Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC068580.3	Gene	0	9.71	2.52	6.04	0.69	3.59	3.72	1.03	0.67	5.76	3.32	2.31	6.50	5.03	11.56	0.74	3.59	1.62	5.23	2.79	2.33	5.02	10.61	5.24	11.10	12.68	7.36	8.53	0.45	9.30
2	340134	Transcript	0	2.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	2.55	0.00	0.00	0.75	0.00	1.68	0.60	0.00	1.25	3.91	0.00	0.61	0.00	10.45
3	382123	Transcript	0	7.26	0.00	0.00	0.00	3.24	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	1.96	0.00	3.08	0.00	1.91	0.00	0.00	0.00	3.68	0.00	3.35	1.26	2.45	5.21	0.90	3.50	0.00	7.03
4	486852	Transcript	0	2.65	0.18	0.51	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.98	0.46	0.00	0.64	0.39	1.59	4.40	0.01	0.00	0.52
5	482459	Transcript	0	2.40	0.09	2.75	0.00	3.69	0.26	0.07	0.00	0.10	0.14	0.03	2.03	2.47	3.69	0.13	0.06	0.17	5.12	0.45	0.00	2.04	2.44	1.02	5.28	1.62	1.62	4.94	0.14	1.85
6	ER1a	ExonRegion	0	2.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	2.11	0.00	0.00	1.51	0.00	1.31	1.20	0.00	2.51	2.98	0.00	1.22	0.00	2.01
7	ER1b	ExonRegion	0	14.02	2.02	1.57	0.00	0.00	0.94	0.00	0.00	0.52	0.00	0.27	0.26	0.00	3.28	0.00	6.11	1.03	1.41	2.87	1.55	3.05	1.60	0.83	10.78	14.80	1.45	5.64	0.00	16.97
8	E1_Da	NovelBoundary	0	7.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	2.33	0.00	3.60	1.40	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	11.13	13.94	0.00	0.00	0.00	14.00
9	E1a_E2b	KnownJunction	0	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.79	0.00	2.53	0.00	3.57
10	E1a_E2d	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.98	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	18.88
11	Ix	Intron	0	3.49	0.00	0.29	0.32	0.00	0.61	0.18	0.00	0.22	0.13	0.00	0.81	0.00	1.40	0.00	1.25	0.53	0.68	1.27	0.24	0.57	0.24	0.00	7.29	3.78	0.76	0.40	0.00	4.78
12	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	4.55	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.50	0.43	0.00	0.76	0.00	1.08	0.00	0.74	0.00	0.00	1.91	0.00	1.28	0.00	0.00	7.72	3.87	0.47	0.00	0.00	5.14
13	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.48	0.00	0.57	0.00	0.00	1.26	0.45	0.00	0.19	0.17	0.00	1.68	0.00	1.75	0.00	2.26	0.98	0.22	2.56	0.32	0.65	0.21	0.00	8.99	6.26	1.29	0.74	0.00	8.33
14	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.18	0.00	0.00	0.68	0.00	0.26	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	0.12	0.00	1.20	0.00	0.58	0.32	1.27	0.00	0.26	0.27	0.34	0.00	5.77	1.71	0.42	0.26	0.00	1.73
15	E2_Aa	NovelBoundary	0	10.68	0.00	0.00	0.00	12.97	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	1.23	0.00	6.49	0.00	0.00	0.00	13.87	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	7.72	1.93	2.15	0.00	0.00	7.23
16	ER2a	ExonRegion	0	5.30	0.36	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	1.95	0.91	0.00	1.28	0.78	3.18	2.23	0.03	0.00	1.04
17	E2_Ab	KnownBoundary	0	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	3.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	3.60	0.00	0.00	0.00	1.91
18	E2_Ac	KnownBoundary	0	3.01	4.85	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00	3.52	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	2.38	0.00	8.73	0.00	0.00	0.00	0.00	2.77
19	ER2b	ExonRegion	0	6.88	3.28	0.56	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.20	0.00	2.74	0.00	1.59	0.00	0.00	1.13	0.00	0.53	8.51	5.18	0.46	1.83	0.00	4.36
20	ER2c	ExonRegion	0	14.10	0.71	6.61	0.00	1.98	2.72	0.95	0.00	1.33	1.70	0.00	1.49	0.77	6.45	0.00	3.66	0.00	5.89	1.80	3.22	2.39	5.32	4.73	10.00	3.65	5.72	5.83	0.00	8.54
21	E2_Da	KnownBoundary	0	5.66	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	2.46	0.00	0.00	3.95	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E2a_E2d	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.57	0.00	0.00	0.00
