Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC112694.1	Gene	0	1.83	0.91	0.65	2.04	3.47	0.63	0.79	0.72	1.19	1.13	1.22	0.90	1.03	0.69	1.15	0.61	0.85	1.32	0.57	1.07	0.61	1.40	0.83	0.46	0.51	0.28	0.33	0.52	1.52
2	501599	Transcript	0	2.06	0.14	0.32	6.72	3.95	0.55	1.93	1.18	1.58	1.90	1.72	1.38	3.76	1.54	2.13	2.34	0.50	2.99	0.16	3.72	1.28	3.21	1.13	0.24	1.39	0.75	0.53	0.24	3.54
3	IG23_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.23
4	IG23_SR1	SilentIntergenicRegion	0	5.64	0.00	5.45	39.70	25.01	0.98	1.93	5.52	1.95	4.68	1.80	0.63	2.52	2.07	3.66	10.02	0.00	0.89	2.49	4.13	2.15	7.54	0.81	0.00	1.84	5.97	0.00	1.00	3.10
5	IG23_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	9.17	1.22	2.65	13.09	9.17	2.39	1.96	7.55	5.31	2.42	1.99	2.55	3.00	2.29	3.20	5.16	2.38	5.72	0.98	4.93	1.49	5.93	1.97	0.81	3.03	3.64	1.03	1.75	11.53
6	IG23_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	4.43	1.57	0.75	2.16	2.61	0.68	1.70	2.22	2.17	2.07	1.99	3.00	0.83	1.50	2.53	2.45	2.13	5.17	0.60	1.04	1.08	1.02	0.27	2.05	1.31	0.58	0.00	1.58	2.03
7	IG23_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	0.97	0.00	0.00	3.66	4.63	0.59	0.00	0.61	1.58	0.00	0.00	1.27	0.00	0.71	0.00	0.75	0.25	2.11	1.94	0.00	1.12	0.00	0.00	0.64	0.00	0.19	0.00	0.70	0.00
8	IG23_SR4	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	3.62	0.00	1.05	0.00	2.64	0.00	0.73	2.72	0.86	0.00	0.46	0.00	1.98	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	1.61	0.00
9	IG23_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.20	0.00	0.00	1.59	0.41	0.00	0.00	0.00	0.98	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1a	ExonRegion	0	1.67	0.00	0.44	3.77	0.00	0.72	1.06	0.97	2.07	1.52	2.82	1.95	1.37	0.83	0.00	0.00	0.39	2.62	0.84	0.00	1.50	0.47	0.00	0.57	0.41	0.00	0.00	0.86	1.41
11	E1_Da	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.61
12	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	I1	Intron	0	2.45	1.10	1.72	0.82	0.56	0.16	0.69	2.32	1.48	0.66	1.36	1.48	0.37	0.41	2.31	1.13	1.37	2.20	0.73	1.58	1.30	1.03	0.00	0.49	0.33	0.54	0.00	0.19	1.68
14	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	2.46	1.11	1.73	0.82	0.56	0.16	0.69	2.33	1.48	0.66	1.36	1.49	0.37	0.41	2.32	1.14	1.37	2.21	0.73	1.58	1.31	1.04	0.00	0.49	0.33	0.54	0.00	0.19	1.69
15	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	8.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.65	1.52	0.00	0.00	4.46	0.00	0.00	0.00	0.00	4.12	9.25	0.00	0.00	7.38	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER2a	ExonRegion	0	2.50	0.00	0.95	0.00	2.24	0.00	1.99	2.11	3.16	3.31	1.36	2.13	3.98	1.04	0.06	1.42	1.69	3.25	0.00	1.58	0.00	3.22	0.00	0.00	2.39	0.00	0.00	0.00	2.59
17	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	7.85	2.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.69	0.00	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	0.00	3.15	5.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.09
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.04	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
19	I2	Intron	0	3.59	1.85	0.59	10.33	3.42	1.23	0.47	2.43	4.06	2.08	1.02	3.17	1.24	1.99	3.40	2.86	1.39	4.53	0.50	2.24	1.50	0.84	0.07	2.01	0.83	1.16	0.21	1.65	2.76
20	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	1.26	3.60	0.00	4.20	2.86	0.81	0.00	0.72	1.75	1.97	0.47	3.13	1.52	1.33	2.70	0.48	2.04	3.95	0.62	1.46	1.67	0.00	0.00	0.84	0.56	1.23	0.00	0.64	1.70
