Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 PTPN22 Gene 0 1.59 1.48 0.38 0.37 0.07 0.64 1.23 2 354605 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 3 359785 Transcript 0 0.30 2.57 0.55 0.17 0.00 0.79 1.84 4 307489 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.50 0.00 0.27 0.00 0.88 1.11 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 1.53 2.26 7 ER2a ExonRegion 0 0.49 0.00 0.94 1.20 0.00 1.68 1.60 8 E2a_E3a KnownJunction 0 0.83 0.00 0.00 1.08 0.00 2.44 0.72 9 ER3a ExonRegion 0 0.57 1.40 0.00 1.36 0.00 0.46 1.17 10 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 2.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER4a ExonRegion 0 0.00 1.27 0.00 0.01 0.00 0.00 0.62 12 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.53 13 ER5a ExonRegion 0 0.00 2.37 0.00 0.00 0.00 0.00 2.23 14 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 15 E5a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.57 16 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 2.78 17 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 1.55 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 18 ER7a ExonRegion 0 1.09 2.15 0.00 0.00 0.00 0.00 2.14 19 E7a_E8a KnownJunction 0 2.02 2.84 0.00 0.00 0.00 1.39 2.62 20 E7a_E20a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER8a ExonRegion 0 1.13 1.38 0.36 0.66 0.00 0.00 1.28 22 E8a_E9a KnownJunction 0 4.09 2.68 0.00 0.00 0.00 1.02 0.62 23 ER9a ExonRegion 0 1.80 3.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.48 24 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.89 25 ER10a ExonRegion 0 0.61 0.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.87 26 E10a_E11a KnownJunction 0 1.84 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 27 ER11a ExonRegion 0 1.23 0.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 28 E11a_E12a KnownJunction 0 0.97 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER12a ExonRegion 0 2.03 0.69 0.00 2.30 0.00 0.73 0.49 30 E12a_E13a KnownJunction 0 5.44 0.00 0.00 3.39 0.00 1.63 1.49 31 ER13a ExonRegion 0 3.90 2.14 0.24 0.36 0.10 1.30 1.55 32 E13a_E14a KnownJunction 0 2.09 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 2.67 33 ER14a ExonRegion 0 0.99 2.17 0.10 0.00 0.00 3.33 0.94 34 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.66 0.00 35 ER15a ExonRegion 0 0.00 4.07 0.39 0.00 0.00 0.43 0.96 36 E15a_E16a KnownJunction 0 0.00 1.55 0.00 0.00 0.00 1.63 1.56 37 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 1.42 0.69 0.00 0.00 0.00 1.43 38 ER16a ExonRegion 0 0.00 2.60 0.44 0.00 0.00 1.23 1.98 39 ER16b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 40 ER17a ExonRegion 0 0.00 3.70 1.12 1.15 0.00 0.86 1.84 41 E17a_E18a KnownJunction 0 0.00 4.23 0.00 0.00 0.00 1.34 2.35 42 ER18a ExonRegion 0 0.34 2.04 0.75 0.01 0.00 0.51 4.11 43 E18a_E19a KnownJunction 0 0.00 2.76 0.76 0.00 0.00 1.61 1.72 44 E19a_E20a KnownJunction 0 1.02 1.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 ER19a ExonRegion 0 0.74 2.47 0.52 0.00 0.00 1.23 1.39 46 ER20a ExonRegion 0 0.88 1.59 0.24 0.00 0.53 0.25 2.05 47 E20a_E21a KnownJunction 0 1.75 1.63 0.85 0.00 0.00 0.00 3.34 48 ER21a ExonRegion 0 1.39 0.76 0.65 0.33 0.11 0.24 0.68