23	E2_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	1.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E2b_E2d	KnownJunction	0	11.80	0.00	0.00	0.00	6.48	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	3.92	0.00	5.03	0.00	3.82	0.00	0.00	0.00	7.36	0.00	6.71	2.51	4.90	6.63	1.80	4.47	0.00	10.50
25	ER2d	ExonRegion	0	18.76	0.00	1.40	0.00	4.98	1.37	2.02	0.00	0.00	4.33	0.00	4.95	0.65	5.44	0.00	4.43	0.00	2.73	3.39	5.62	0.00	4.96	1.81	6.45	5.72	4.71	5.49	0.00	10.40
26	ER2e	ExonRegion	0	1.92	0.18	0.89	0.00	0.01	0.53	0.13	0.00	0.20	0.27	0.07	0.69	0.36	1.17	0.26	0.11	0.34	0.99	0.91	0.01	0.34	0.21	0.21	2.12	1.64	1.26	0.63	0.28	0.90
27	E2_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	ER2f	ExonRegion	0	11.28	2.36	6.74	0.00	6.38	0.38	0.54	0.00	1.70	0.31	0.11	1.64	0.74	3.98	2.49	1.82	0.02	3.64	0.45	2.16	2.99	1.43	3.22	5.57	5.46	3.43	3.23	0.00	12.31
29	E2_Dc	KnownBoundary	0	5.43	0.00	14.75	0.00	14.59	0.00	0.00	0.00	8.31	4.95	1.52	7.68	12.16	14.09	0.00	3.44	0.00	4.75	8.09	0.00	6.02	4.28	11.23	8.19	9.85	17.81	11.48	2.29	21.10
30	ER2g	ExonRegion	0	20.47	5.62	22.53	0.00	8.38	8.87	2.54	0.54	12.53	10.82	8.40	29.71	19.85	22.92	1.62	11.95	5.05	8.68	7.48	4.61	13.81	16.91	18.40	19.42	24.91	26.95	39.50	1.44	26.01
31	E2_Dd	KnownBoundary	0	42.65	18.71	13.70	0.00	7.37	9.90	11.67	0.00	45.68	32.24	22.90	44.64	42.80	52.91	0.00	15.30	8.85	9.25	32.37	8.27	26.35	45.17	40.58	30.63	35.73	51.88	15.65	0.00	65.43
32	E2d_E3a	KnownJunction	0	2.89	0.00	4.61	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.37	4.59	6.20	0.00	0.00	0.00	9.25	0.00	0.00	3.73	4.67	1.82	8.43	1.59	1.97	9.24	0.00	2.81
33	ER2h	ExonRegion	0	52.66	18.80	21.44	6.18	9.46	29.13	7.64	2.31	34.70	16.96	12.27	38.69	26.70	58.30	0.50	19.80	8.83	27.35	17.10	9.24	27.83	47.63	23.43	53.13	75.63	29.30	19.37	0.45	53.18
34	E2e_E3a	KnownJunction	0	79.16	17.84	29.15	18.55	28.15	25.94	5.09	4.98	32.98	27.12	15.60	40.24	26.56	86.57	0.00	57.45	12.76	24.66	16.18	26.38	42.60	83.72	32.90	101.75	70.35	44.46	42.39	2.29	41.23
35	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.95	0.33	1.16	0.00	0.00	0.00	1.98	0.00	0.00	0.86	0.23	0.23	1.93	0.59	0.20	0.47	0.21	0.17
36	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.63	1.18	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.45	1.11	0.00	0.49	0.15	1.33	0.31	0.00	0.84	0.00	0.00	1.91	1.13	0.46	0.00	0.00	2.10
37	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.73	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01
38	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.76	0.74	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	5.00	0.00	1.95	0.00	0.00	1.16
39	I2_AR5	ActiveIntronRegion	0	2.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.93	0.00	3.14	0.00	0.00	0.00
40	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	1.77	0.12	0.13	0.27	0.00	1.09	0.00	0.14	0.44	0.38	0.18	0.84	0.41	2.40	0.21	0.84	1.15	1.53	0.60	0.28	1.34	0.07	0.14	5.75	2.64	0.63	0.41	0.43	1.91
41	E3_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER3a	ExonRegion	0	67.78	20.06	35.29	4.18	23.42	30.10	10.50	4.70	38.61	27.34	21.76	53.05	38.23	94.91	3.46	27.39	11.52	39.43	21.88	13.37	36.50	83.73	42.60	80.07	95.71	49.72	58.60	1.82	59.66
43	E3_Da	KnownBoundary	0	55.80	23.75	59.00	0.00	28.30	7.56	7.84	5.08	30.09	29.48	16.39	34.43	13.50	92.35	0.00	19.81	4.14	32.36	24.28	15.22	29.64	89.31	35.66	82.19	97.67	12.70	63.46	4.27	37.37
44	ER3b	ExonRegion	0	5.24	1.36	4.44	0.65	3.00	2.14	0.44	0.67	4.69	2.18	1.29	3.51	3.36	7.95	0.64	1.83	1.09	3.59	1.45	1.95	3.33	8.59	3.23	7.53	7.95	5.11	5.90	0.44	5.14