Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 LY6G6E Gene 0 0.16 0.92 0.14 0.60 0.04 2.87 0.00 2 409239 Transcript 0 0.37 0.54 0.17 0.55 0.04 1.22 0.00 3 399142 Transcript 0 0.00 0.66 0.00 0.12 0.00 1.89 0.00 4 375821 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.76 0.00 5 375822 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 0.73 0.00 7 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 0.03 1.70 0.00 0.00 0.00 4.91 0.00 11 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 2.99 0.00 1.46 0.00 1.42 0.00 12 E2a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.76 0.00 13 E2a_E2c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2a_E3a KnownJunction 0 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 15 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.66 0.00 0.12 0.00 1.89 0.00 16 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2_Ac KnownBoundary 0 0.00 1.42 0.00 1.63 0.00 5.55 0.00 18 ER2c ExonRegion 0 0.00 1.21 0.00 1.25 0.00 8.58 0.00 19 ER2d ExonRegion 0 0.00 0.78 0.00 0.29 0.00 7.31 0.00 20 ER2e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 9.17 0.00 22 ER3a ExonRegion 0 0.50 1.61 0.30 1.64 0.12 1.55 0.00