Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	MUSK	Gene	0	0.07	0.00	0.22	0.13	0.10	0.68	0.36
2	374440	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0
3	374441	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.07
4	374448	Transcript	0	0.00	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	0.00
5	189978	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0
6	374447	Transcript	0	0.00	0.00	0.26	0.00	0.30	0.00	0.00
7	374439	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60
8	374438	Transcript	0	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.91	0.51
9	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.75	0.00
10	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.75	0.00	0.73	0.00
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER3a	ExonRegion	0	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.48
14	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER3b	ExonRegion	0	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.72	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.28	0.00	0.32	1.46	0.00
18	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.79	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	1.97	0.36
20	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E5a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E5a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39
24	E6_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72
25	ER6b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60
26	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00
27	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.68	0.00	0.65	0.00	0.00
28	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00
29	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER9a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.58	0.38
31	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E9a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E9b_E11b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.79
34	ER9b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35
35	E10a_E12c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	ER11a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03
38	ER11b	ExonRegion	0	0.05	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.32
39	E11a_E12b	KnownJunction	0	0.78	0.00	0.63	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER12a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.12	0.00	0.19	1.26	0.58
41	E12_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	E12_Ac	KnownBoundary	0	0.58	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.00
43	ER12b	ExonRegion	0	0.77	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00
44	ER12c	ExonRegion	0	0.30	0.00	0.42	0.01	0.12	0.00	0.00
45	E12a_E13a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.86	0.00	0.00	0.00	0.00
46	E12a_E14a	KnownJunction	0	0.68	0.00	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00
47	E12a_E15a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	E13a_E14a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	ER13a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00
50	ER14a	ExonRegion	0	0.25	0.00	1.04	1.39	0.18	2.31	0.51
51	E14a_E15a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00
52	ER15a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.54	0.00	0.34	0.00	0.00
53	E15a_E16a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
54	ER16a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.69	0.64	0.28	0.13	0.34
55	E16_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00
56	E16a_E17a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	ER16b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	0.31
58	E16_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89
59	ER16c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.55	0.44
60	ER17a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.54	0.67