Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 WFDC3 Gene 0 15.72 9.35 1.11 1.18 0.22 1.32 2.51 2 337230 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 243938 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 4 337205 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 5 372630 Transcript 0 0.62 1.33 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 6 372632 Transcript 0 1.03 0.00 0.00 1.63 0.00 0.00 0.00 7 339259 Transcript 0 1.41 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.68 8 ER1a ExonRegion 0 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 9 E1a_E2c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 1.24 1.21 0.00 0.00 0.00 0.53 0.00 11 ER2b ExonRegion 0 2.27 0.89 1.51 3.12 0.75 1.19 0.82 12 E2_Ac KnownBoundary 0 0.67 0.00 2.37 5.45 0.00 0.00 1.78 13 ER2c ExonRegion 0 1.89 1.73 0.59 1.67 0.36 0.00 0.53 14 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 3.31 0.00 0.00 0.00 15 E2a_E6a KnownJunction 0 0.00 1.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER3a ExonRegion 0 0.42 0.75 0.22 3.55 0.00 0.72 1.26 17 E3_Ab KnownBoundary 0 0.85 0.00 0.00 2.76 0.00 1.66 1.55 18 ER3b ExonRegion 0 1.23 2.43 0.68 2.57 0.00 1.23 0.85 19 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 2.84 0.76 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER3c ExonRegion 0 2.31 2.43 0.68 2.49 0.00 0.61 0.00 21 E3b_E4a KnownJunction 0 2.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E3b_E6a KnownJunction 0 1.03 0.00 0.00 1.63 0.00 0.00 0.00 23 ER3d ExonRegion 0 2.72 1.38 0.36 1.75 0.00 0.00 0.00 24 ER4a ExonRegion 0 4.54 0.26 0.35 0.64 0.28 0.00 3.33 25 E4a_E5a KnownJunction 0 0.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E4a_E6a KnownJunction 0 2.82 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 27 I4_AR3 ActiveIntronRegion 0 22.93 12.07 1.60 5.55 0.00 1.18 1.35 28 ER5a ExonRegion 0 4.12 5.89 0.38 0.00 0.00 0.00 0.76 29 E5a_E6a KnownJunction 0 5.32 6.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER6a ExonRegion 0 64.10 31.36 3.48 1.27 0.48 4.36 7.67 31 E6a_E8a KnownJunction 0 66.34 19.18 1.09 1.06 0.92 5.31 5.49 32 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER8a ExonRegion 0 16.68 14.61 1.25 1.16 0.15 2.10 2.34 34 ER8b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 I8_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.07 0.59 0.13 0.48 14.33 0.00 0.28 36 I8_SR3 SilentIntronRegion 0 0.17 1.12 0.16 0.00 15.33 0.00 0.16 37 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00