21	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	1.58	0.00	1.25	0.00	7.22	1.02	0.00	0.00	3.32	2.13	0.00	3.66	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	4.27	0.00	0.00	3.16	0.00	0.00	4.77	2.11	0.00	0.00	3.61	0.00
22	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	4.28	1.50	0.78	15.06	2.92	1.20	0.71	2.43	3.02	1.75	1.25	2.44	1.44	2.60	3.01	4.38	0.32	3.90	0.37	1.84	1.83	1.47	0.00	1.15	0.75	2.05	0.00	2.04	2.67
23	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	5.78	0.88	0.81	15.46	3.07	2.12	0.33	4.23	6.78	2.71	1.46	4.39	1.84	3.28	4.46	4.72	3.02	7.55	0.26	4.96	1.09	0.73	0.29	2.78	1.05	0.47	0.89	1.89	4.37
24	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.99	2.84	0.44	5.10	5.19	0.73	1.07	3.17	6.13	2.30	1.08	3.30	0.08	0.23	5.37	1.13	1.05	2.71	1.27	0.97	0.86	1.20	0.00	3.69	0.76	0.83	0.00	1.34	3.27
25	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.17	2.44	3.78	1.48	0.00	1.14	0.00	2.02	8.37	0.00	1.40	9.25	8.09	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	1.70	0.00	0.00	2.29	0.00
26	ER3a	ExonRegion	0	2.43	0.00	0.03	10.01	5.37	0.36	3.98	0.19	0.21	3.00	2.47	0.85	6.63	3.08	5.60	4.73	0.05	5.31	0.00	8.88	2.29	5.36	2.38	0.00	2.82	0.74	0.00	0.00	5.26
27	E3_Da	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	1.73	2.23	0.00	6.06	3.20	0.00	1.60	0.00	0.00	7.57	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.07	3.43
28	E3a_E4a	KnownJunction	0	4.84	0.00	0.00	28.26	7.37	0.00	5.26	2.44	3.59	7.35	5.92	3.37	16.24	7.05	7.77	11.32	0.00	9.25	0.00	18.61	6.02	10.26	5.02	0.00	5.49	3.69	0.00	0.00	9.18
29	I3	Intron	0	0.76	0.57	0.30	5.08	1.73	1.22	0.36	2.77	5.06	2.17	0.74	3.71	0.92	1.04	1.23	0.76	1.59	3.47	0.28	1.22	0.88	0.64	0.48	1.90	0.76	0.00	0.00	2.89	4.27
30	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.76	0.57	0.30	5.10	1.74	1.22	0.36	2.78	5.08	2.18	0.74	3.72	0.92	1.04	1.23	0.76	1.59	3.48	0.28	1.22	0.88	0.64	0.48	1.91	0.76	0.00	0.00	2.90	4.28
31	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	7.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER4a	ExonRegion	0	5.71	0.00	0.84	18.43	11.08	3.44	1.89	4.72	4.64	1.09	2.14	3.85	5.58	1.40	4.80	3.33	1.55	6.18	0.00	3.73	1.34	9.01	1.90	1.12	1.14	2.17	4.77	0.83	10.93
33	E4_Da	NovelBoundary	0	12.98	4.46	10.66	86.06	93.73	3.15	5.21	10.50	12.79	0.00	4.27	11.72	7.74	6.89	0.00	0.00	8.82	0.00	0.00	21.01	0.00	13.76	3.94	7.90	14.06	10.64	0.00	6.96	68.87
34	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	I4	Intron	0	1.51	2.92	0.69	6.83	3.84	0.51	1.34	2.44	4.90	1.43	0.54	2.58	1.39	1.33	7.29	1.03	1.61	3.67	0.79	2.51	1.06	0.52	0.52	4.10	1.42	0.46	0.61	1.01	1.38
36	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	1.06	2.40	0.98	7.01	5.41	0.54	1.45	2.04	5.63	1.13	0.31	2.65	1.39	1.18	4.86	1.29	0.88	3.32	0.83	2.16	1.12	0.00	0.35	2.67	0.93	0.72	0.84	0.64	1.48
38	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.31	4.03	0.20	6.87	1.17	0.49	1.21	3.31	3.82	2.07	1.00	2.59	1.47	1.68	12.17	0.59	3.04	4.38	0.76	3.30	1.02	1.51	0.87	6.95	2.40	0.00	0.22	1.76	1.28
39	E5_Aa	NovelBoundary	0	44.83	116.73	45.44	105.04	102.72	100.68	39.82	10.10	37.06	53.25	67.03	58.25	28.05	64.76	26.11	65.02	90.94	93.88	48.55	106.68	105.29	16.24	31.52	55.99	32.88	12.87	23.56	12.76	49.42
40	ER5a	ExonRegion	0	1.40	1.29	0.67	0.01	3.43	0.41	0.40	0.18	0.56	0.80	0.77	0.31	0.07	0.47	0.94	0.25	0.82	0.29	0.64	0.69	0.35	0.54	0.90	0.43	0.21	0.16	0.00	0.49	0.40