Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	AC068338.14	Gene	0	0.03	0.12	0.12	0.09	1.27	0.38	0.05
2	300576	Transcript	0	0.02	0.14	0.12	0.14	1.44	0.53	0.03
3	379675	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.69	0.58	0.00
7	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.43	0.00	1.32	1.50	0.00
9	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.18	2.95	0.00
10	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.90	0.00	0.00	1.33	1.92	0.00
11	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER5a	ExonRegion	0	0.00	1.12	0.64	0.00	7.10	2.28	0.00
13	E5_Da	NovelBoundary	0	8.86	7.30	8.55	10.78	0.00	6.83	0.72
14	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	3.14	11.99	3.32	0.00
15	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	5.18	1.02	0.00
16	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.91	0.00
18	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.09	0.60	3.34	1.03	0.00
20	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER9a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.41	1.27	2.18	0.00	0.00
22	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.40	0.39	0.00	0.38	0.39	0.00
24	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	1.58	0.80	0.00	2.26	1.58	0.00
25	ER11a	ExonRegion	0	0.72	0.97	0.95	0.00	2.17	0.98	0.00
26	E11_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER11b	ExonRegion	0	0.18	1.05	0.13	0.00	0.44	0.69	0.00
28	E11_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E11a_E11c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER11c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.34	0.00	0.83	0.22	0.35
31	E11_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER11d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00
33	E11_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E11b_E11d	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	ER11e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00
36	E11_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	ER11f	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	E11c_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	ER12a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00	0.00
40	E12_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	E12a_E13a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.21	0.00	0.00
42	ER12b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	ER13a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.50	0.00	0.47
44	E13a_E14a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	ER14a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17
46	E14a_E15a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
47	ER15a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00
48	E15a_E16a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	ER16a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00
50	E16a_E17a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
51	ER17a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00
52	E17a_E18a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
53	ER18a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.65	0.00	0.00