Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-414K1.1	Gene	0	1.63	1.27	0.09	35.90	53.71	0.93	0.79	0.78	2.08	1.54	0.23	0.17	0.60	0.55	4.13	0.75	1.34	58.03	1.08	0.75	1.04	0.97	2.65	8.23	2.01	2.30	0.62	1.83	0.55
2	457649	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	451225	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	377597	Transcript	0	0.47	0.35	0.03	38.97	42.47	0.26	0.20	0.21	0.58	0.40	0.06	0.05	0.17	0.15	1.14	0.21	0.37	93.25	0.30	0.21	0.29	0.27	4.22	9.87	0.62	0.64	0.17	0.61	0.15
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	118.52	136.69	0.00	1.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	109.70	0.00	0.00	0.00	0.00	5.89	18.68	0.70	0.00	0.00	1.57	0.00
6	E1a_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	115.61	109.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	185.97	0.00	0.00	0.00	0.00	7.04	10.83	3.86	0.00	0.00	4.04	0.00
7	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	23.77	23.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	30.02	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	2.69	0.71	0.00	0.00	0.82	0.00
8	ER2b	ExonRegion	0	1.42	0.00	0.00	93.68	38.64	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	195.61	0.00	0.00	0.00	0.00	4.96	24.71	4.11	0.00	0.00	1.59	0.00
9	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	43.14	25.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	359.86	0.00	0.00	0.00	0.00	8.91	65.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E2a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E2b_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	77.86	33.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	126.63	0.00	0.00	0.00	0.00	9.06	10.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E2b_E3b	NovelJunction	0	2.42	0.00	0.00	47.24	54.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	334.18	0.00	0.00	0.00	0.00	18.12	31.58	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00
14	ER2c	ExonRegion	0	0.19	0.00	0.00	55.64	23.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	240.40	0.00	0.00	0.00	0.00	9.28	31.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	Ix	Intron	0	0.00	0.25	0.00	6.84	2.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	17.37	0.00	0.00	0.05	0.00	0.40	1.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.25	0.00	6.85	2.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	17.38	0.00	0.00	0.05	0.00	0.40	1.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00
17	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	8.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	27.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	30.55	54.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	119.88	0.00	0.00	0.00	0.00	8.63	20.68	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	42.49	103.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	47.01	0.00	0.00	0.00	0.00	6.35	15.61	3.86	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	28.16	61.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	90.50	0.00	0.00	0.00	0.00	5.45	11.11	0.33	0.00	0.00	0.92	0.00
21	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	9.06	82.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	33.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER3c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	39.35	27.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	46.92	0.00	0.00	0.00	0.00	1.59	3.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E3_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	29.33	57.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	18.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	2.66	8.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	16.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.67	8.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	16.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	14.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	27.74	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	5.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	ER4a	ExonRegion	0	2.17	1.75	0.13	28.51	49.68	1.29	1.02	1.07	2.88	2.02	0.32	0.24	0.83	0.76	5.72	1.03	1.86	35.26	1.49	1.04	1.44	1.34	1.41	5.10	2.39	3.18	0.85	2.22	0.76