Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-142M10.1	Gene	0	1.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	9.06	3.11	0.00	0.32	0.00	0.35	1.01	0.98	3.43	0.80	0.17	0.29	0.00	0.77	0.32	0.00	0.00	2.30	2.53	0.16	0.29	0.30
2	446193	Transcript	0	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	3.36	1.30	0.00	0.11	0.00	0.22	0.34	0.33	1.15	0.31	0.11	0.10	0.00	0.56	0.21	0.00	0.00	0.85	1.70	0.05	0.10	0.10
3	ER1a	ExonRegion	0	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	2.73	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.43	0.55	0.00	0.00	0.85	1.03	0.00	0.00	0.82	1.48	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	1.60	2.48	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	2.05
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	0.41	0.20	0.02	0.00	0.09	0.27	0.00	2.03	2.24	0.29	0.20	0.01	0.17	0.35	1.53	0.68	1.53	0.09	0.27	0.03	0.68	0.50	0.09	0.76	2.37	5.47	0.47	0.11	0.38
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.48	1.42	0.37	0.00	0.00	0.91	0.00	4.06	2.86	0.32	0.00	0.00	0.00	0.40	0.00	0.00	4.67	0.00	1.41	0.00	0.31	2.01	0.40	1.90	5.69	15.27	1.21	0.00	0.30
8	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.82	2.53	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	2.80	1.27	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85	0.00	0.00	4.33	1.60	1.87	0.00	0.00
9	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.26	0.29	0.00	0.00	0.30	0.42	0.00	3.18	3.84	0.45	0.51	0.00	0.16	0.48	4.31	0.92	2.21	0.00	0.39	0.00	0.88	0.89	0.00	1.20	2.74	5.73	0.79	0.00	0.86
10	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.24	0.00	0.00	0.00	0.55	0.31	0.00	2.71	3.11	0.49	0.00	0.00	0.00	0.77	4.90	3.22	4.91	0.00	0.00	0.00	0.65	0.82	0.00	1.46	5.83	8.02	0.83	0.00	0.83
11	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.68	1.01	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.63	0.80	0.68	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	1.43	6.29	0.00	0.00	0.00
12	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.45	3.88	1.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	1.00	0.00	0.00	0.00	2.85	0.00	1.53	0.00	1.86	2.29	0.28	0.00	0.00
13	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.67	6.27	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	0.80	0.58	1.37	2.63	1.62	0.00	0.00
14	Ix_SR5	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	1.84	5.69	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	2.15	3.48	8.55	0.00	0.00	0.00
15	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	1.54	3.20	0.45	0.13	0.00	0.42	0.22	0.37	0.00	1.06	0.16	0.00	0.00	0.88	0.15	0.29	0.42	1.20	5.27	0.00	0.26	0.54
16	Ix_SR6	SilentIntronRegion	0	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	0.00	2.49	2.49	0.30	0.30	0.12	0.37	0.35	0.45	0.96	1.47	0.00	0.31	0.00	1.79	0.70	0.00	0.21	2.13	2.93	0.89	0.16	0.13
17	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29	0.00	0.00	0.00	0.03	4.17	0.00	0.00	0.00
19	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	2.44	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.05	0.00	0.00	1.95
20	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	Ix	Intron	0	1.66	0.06	0.10	0.00	0.00	0.08	0.28	2.89	1.63	0.17	0.29	0.17	0.00	0.42	1.00	1.34	0.92	0.00	0.00	0.00	0.68	0.36	0.07	0.38	1.62	4.28	0.00	0.06	0.25
22	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.48	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.20	3.07	0.99	0.29	0.00	0.12	0.00	0.46	1.28	0.29	0.74	0.00	0.00	0.00	0.33	0.17	0.29	0.85	0.47	4.56	0.00	0.00	0.40
23	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	2.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	3.59	0.92	0.17	0.14	0.00	0.00	0.37	0.00	2.47	0.52	0.00	0.00	0.00	0.50	0.00	0.00	0.25	1.17	2.71	0.00	0.00	0.47
24	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.77	0.43	0.00	0.91	0.00	0.00	0.35	4.21	4.49	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.82	1.64	0.60	0.00	0.00	0.00
25	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	7.27	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.38	0.00	0.00	1.75	0.00
26	ER3a	ExonRegion	0	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	14.64	3.78	0.00	0.54	0.00	0.00	1.70	1.65	5.75	1.12	0.00	0.48	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00	3.43	2.83	0.27	0.49	0.50