00	0.00	0.00	3.89	0.00	5.50	0.00	1.76	0.00	0.00	4.99
42	ER6b	ExonRegion	0	0.18	0.14	0.10	0.14	0.19	0.00	0.04	0.11	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.02	0.09	0.00	0.09	0.43	0.25	0.04	0.03	0.01	0.04	0.06	0.00	0.00	0.00	0.19	0.12
43	I6_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.16
44	E7_Aa	NovelBoundary	0	2.24	0.00	0.00	0.00	27.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.68	0.00	4.00	0.00	4.42	0.54	0.00	2.71	0.00	0.00	0.00	2.07	3.37	0.00	0.00	1.41	1.47	2.09	2.09	0.00	1.40	0.00	0.00	4.72
46	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.92	0.00	3.60	0.00	0.00	5.29	0.00	0.00	0.00	7.32	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	8.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
47	E8_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	ER8a	ExonRegion	0	0.00	2.02	0.73	0.00	0.00	0.51	0.00	4.34	0.00	4.77	0.00	0.00	0.91	0.18	0.00	0.00	3.08	0.67	0.00	0.00	1.55	1.33	1.11	1.59	0.00	1.74	0.68	0.00	0.83
49	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	3.97	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	7.75	0.00	0.00	1.56	1.13	0.00	0.00	1.17	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62
50	ER9a	ExonRegion	0	0.00	3.08	1.85	0.00	0.00	0.80	0.00	3.36	0.00	4.47	0.34	0.53	0.13	0.92	0.00	0.00	2.91	0.16	0.00	0.00	1.26	3.02	1.05	0.76	0.00	0.46	0.53	0.00	4.39
51	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.94	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	4.09
52	ER10a	ExonRegion	0	0.41	2.32	0.56	0.00	0.00	0.26	0.00	1.14	1.08	2.00	0.17	0.00	0.56	0.19	0.44	0.36	1.65	0.56	0.15	1.19	0.55	1.58	0.70	1.63	0.48	0.30	0.09	0.63	3.76