Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	AL589743.4	Gene	0	1.01	0.13	5.00	1.69	0.00	1.99	0.00
2	400192	Transcript	0	1.47	0.23	5.82	1.90	0.00	2.67	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	4.53	1.03	13.50	4.43	0.00	4.39	0.00
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	ER2a	ExonRegion	0	2.46	0.40	9.38	4.74	0.00	6.81	0.00
6	E2a_E3a	KnownJunction	0	9.71	1.63	28.65	8.86	0.00	16.62	0.00
7	E3_Aa	NovelBoundary	0	3.62	0.00	13.84	1.35	0.00	2.89	0.00
8	ER3a	ExonRegion	0	3.98	0.32	20.37	7.55	0.00	7.54	0.00
9	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER4a	ExonRegion	0	1.32	0.00	15.42	2.89	0.00	4.70	0.00
11	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
13	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	I6_AR9	ActiveIntronRegion	0	1.00	0.31	11.72	0.00	2.41	1.40	0.00
17	I6_AR10	ActiveIntronRegion	0	2.58	1.21	14.34	0.07	2.24	2.74	0.00
18	I6_AR11	ActiveIntronRegion	0	2.90	1.21	14.60	1.25	0.72	3.68	0.00
19	I6_AR12	ActiveIntronRegion	0	1.66	1.21	15.13	1.25	0.00	3.68	0.00
20	I6_SR6	SilentIntronRegion	0	0.68	0.00	9.40	0.78	0.00	0.78	1.67
21	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00